RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 PRM1P04553 51 aa4.55□□□□□ -1.68
CTIF-202ENST00000382998 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.52□□□□□ -1.69
CTIF-202ENST00000382998 USH2AO75445 5202 aa4.5□□□□□ -1.69
CTIF-202ENST00000382998 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CTIF-202ENST00000382998 MT1GP13640 62 aa4.47□□□□□ -1.69
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.45□□□□□ -1.7
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.43□□□□□ -1.7
CTIF-202ENST00000382998 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.43□□□□□ -1.7
CTIF-202ENST00000382998 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.4□□□□□ -1.7
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.39□□□□□ -1.71
CTIF-202ENST00000382998 LCE3BQ5TA77 95 aa4.39□□□□□ -1.71
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.38□□□□□ -1.71
CTIF-202ENST00000382998 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.37□□□□□ -1.71
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.36□□□□□ -1.71
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.36□□□□□ -1.71
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.36□□□□□ -1.71
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
CTIF-202ENST00000382998 MT1EP04732 61 aa4.34□□□□□ -1.72
CTIF-202ENST00000382998 LCE1EQ5T753 118 aa4.3□□□□□ -1.72
CTIF-202ENST00000382998 KMT2DO14686 5537 aa4.29□□□□□ -1.72
CTIF-202ENST00000382998 MT1LQ93083 61 aa4.29□□□□□ -1.72
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.23□□□□□ -1.73
CTIF-202ENST00000382998 MT4P47944 62 aa4.21□□□□□ -1.74
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.21□□□□□ -1.74
CTIF-202ENST00000382998 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
CTIF-202ENST00000382998 MT1MQ8N339 61 aa4.2□□□□□ -1.74
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.18□□□□□ -1.74
CTIF-202ENST00000382998 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.17□□□□□ -1.74
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.16□□□□□ -1.74
CTIF-202ENST00000382998 SSPOA2VEC9 5147 aa4.16□□□□□ -1.74
CTIF-202ENST00000382998 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
CTIF-202ENST00000382998 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.74
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.13□□□□□ -1.75
CTIF-202ENST00000382998 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.13□□□□□ -1.75
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.09□□□□□ -1.76
CTIF-202ENST00000382998 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.99□□□□□ -1.77
CTIF-202ENST00000382998 LCE1DQ5T752 114 aa3.99□□□□□ -1.77
CTIF-202ENST00000382998 LCE1FQ5T754 118 aa3.98□□□□□ -1.77
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.92□□□□□ -1.78
CTIF-202ENST00000382998 MDN1Q9NU22 5596 aa3.89□□□□□ -1.79
CTIF-202ENST00000382998 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.88□□□□□ -1.79
CTIF-202ENST00000382998 NEBP20929 6669 aa3.83□□□□□ -1.8
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.81□□□□□ -1.8
CTIF-202ENST00000382998 MT1AP04731 61 aa3.76□□□□□ -1.81
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP5-9P26371 169 aa3.72□□□□□ -1.81
CTIF-202ENST00000382998 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.69□□□□□ -1.82
CTIF-202ENST00000382998 LCE4AQ5TA78 99 aa3.68□□□□□ -1.82
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.65□□□□□ -1.82
CTIF-202ENST00000382998 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.56□□□□□ -1.84
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.53□□□□□ -1.84
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.43□□□□□ -1.86
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.32□□□□□ -1.88
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.26□□□□□ -1.89
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.16□□□□□ -1.9
CTIF-202ENST00000382998 LCE1CQ5T751 118 aa3.07□□□□□ -1.92
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.03□□□□□ -1.92
CTIF-202ENST00000382998 MUC5ACP98088 5654 aa3.03□□□□□ -1.93
CTIF-202ENST00000382998 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.95□□□□□ -1.94
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.94□□□□□ -1.94
CTIF-202ENST00000382998 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.88□□□□□ -1.95
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.82□□□□□ -1.96
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.82□□□□□ -1.96
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.67□□□□□ -1.98
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP5-8O75690 187 aa2.66□□□□□ -1.98
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.53□□□□□ -2
CTIF-202ENST00000382998 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.36□□□□□ -2.03
CTIF-202ENST00000382998 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.3□□□□□ -2.04
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.28□□□□□ -2.04
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.22□□□□□ -2.05
CTIF-202ENST00000382998 PHGR1C9JFL3 82 aa2.16□□□□□ -2.06
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.11□□□□□ -2.07
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.1□□□□□ -2.07
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.97□□□□□ -2.09
CTIF-202ENST00000382998 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms