RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

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Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.7□□□□□ -1.18
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.69□□□□□ -1.18
SNX18-201ENST00000326277 MT1GP13640 62 aa7.64□□□□□ -1.19
SNX18-201ENST00000326277 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
SNX18-201ENST00000326277 MT1MQ8N339 61 aa7.62□□□□□ -1.19
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.62□□□□□ -1.19
SNX18-201ENST00000326277 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.61□□□□□ -1.19
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.57□□□□□ -1.2
SNX18-201ENST00000326277 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.49□□□□□ -1.21
SNX18-201ENST00000326277 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.48□□□□□ -1.21
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.47□□□□□ -1.21
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.47□□□□□ -1.21
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.47□□□□□ -1.21
SNX18-201ENST00000326277 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SNX18-201ENST00000326277 INE1O15225 51 aa7.34□□□□□ -1.23
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP5-9P26371 169 aa7.28□□□□□ -1.24
SNX18-201ENST00000326277 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SNX18-201ENST00000326277 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX18-201ENST00000326277 MDN1Q9NU22 5596 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX18-201ENST00000326277 SPRR2EP22531 72 aa7.06□□□□□ -1.28
SNX18-201ENST00000326277 SPRR2BP35325 72 aa7.06□□□□□ -1.28
SNX18-201ENST00000326277 SPRR2AP35326 72 aa7.06□□□□□ -1.28
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.94□□□□□ -1.3
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.85□□□□□ -1.31
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.81□□□□□ -1.32
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SNX18-201ENST00000326277 MT1AP04731 61 aa6.79□□□□□ -1.32
SNX18-201ENST00000326277 LCE3BQ5TA77 95 aa6.78□□□□□ -1.32
SNX18-201ENST00000326277 SPRR2DP22532 72 aa6.77□□□□□ -1.33
SNX18-201ENST00000326277 NEBP20929 6669 aa6.56□□□□□ -1.36
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.55□□□□□ -1.36
SNX18-201ENST00000326277 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP12-4P60329 112 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.42□□□□□ -1.38
SNX18-201ENST00000326277 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.28□□□□□ -1.4
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.21□□□□□ -1.41
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.19□□□□□ -1.42
SNX18-201ENST00000326277 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.16□□□□□ -1.42
SNX18-201ENST00000326277 MT3P25713 68 aa6.11□□□□□ -1.43
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.05□□□□□ -1.44
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.96□□□□□ -1.46
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.96□□□□□ -1.46
SNX18-201ENST00000326277 MT4P47944 62 aa5.94□□□□□ -1.46
SNX18-201ENST00000326277 LCE4AQ5TA78 99 aa5.92□□□□□ -1.46
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.82□□□□□ -1.48
SNX18-201ENST00000326277 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.8□□□□□ -1.48
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.73□□□□□ -1.49
SNX18-201ENST00000326277 LCE1DQ5T752 114 aa5.7□□□□□ -1.5
SNX18-201ENST00000326277 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.69□□□□□ -1.5
SNX18-201ENST00000326277 PRM1P04553 51 aa5.68□□□□□ -1.5
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.57□□□□□ -1.52
SNX18-201ENST00000326277 LCE1EQ5T753 118 aa5.14□□□□□ -1.59
SNX18-201ENST00000326277 MUC5ACP98088 5654 aa5.05□□□□□ -1.6
SNX18-201ENST00000326277 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.96□□□□□ -1.61
SNX18-201ENST00000326277 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.95□□□□□ -1.62
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.92□□□□□ -1.62
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.91□□□□□ -1.62
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.88□□□□□ -1.63
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.85□□□□□ -1.63
SNX18-201ENST00000326277 LCE1CQ5T751 118 aa4.83□□□□□ -1.64
SNX18-201ENST00000326277 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.79□□□□□ -1.64
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP5-8O75690 187 aa4.72□□□□□ -1.65
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.61□□□□□ -1.67
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.43□□□□□ -1.7
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.2□□□□□ -1.74
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.15□□□□□ -1.74
SNX18-201ENST00000326277 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4□□□□□ -1.77
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.98□□□□□ -1.77
SNX18-201ENST00000326277 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
SNX18-201ENST00000326277 PHGR1C9JFL3 82 aa3.63□□□□□ -1.83
SNX18-201ENST00000326277 LCE1FQ5T754 118 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.52□□□□□ -1.85
SNX18-201ENST00000326277 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.5□□□□□ -1.85
SNX18-201ENST00000326277 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.4□□□□□ -2.02
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