RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315423.11

TNIP2-201, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIP2, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP2-201ENST00000315423 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa8.7□□□□□ -1.02
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.64□□□□□ -1.03
TNIP2-201ENST00000315423 INE1O15225 51 aa8.53□□□□□ -1.04
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.4□□□□□ -1.06
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa8.39□□□□□ -1.07
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa8.39□□□□□ -1.07
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa8.39□□□□□ -1.07
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa8.39□□□□□ -1.07
TNIP2-201ENST00000315423 MT1GP13640 62 aa8.37□□□□□ -1.07
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.37□□□□□ -1.07
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP5-9P26371 169 aa8.32□□□□□ -1.08
TNIP2-201ENST00000315423 MT1MQ8N339 61 aa8.32□□□□□ -1.08
TNIP2-201ENST00000315423 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.31□□□□□ -1.08
TNIP2-201ENST00000315423 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.31□□□□□ -1.08
TNIP2-201ENST00000315423 MDN1Q9NU22 5596 aa8.2□□□□□ -1.1
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.2□□□□□ -1.1
TNIP2-201ENST00000315423 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.15□□□□□ -1.1
TNIP2-201ENST00000315423 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.08□□□□□ -1.12
TNIP2-201ENST00000315423 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.01□□□□□ -1.13
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TNIP2-201ENST00000315423 SPRR2EP22531 72 aa7.99□□□□□ -1.13
TNIP2-201ENST00000315423 SPRR2BP35325 72 aa7.99□□□□□ -1.13
TNIP2-201ENST00000315423 SPRR2AP35326 72 aa7.99□□□□□ -1.13
TNIP2-201ENST00000315423 SPRR2DP22532 72 aa7.7□□□□□ -1.18
TNIP2-201ENST00000315423 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
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TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
TNIP2-201ENST00000315423 LCE3BQ5TA77 95 aa7.43□□□□□ -1.22
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.42□□□□□ -1.22
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TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP12-4P60329 112 aa7.24□□□□□ -1.25
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.21□□□□□ -1.26
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.1□□□□□ -1.27
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.03□□□□□ -1.28
TNIP2-201ENST00000315423 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TNIP2-201ENST00000315423 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.98□□□□□ -1.29
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TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.86□□□□□ -1.31
TNIP2-201ENST00000315423 LCE4AQ5TA78 99 aa6.78□□□□□ -1.32
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TNIP2-201ENST00000315423 MT3P25713 68 aa6.73□□□□□ -1.33
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.71□□□□□ -1.34
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TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.65□□□□□ -1.34
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.44□□□□□ -1.38
TNIP2-201ENST00000315423 PRM1P04553 51 aa6.35□□□□□ -1.39
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.26□□□□□ -1.41
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.22□□□□□ -1.41
TNIP2-201ENST00000315423 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.1□□□□□ -1.43
TNIP2-201ENST00000315423 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.06□□□□□ -1.44
TNIP2-201ENST00000315423 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.84□□□□□ -1.48
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.78□□□□□ -1.48
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.69□□□□□ -1.5
TNIP2-201ENST00000315423 LCE1EQ5T753 118 aa5.67□□□□□ -1.5
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP5-8O75690 187 aa5.49□□□□□ -1.53
TNIP2-201ENST00000315423 MUC5ACP98088 5654 aa5.49□□□□□ -1.53
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TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.4□□□□□ -1.55
TNIP2-201ENST00000315423 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.33□□□□□ -1.56
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TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.27□□□□□ -1.57
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.01□□□□□ -1.61
TNIP2-201ENST00000315423 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.85□□□□□ -1.63
TNIP2-201ENST00000315423 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.62□□□□□ -1.67
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.4□□□□□ -1.71
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.25□□□□□ -1.73
TNIP2-201ENST00000315423 LCE1FQ5T754 118 aa4.1□□□□□ -1.75
TNIP2-201ENST00000315423 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa4.03□□□□□ -1.76
TNIP2-201ENST00000315423 PHGR1C9JFL3 82 aa3.95□□□□□ -1.78
TNIP2-201ENST00000315423 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.7□□□□□ -1.82
TNIP2-201ENST00000315423 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.63□□□□□ -1.99
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