RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USH2AO75445 5202 aa7.56□□□□□ -1.2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MT1EP04732 61 aa7.48□□□□□ -1.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SSPOA2VEC9 5147 aa7.44□□□□□ -1.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP12-4P60329 112 aa7.31□□□□□ -1.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.21□□□□□ -1.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.19□□□□□ -1.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MT1GP13640 62 aa7.12□□□□□ -1.27
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.1□□□□□ -1.27
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MT1MQ8N339 61 aa6.95□□□□□ -1.3
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.91□□□□□ -1.3
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.87□□□□□ -1.31
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MT1AP04731 61 aa6.76□□□□□ -1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LCE3BQ5TA77 95 aa6.74□□□□□ -1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.69□□□□□ -1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.65□□□□□ -1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.59□□□□□ -1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.58□□□□□ -1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.57□□□□□ -1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRM1P04553 51 aa6.56□□□□□ -1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.54□□□□□ -1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP5-9P26371 169 aa6.45□□□□□ -1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.44□□□□□ -1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.43□□□□□ -1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MDN1Q9NU22 5596 aa6.39□□□□□ -1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NEBP20929 6669 aa6.37□□□□□ -1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPRR2EP22531 72 aa6.26□□□□□ -1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPRR2BP35325 72 aa6.26□□□□□ -1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPRR2AP35326 72 aa6.26□□□□□ -1.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.17□□□□□ -1.42
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.17□□□□□ -1.42
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.08□□□□□ -1.44
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPRR2DP22532 72 aa6.04□□□□□ -1.44
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.97□□□□□ -1.45
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.94□□□□□ -1.46
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MT3P25713 68 aa5.69□□□□□ -1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.38□□□□□ -1.55
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LCE1EQ5T753 118 aa5.35□□□□□ -1.55
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MT4P47944 62 aa5.31□□□□□ -1.56
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LCE1DQ5T752 114 aa5.28□□□□□ -1.56
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LCE4AQ5TA78 99 aa5.28□□□□□ -1.56
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.21□□□□□ -1.57
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.2□□□□□ -1.58
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.16□□□□□ -1.58
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.96□□□□□ -1.62
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.92□□□□□ -1.62
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MUC5ACP98088 5654 aa4.89□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.86□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.86□□□□□ -1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.77□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.75□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.61□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.47□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.46□□□□□ -1.7
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP5-8O75690 187 aa4.29□□□□□ -1.72
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa4.26□□□□□ -1.73
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LCE1CQ5T751 118 aa4.24□□□□□ -1.73
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.23□□□□□ -1.73
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LCE1FQ5T754 118 aa4.14□□□□□ -1.75
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.14□□□□□ -1.75
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.05□□□□□ -1.76
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.76□□□□□ -1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.72□□□□□ -1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.57□□□□□ -1.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.44□□□□□ -1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PHGR1C9JFL3 82 aa3.09□□□□□ -1.92
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.6 ms