RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375429.7

NELFE-202, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NELFE, Length 1,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-202ENST00000375429 SPRR2AP35326 72 aa7.52□□□□□ -1.21
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP12-3P60328 96 aa7.52□□□□□ -1.21
NELFE-202ENST00000375429 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.52□□□□□ -1.21
NELFE-202ENST00000375429 PRAC1Q96KF2 57 aa7.41□□□□□ -1.22
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.39□□□□□ -1.23
NELFE-202ENST00000375429 MT1LQ93083 61 aa7.37□□□□□ -1.23
NELFE-202ENST00000375429 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.33□□□□□ -1.24
NELFE-202ENST00000375429 MT1GP13640 62 aa7.29□□□□□ -1.24
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.25□□□□□ -1.25
NELFE-202ENST00000375429 SPRR2DP22532 72 aa7.25□□□□□ -1.25
NELFE-202ENST00000375429 MT1MQ8N339 61 aa7.19□□□□□ -1.26
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-202ENST00000375429 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-202ENST00000375429 LCE3BQ5TA77 95 aa7.01□□□□□ -1.29
NELFE-202ENST00000375429 LCE3CQ5T5A8 94 aa7□□□□□ -1.29
NELFE-202ENST00000375429 H3BS24 57 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.86□□□□□ -1.31
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.86□□□□□ -1.31
NELFE-202ENST00000375429 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.83□□□□□ -1.32
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.83□□□□□ -1.32
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.36
NELFE-202ENST00000375429 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFE-202ENST00000375429 LCE4AQ5TA78 99 aa6.44□□□□□ -1.38
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-202ENST00000375429 MT4P47944 62 aa6.31□□□□□ -1.4
NELFE-202ENST00000375429 LCE1DQ5T752 114 aa6.29□□□□□ -1.4
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.29□□□□□ -1.4
NELFE-202ENST00000375429 MT1AP04731 61 aa6.27□□□□□ -1.41
NELFE-202ENST00000375429 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.23□□□□□ -1.41
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP12-4P60329 112 aa6.17□□□□□ -1.42
NELFE-202ENST00000375429 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.13□□□□□ -1.43
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NELFE-202ENST00000375429 NDUFAF8A1L188 74 aa6.1□□□□□ -1.43
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.06□□□□□ -1.44
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.01□□□□□ -1.45
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.97□□□□□ -1.45
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.87□□□□□ -1.47
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.81□□□□□ -1.48
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.78□□□□□ -1.48
NELFE-202ENST00000375429 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.7□□□□□ -1.5
NELFE-202ENST00000375429 MT3P25713 68 aa5.7□□□□□ -1.5
NELFE-202ENST00000375429 A0A0A0MQY5 61 aa5.63□□□□□ -1.51
NELFE-202ENST00000375429 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.51□□□□□ -1.53
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.49□□□□□ -1.53
NELFE-202ENST00000375429 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.43□□□□□ -1.54
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.39□□□□□ -1.55
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.33□□□□□ -1.56
NELFE-202ENST00000375429 INE1O15225 51 aa5.2□□□□□ -1.58
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP5-8O75690 187 aa5.19□□□□□ -1.58
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.17□□□□□ -1.58
NELFE-202ENST00000375429 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.17□□□□□ -1.58
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.08□□□□□ -1.6
NELFE-202ENST00000375429 LCE1EQ5T753 118 aa5.07□□□□□ -1.6
NELFE-202ENST00000375429 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.98□□□□□ -1.61
NELFE-202ENST00000375429 MUC5ACP98088 5654 aa4.88□□□□□ -1.63
NELFE-202ENST00000375429 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.75□□□□□ -1.65
NELFE-202ENST00000375429 LCE1CQ5T751 118 aa4.71□□□□□ -1.66
NELFE-202ENST00000375429 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
NELFE-202ENST00000375429 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.2□□□□□ -1.74
NELFE-202ENST00000375429 PRM1P04553 51 aa4.12□□□□□ -1.75
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.1□□□□□ -1.75
NELFE-202ENST00000375429 LCE1FQ5T754 118 aa3.92□□□□□ -1.78
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.68□□□□□ -1.82
NELFE-202ENST00000375429 PHGR1C9JFL3 82 aa3.62□□□□□ -1.83
NELFE-202ENST00000375429 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.29□□□□□ -1.88
NELFE-202ENST00000375429 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFE-202ENST00000375429 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.37□□□□□ -2.03
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