RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.38□□□□□ -1.07
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa8.38□□□□□ -1.07
SERF1A-202ENST00000354833 MT1GP13640 62 aa8.32□□□□□ -1.08
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP5-9P26371 169 aa8.28□□□□□ -1.08
SERF1A-202ENST00000354833 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
SERF1A-202ENST00000354833 MT1MQ8N339 61 aa8.24□□□□□ -1.09
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa8.21□□□□□ -1.1
SERF1A-202ENST00000354833 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.21□□□□□ -1.1
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.11□□□□□ -1.11
SERF1A-202ENST00000354833 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.04□□□□□ -1.12
SERF1A-202ENST00000354833 MDN1Q9NU22 5596 aa8.01□□□□□ -1.13
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.01□□□□□ -1.13
SERF1A-202ENST00000354833 SPRR2EP22531 72 aa7.94□□□□□ -1.14
SERF1A-202ENST00000354833 SPRR2BP35325 72 aa7.94□□□□□ -1.14
SERF1A-202ENST00000354833 SPRR2AP35326 72 aa7.94□□□□□ -1.14
SERF1A-202ENST00000354833 H3BS24 57 aa7.93□□□□□ -1.14
SERF1A-202ENST00000354833 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.88□□□□□ -1.15
SERF1A-202ENST00000354833 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.75□□□□□ -1.17
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SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.66□□□□□ -1.18
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.66□□□□□ -1.18
SERF1A-202ENST00000354833 SPRR2DP22532 72 aa7.64□□□□□ -1.19
SERF1A-202ENST00000354833 A0A0A0MQY5 61 aa7.62□□□□□ -1.19
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
SERF1A-202ENST00000354833 NEBP20929 6669 aa7.41□□□□□ -1.22
SERF1A-202ENST00000354833 LCE3BQ5TA77 95 aa7.32□□□□□ -1.24
SERF1A-202ENST00000354833 MT1AP04731 61 aa7.31□□□□□ -1.24
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.27□□□□□ -1.25
SERF1A-202ENST00000354833 INE1O15225 51 aa7.11□□□□□ -1.27
SERF1A-202ENST00000354833 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.96□□□□□ -1.29
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.94□□□□□ -1.3
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SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.82□□□□□ -1.32
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SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.62□□□□□ -1.35
SERF1A-202ENST00000354833 MT3P25713 68 aa6.62□□□□□ -1.35
SERF1A-202ENST00000354833 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.53□□□□□ -1.36
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.51□□□□□ -1.37
SERF1A-202ENST00000354833 LCE1DQ5T752 114 aa6.49□□□□□ -1.37
SERF1A-202ENST00000354833 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.42□□□□□ -1.38
SERF1A-202ENST00000354833 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.36□□□□□ -1.39
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.36□□□□□ -1.39
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.26□□□□□ -1.41
SERF1A-202ENST00000354833 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.07□□□□□ -1.44
SERF1A-202ENST00000354833 LCE1EQ5T753 118 aa5.69□□□□□ -1.5
SERF1A-202ENST00000354833 PRM1P04553 51 aa5.66□□□□□ -1.5
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.59□□□□□ -1.51
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.58□□□□□ -1.52
SERF1A-202ENST00000354833 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.55□□□□□ -1.52
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.49□□□□□ -1.53
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.47□□□□□ -1.53
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.39□□□□□ -1.55
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP5-8O75690 187 aa5.37□□□□□ -1.55
SERF1A-202ENST00000354833 MUC5ACP98088 5654 aa5.36□□□□□ -1.55
SERF1A-202ENST00000354833 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.36□□□□□ -1.55
SERF1A-202ENST00000354833 LCE1CQ5T751 118 aa5.32□□□□□ -1.56
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.31□□□□□ -1.56
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.24□□□□□ -1.57
SERF1A-202ENST00000354833 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.22□□□□□ -1.57
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.75□□□□□ -1.65
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.66□□□□□ -1.66
SERF1A-202ENST00000354833 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SERF1A-202ENST00000354833 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.22□□□□□ -1.73
SERF1A-202ENST00000354833 LCE1FQ5T754 118 aa4.21□□□□□ -1.74
SERF1A-202ENST00000354833 PHGR1C9JFL3 82 aa4.01□□□□□ -1.77
SERF1A-202ENST00000354833 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.59□□□□□ -1.83
SERF1A-202ENST00000354833 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.5□□□□□ -1.85
SERF1A-202ENST00000354833 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.62□□□□□ -1.99
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