RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
KCNS1-201ENST00000306117 MT1LQ93083 61 aa5.08□□□□□ -1.6
KCNS1-201ENST00000306117 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.06□□□□□ -1.6
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.05□□□□□ -1.6
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.04□□□□□ -1.6
KCNS1-201ENST00000306117 MT1EP04732 61 aa5.02□□□□□ -1.61
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5□□□□□ -1.61
KCNS1-201ENST00000306117 PRM1P04553 51 aa4.87□□□□□ -1.63
KCNS1-201ENST00000306117 SPRR2EP22531 72 aa4.86□□□□□ -1.63
KCNS1-201ENST00000306117 SPRR2BP35325 72 aa4.86□□□□□ -1.63
KCNS1-201ENST00000306117 SPRR2AP35326 72 aa4.86□□□□□ -1.63
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.83□□□□□ -1.64
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.81□□□□□ -1.64
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.81□□□□□ -1.64
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.81□□□□□ -1.64
KCNS1-201ENST00000306117 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
KCNS1-201ENST00000306117 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
KCNS1-201ENST00000306117 MT1MQ8N339 61 aa4.78□□□□□ -1.64
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.76□□□□□ -1.65
KCNS1-201ENST00000306117 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.73□□□□□ -1.65
KCNS1-201ENST00000306117 SPRR2DP22532 72 aa4.66□□□□□ -1.66
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.62□□□□□ -1.67
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.58□□□□□ -1.68
KCNS1-201ENST00000306117 MT3P25713 68 aa4.53□□□□□ -1.69
KCNS1-201ENST00000306117 SSPOA2VEC9 5147 aa4.52□□□□□ -1.69
KCNS1-201ENST00000306117 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.38□□□□□ -1.71
KCNS1-201ENST00000306117 MT1AP04731 61 aa4.35□□□□□ -1.71
KCNS1-201ENST00000306117 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.34□□□□□ -1.71
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.33□□□□□ -1.72
KCNS1-201ENST00000306117 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.31□□□□□ -1.72
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.31□□□□□ -1.72
KCNS1-201ENST00000306117 LCE1DQ5T752 114 aa4.31□□□□□ -1.72
KCNS1-201ENST00000306117 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
KCNS1-201ENST00000306117 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.3□□□□□ -1.72
KCNS1-201ENST00000306117 MT4P47944 62 aa4.27□□□□□ -1.73
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.27□□□□□ -1.73
KCNS1-201ENST00000306117 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.08□□□□□ -1.76
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
KCNS1-201ENST00000306117 MDN1Q9NU22 5596 aa4.02□□□□□ -1.77
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.98□□□□□ -1.77
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.97□□□□□ -1.77
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.93□□□□□ -1.78
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.86□□□□□ -1.79
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP5-9P26371 169 aa3.67□□□□□ -1.82
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.64□□□□□ -1.83
KCNS1-201ENST00000306117 NEBP20929 6669 aa3.59□□□□□ -1.83
KCNS1-201ENST00000306117 LCE4AQ5TA78 99 aa3.59□□□□□ -1.83
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.57□□□□□ -1.84
KCNS1-201ENST00000306117 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.57□□□□□ -1.84
KCNS1-201ENST00000306117 LCE1EQ5T753 118 aa3.51□□□□□ -1.85
KCNS1-201ENST00000306117 LCE1CQ5T751 118 aa3.51□□□□□ -1.85
KCNS1-201ENST00000306117 LCE1FQ5T754 118 aa3.51□□□□□ -1.85
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.32□□□□□ -1.88
KCNS1-201ENST00000306117 MUC5ACP98088 5654 aa3.3□□□□□ -1.88
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.19□□□□□ -1.9
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.1□□□□□ -1.91
KCNS1-201ENST00000306117 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.08□□□□□ -1.92
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.05□□□□□ -1.92
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.97□□□□□ -1.93
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.97□□□□□ -1.93
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.85□□□□□ -1.95
KCNS1-201ENST00000306117 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.83□□□□□ -1.96
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.77□□□□□ -1.97
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.72□□□□□ -1.97
KCNS1-201ENST00000306117 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP5-8O75690 187 aa2.5□□□□□ -2.01
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.48□□□□□ -2.01
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.47□□□□□ -2.01
KCNS1-201ENST00000306117 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.25□□□□□ -2.05
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.23□□□□□ -2.05
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.19□□□□□ -2.06
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
KCNS1-201ENST00000306117 PHGR1C9JFL3 82 aa2.07□□□□□ -2.08
KCNS1-201ENST00000306117 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.31□□□□□ -2.2
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