RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP-6.76□□□□□ -3.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIQKQ629K1 86 aa-6.76□□□□□ -3.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP-6.76□□□□□ -3.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00643Q86TS7 51 aa-6.77□□□□□ -3.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNNC2P02585 160 aa-6.79□□□□□ -3.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-6.79□□□□□ -3.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LZICQ8WZA0 190 aa-6.81□□□□□ -3.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OCC1Q8TAD7 63 aa-6.82□□□□□ -3.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP-6.82□□□□□ -3.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-6.83□□□□□ -3.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-6.83□□□□□ -3.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 V9GYS6 101 aa-6.83□□□□□ -3.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 APOC2P02655 101 aa-6.84□□□□□ -3.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARPC4P59998 168 aa-6.84□□□□□ -3.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAUP35544 74 aaKnown RBP-6.85□□□□□ -3.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATP6V1E1P36543 226 aa-6.85□□□□□ -3.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNGT2O14610 69 aa-6.86□□□□□ -3.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-6.86□□□□□ -3.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNE2Q9Y6J6 123 aa-6.86□□□□□ -3.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DR1Q01658 176 aa-6.87□□□□□ -3.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DLEU1O43261 78 aa-6.91□□□□□ -3.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP-6.91□□□□□ -3.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNG13Q9P2W3 67 aa-6.91□□□□□ -3.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP-6.91□□□□□ -3.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COMMD8Q9NX08 183 aa-6.93□□□□□ -3.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HSBP1O75506 76 aa-6.94□□□□□ -3.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 S100A13Q99584 98 aa-6.94□□□□□ -3.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNG4P50150 75 aa-6.95□□□□□ -3.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC167Q9P0B6 97 aa-6.95□□□□□ -3.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANAPC15P60006 121 aa-6.96□□□□□ -3.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CENPXA8MT69 81 aa-6.99□□□□□ -3.53
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHMP6Q96FZ7 201 aa-6.99□□□□□ -3.53
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CMC2Q9NRP2 79 aa-7□□□□□ -3.53
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AIF1LQ9BQI0 150 aa-7.03□□□□□ -3.53
RNU6-1128P-201ENST00000362825 E5RI56 91 aa-7.07□□□□□ -3.54
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-7.08□□□□□ -3.54
RNU6-1128P-201ENST00000362825 K7ERU9 68 aa-7.08□□□□□ -3.54
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SVBPQ8N300 66 aa-7.08□□□□□ -3.54
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C18orf32Q8TCD1 76 aa-7.09□□□□□ -3.54
RNU6-1128P-201ENST00000362825 J3QR89 54 aa-7.1□□□□□ -3.55
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TPM4P67936 248 aa-7.1□□□□□ -3.55
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPP3R1P63098 170 aa-7.14□□□□□ -3.55
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCP4L1A6NKN8 68 aa-7.2□□□□□ -3.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPA17Q15506 151 aa-7.21□□□□□ -3.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C9orf16Q9BUW7 83 aa-7.21□□□□□ -3.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMIM3Q9BZL3 60 aa-7.21□□□□□ -3.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNG2P59768 71 aa-7.22□□□□□ -3.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C14orf144Q96I85 54 aa-7.24□□□□□ -3.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMIM30A4D0T7 59 aa-7.25□□□□□ -3.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa-7.27□□□□□ -3.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HSBP1L1C9JCN9 74 aa-7.29□□□□□ -3.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AKAIN1P0CW23 69 aa-7.29□□□□□ -3.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNG8Q9UK08 70 aa-7.29□□□□□ -3.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADIRFQ15847 76 aa-7.31□□□□□ -3.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EFCAB10A6NFE3 127 aa-7.33□□□□□ -3.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PYY3Q5JQD4 70 aa-7.33□□□□□ -3.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM25AB3EWG3 89 aa-7.36□□□□□ -3.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM25CB3EWG5 89 aa-7.36□□□□□ -3.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM25GB3EWG6 89 aa-7.36□□□□□ -3.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PET100P0DJ07 73 aa-7.37□□□□□ -3.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa-7.5□□□□□ -3.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TPM2P07951 284 aa-7.52□□□□□ -3.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q9H521 79 aa-7.53□□□□□ -3.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 M0R143 59 aa-7.55□□□□□ -3.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTMAP06454 111 aaKnown RBP-7.57□□□□□ -3.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00523Q86TU6 105 aa-7.58□□□□□ -3.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TPM1P09493 284 aa-7.62□□□□□ -3.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP-7.7□□□□□ -3.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-7.73□□□□□ -3.65
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STMN1P16949 149 aa-7.79□□□□□ -3.66
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TPM3P06753 285 aa-7.84□□□□□ -3.66
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TOMM5Q8N4H5 51 aa-7.89□□□□□ -3.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1B0GV90 55 aa-7.9□□□□□ -3.67
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP-8.67□□□□□ -3.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa-8.78□□□□□ -3.81
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-8.81□□□□□ -3.82
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTMSP20962 102 aa-9.76□□□□□ -3.97
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