RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.72□□□□□ -1.33
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.67□□□□□ -1.34
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.62□□□□□ -1.35
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.62□□□□□ -1.35
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.62□□□□□ -1.35
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SPNS1-201ENST00000311008 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SPNS1-201ENST00000311008 MT1GP13640 62 aa6.45□□□□□ -1.38
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.45□□□□□ -1.38
SPNS1-201ENST00000311008 MT1MQ8N339 61 aa6.4□□□□□ -1.38
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.32□□□□□ -1.4
SPNS1-201ENST00000311008 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.27□□□□□ -1.4
SPNS1-201ENST00000311008 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.24□□□□□ -1.41
SPNS1-201ENST00000311008 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SPNS1-201ENST00000311008 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.22□□□□□ -1.41
SPNS1-201ENST00000311008 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.19□□□□□ -1.42
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.1□□□□□ -1.43
SPNS1-201ENST00000311008 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP5-9P26371 169 aa5.95□□□□□ -1.46
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.85□□□□□ -1.47
SPNS1-201ENST00000311008 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.83□□□□□ -1.48
SPNS1-201ENST00000311008 NEBP20929 6669 aa5.82□□□□□ -1.48
SPNS1-201ENST00000311008 MDN1Q9NU22 5596 aa5.81□□□□□ -1.48
SPNS1-201ENST00000311008 MT1AP04731 61 aa5.78□□□□□ -1.48
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP12-4P60329 112 aa5.78□□□□□ -1.48
SPNS1-201ENST00000311008 LCE3BQ5TA77 95 aa5.78□□□□□ -1.48
SPNS1-201ENST00000311008 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SPNS1-201ENST00000311008 SPRR2EP22531 72 aa5.74□□□□□ -1.49
SPNS1-201ENST00000311008 SPRR2BP35325 72 aa5.74□□□□□ -1.49
SPNS1-201ENST00000311008 SPRR2AP35326 72 aa5.74□□□□□ -1.49
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.74□□□□□ -1.49
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.56□□□□□ -1.52
SPNS1-201ENST00000311008 SPRR2DP22532 72 aa5.52□□□□□ -1.53
SPNS1-201ENST00000311008 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.51□□□□□ -1.53
SPNS1-201ENST00000311008 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.44□□□□□ -1.54
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.44□□□□□ -1.54
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.39□□□□□ -1.55
SPNS1-201ENST00000311008 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
SPNS1-201ENST00000311008 MT3P25713 68 aa5.22□□□□□ -1.57
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.17□□□□□ -1.58
SPNS1-201ENST00000311008 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.1□□□□□ -1.59
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.09□□□□□ -1.59
SPNS1-201ENST00000311008 PRM1P04553 51 aa5.07□□□□□ -1.6
SPNS1-201ENST00000311008 LCE4AQ5TA78 99 aa4.87□□□□□ -1.63
SPNS1-201ENST00000311008 MT4P47944 62 aa4.81□□□□□ -1.64
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.8□□□□□ -1.64
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.74□□□□□ -1.65
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.74□□□□□ -1.65
SPNS1-201ENST00000311008 LCE1DQ5T752 114 aa4.66□□□□□ -1.66
SPNS1-201ENST00000311008 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.65□□□□□ -1.66
SPNS1-201ENST00000311008 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.65□□□□□ -1.67
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.58□□□□□ -1.68
SPNS1-201ENST00000311008 LCE1EQ5T753 118 aa4.57□□□□□ -1.68
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.54□□□□□ -1.68
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.53□□□□□ -1.68
SPNS1-201ENST00000311008 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.48□□□□□ -1.69
SPNS1-201ENST00000311008 MUC5ACP98088 5654 aa4.22□□□□□ -1.73
SPNS1-201ENST00000311008 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.12□□□□□ -1.75
SPNS1-201ENST00000311008 LCE1CQ5T751 118 aa4.07□□□□□ -1.76
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.04□□□□□ -1.76
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.02□□□□□ -1.77
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.02□□□□□ -1.77
SPNS1-201ENST00000311008 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SPNS1-201ENST00000311008 LCE1FQ5T754 118 aa3.98□□□□□ -1.77
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP5-8O75690 187 aa3.86□□□□□ -1.79
SPNS1-201ENST00000311008 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.74□□□□□ -1.81
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.71□□□□□ -1.82
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.51□□□□□ -1.85
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.31□□□□□ -1.88
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.29□□□□□ -1.88
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.17□□□□□ -1.9
SPNS1-201ENST00000311008 PHGR1C9JFL3 82 aa3.01□□□□□ -1.93
SPNS1-201ENST00000311008 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.9□□□□□ -1.95
SPNS1-201ENST00000311008 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.01□□□□□ -2.09
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