RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 MT1EP04732 61 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRK-201ENST00000368202 SPRR2EP22531 72 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRK-201ENST00000368202 SPRR2BP35325 72 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRK-201ENST00000368202 SPRR2AP35326 72 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRK-201ENST00000368202 MT1LQ93083 61 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRK-201ENST00000368202 MT1GP13640 62 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRK-201ENST00000368202 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRK-201ENST00000368202 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.24□□□□□ -1.73
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PTPRK-201ENST00000368202 MT1MQ8N339 61 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRK-201ENST00000368202 SPRR2DP22532 72 aa4.2□□□□□ -1.74
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PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-201ENST00000368202 LCE3BQ5TA77 95 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRK-201ENST00000368202 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.01□□□□□ -1.77
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PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.98□□□□□ -1.77
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PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRK-201ENST00000368202 LCE4AQ5TA78 99 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRK-201ENST00000368202 MT1AP04731 61 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.68□□□□□ -1.82
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PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.67□□□□□ -1.82
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PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.54□□□□□ -1.84
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PTPRK-201ENST00000368202 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-201ENST00000368202 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.48□□□□□ -1.85
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PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-201ENST00000368202 A0A0A0MQY5 61 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-201ENST00000368202 H3BS24 57 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRK-201ENST00000368202 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRK-201ENST00000368202 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.07□□□□□ -1.92
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PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP5-8O75690 187 aa3□□□□□ -1.93
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PTPRK-201ENST00000368202 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRK-201ENST00000368202 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-201ENST00000368202 LCE1CQ5T751 118 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-201ENST00000368202 PRM1P04553 51 aa2.58□□□□□ -2
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRK-201ENST00000368202 LCE1FQ5T754 118 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.14□□□□□ -2.07
PTPRK-201ENST00000368202 PHGR1C9JFL3 82 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRK-201ENST00000368202 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.81□□□□□ -2.12
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.52□□□□□ -2.17
PTPRK-201ENST00000368202 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.37□□□□□ -2.19
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