RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 MUC17Q685J3 4493 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-207ENST00000368226 MT1MQ8N339 61 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-207ENST00000368226 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRK-207ENST00000368226 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-207ENST00000368226 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRK-207ENST00000368226 LCE1DQ5T752 114 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRK-207ENST00000368226 MT3P25713 68 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRK-207ENST00000368226 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRK-207ENST00000368226 PRM1P04553 51 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRK-207ENST00000368226 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRK-207ENST00000368226 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-207ENST00000368226 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.84□□□□□ -1.8
PTPRK-207ENST00000368226 RNF213Q63HN8 5207 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRK-207ENST00000368226 MUC2Q02817 5179 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-207ENST00000368226 MT1AP04731 61 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-207ENST00000368226 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRK-207ENST00000368226 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-207ENST00000368226 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-207ENST00000368226 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-207ENST00000368226 LCE1CQ5T751 118 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRK-207ENST00000368226 LCE1EQ5T753 118 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRK-207ENST00000368226 LCE1FQ5T754 118 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRK-207ENST00000368226 LCE4AQ5TA78 99 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRK-207ENST00000368226 KMT2DO14686 5537 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-207ENST00000368226 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-207ENST00000368226 USH2AO75445 5202 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-207ENST00000368226 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRK-207ENST00000368226 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRK-207ENST00000368226 SSPOA2VEC9 5147 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-207ENST00000368226 NEBP20929 6669 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP5-9P26371 169 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRK-207ENST00000368226 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRK-207ENST00000368226 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-207ENST00000368226 MDN1Q9NU22 5596 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-207ENST00000368226 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PTPRK-207ENST00000368226 MUC5ACP98088 5654 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP5-8O75690 187 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-207ENST00000368226 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRK-207ENST00000368226 PHGR1C9JFL3 82 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRK-207ENST00000368226 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.01□□□□□ -2.09
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.97□□□□□ -2.09
PTPRK-207ENST00000368226 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.88□□□□□ -2.11
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.87□□□□□ -2.11
PTPRK-207ENST00000368226 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.78□□□□□ -2.12
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.75□□□□□ -2.13
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.54□□□□□ -2.16
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.44□□□□□ -2.18
PTPRK-207ENST00000368226 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.17□□□□□ -2.22
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.1 ms