RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 SSPOA2VEC9 5147 aa3.92□□□□□ -1.78
RPRD1B-201ENST00000373433 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.89□□□□□ -1.79
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.86□□□□□ -1.79
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.86□□□□□ -1.79
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.86□□□□□ -1.79
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.85□□□□□ -1.79
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RPRD1B-201ENST00000373433 SPRR2BP35325 72 aa3.83□□□□□ -1.8
RPRD1B-201ENST00000373433 SPRR2AP35326 72 aa3.83□□□□□ -1.8
RPRD1B-201ENST00000373433 MT1GP13640 62 aa3.81□□□□□ -1.8
RPRD1B-201ENST00000373433 MT1EP04732 61 aa3.8□□□□□ -1.8
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.79□□□□□ -1.8
RPRD1B-201ENST00000373433 MT1LQ93083 61 aa3.75□□□□□ -1.81
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.73□□□□□ -1.81
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.72□□□□□ -1.81
RPRD1B-201ENST00000373433 LCE3BQ5TA77 95 aa3.72□□□□□ -1.81
RPRD1B-201ENST00000373433 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.69□□□□□ -1.82
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.69□□□□□ -1.82
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
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RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP12-4P60329 112 aa3.63□□□□□ -1.83
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RPRD1B-201ENST00000373433 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.61□□□□□ -1.83
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.58□□□□□ -1.84
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.56□□□□□ -1.84
RPRD1B-201ENST00000373433 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.52□□□□□ -1.85
RPRD1B-201ENST00000373433 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1B-201ENST00000373433 MDN1Q9NU22 5596 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP5-9P26371 169 aa3.46□□□□□ -1.85
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RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.39□□□□□ -1.87
RPRD1B-201ENST00000373433 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.31□□□□□ -1.88
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RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.18□□□□□ -1.9
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.16□□□□□ -1.9
RPRD1B-201ENST00000373433 LCE1DQ5T752 114 aa3.15□□□□□ -1.91
RPRD1B-201ENST00000373433 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.15□□□□□ -1.91
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RPRD1B-201ENST00000373433 MT3P25713 68 aa3.08□□□□□ -1.92
RPRD1B-201ENST00000373433 LCE4AQ5TA78 99 aa3.05□□□□□ -1.92
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.03□□□□□ -1.92
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.02□□□□□ -1.93
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.95□□□□□ -1.94
RPRD1B-201ENST00000373433 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.91□□□□□ -1.94
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.85□□□□□ -1.95
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.83□□□□□ -1.96
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RPRD1B-201ENST00000373433 LCE1EQ5T753 118 aa2.7□□□□□ -1.98
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.56□□□□□ -2
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.55□□□□□ -2
RPRD1B-201ENST00000373433 LCE1CQ5T751 118 aa2.55□□□□□ -2
RPRD1B-201ENST00000373433 LCE1FQ5T754 118 aa2.55□□□□□ -2
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.53□□□□□ -2
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.53□□□□□ -2
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.44□□□□□ -2.02
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.44□□□□□ -2.02
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.42□□□□□ -2.02
RPRD1B-201ENST00000373433 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.41□□□□□ -2.02
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP5-8O75690 187 aa2.28□□□□□ -2.04
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.26□□□□□ -2.05
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.24□□□□□ -2.05
RPRD1B-201ENST00000373433 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
RPRD1B-201ENST00000373433 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.03□□□□□ -2.08
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.97□□□□□ -2.09
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.95□□□□□ -2.1
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.95□□□□□ -2.1
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.94□□□□□ -2.1
RPRD1B-201ENST00000373433 PHGR1C9JFL3 82 aa1.67□□□□□ -2.14
RPRD1B-201ENST00000373433 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.06□□□□□ -2.24
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