RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.21□□□□□ -1.89
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.21□□□□□ -1.89
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.21□□□□□ -1.89
HDGFL3-201ENST00000299633 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.18□□□□□ -1.9
HDGFL3-201ENST00000299633 RYR2Q92736 4967 aa3.14□□□□□ -1.91
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.12□□□□□ -1.91
HDGFL3-201ENST00000299633 LCE4AQ5TA78 99 aa3.12□□□□□ -1.91
HDGFL3-201ENST00000299633 HERC2O95714 4834 aa3.11□□□□□ -1.91
HDGFL3-201ENST00000299633 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
HDGFL3-201ENST00000299633 MT1AP04731 61 aa3.1□□□□□ -1.91
HDGFL3-201ENST00000299633 LCE1CQ5T751 118 aa3.1□□□□□ -1.91
HDGFL3-201ENST00000299633 LCE1EQ5T753 118 aa3.1□□□□□ -1.91
HDGFL3-201ENST00000299633 LCE1FQ5T754 118 aa3.1□□□□□ -1.91
HDGFL3-201ENST00000299633 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.1□□□□□ -1.91
HDGFL3-201ENST00000299633 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.1□□□□□ -1.91
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.09□□□□□ -1.92
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.08□□□□□ -1.92
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.07□□□□□ -1.92
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.07□□□□□ -1.92
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa2.99□□□□□ -1.93
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.92□□□□□ -1.94
HDGFL3-201ENST00000299633 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.88□□□□□ -1.95
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.88□□□□□ -1.95
HDGFL3-201ENST00000299633 HERC1Q15751 4861 aa2.85□□□□□ -1.95
HDGFL3-201ENST00000299633 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
HDGFL3-201ENST00000299633 ABCA13Q86UQ4 5058 aa2.77□□□□□ -1.97
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.77□□□□□ -1.97
HDGFL3-201ENST00000299633 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.76□□□□□ -1.97
HDGFL3-201ENST00000299633 MUC2Q02817 5179 aa2.73□□□□□ -1.97
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.72□□□□□ -1.97
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.7□□□□□ -1.98
HDGFL3-201ENST00000299633 RNF213Q63HN8 5207 aa2.69□□□□□ -1.98
HDGFL3-201ENST00000299633 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.67□□□□□ -1.98
HDGFL3-201ENST00000299633 KMT2DO14686 5537 aa2.64□□□□□ -1.99
HDGFL3-201ENST00000299633 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.63□□□□□ -1.99
HDGFL3-201ENST00000299633 FAT4Q6V0I7 4981 aa2.62□□□□□ -1.99
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.61□□□□□ -1.99
HDGFL3-201ENST00000299633 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.59□□□□□ -2
HDGFL3-201ENST00000299633 MDN1Q9NU22 5596 aa2.57□□□□□ -2
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.54□□□□□ -2
HDGFL3-201ENST00000299633 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.36□□□□□ -2.03
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.34□□□□□ -2.03
HDGFL3-201ENST00000299633 NEBP20929 6669 aa2.31□□□□□ -2.04
HDGFL3-201ENST00000299633 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP5-9P26371 169 aa2.24□□□□□ -2.05
HDGFL3-201ENST00000299633 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.24□□□□□ -2.05
HDGFL3-201ENST00000299633 USH2AO75445 5202 aa2.23□□□□□ -2.05
HDGFL3-201ENST00000299633 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.18□□□□□ -2.06
HDGFL3-201ENST00000299633 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.17□□□□□ -2.06
HDGFL3-201ENST00000299633 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.17□□□□□ -2.06
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.15□□□□□ -2.07
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.15□□□□□ -2.07
HDGFL3-201ENST00000299633 SSPOA2VEC9 5147 aa2.11□□□□□ -2.07
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.07□□□□□ -2.08
HDGFL3-201ENST00000299633 MUC5ACP98088 5654 aa2.04□□□□□ -2.08
HDGFL3-201ENST00000299633 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.97□□□□□ -2.09
HDGFL3-201ENST00000299633 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa1.77□□□□□ -2.13
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.73□□□□□ -2.13
HDGFL3-201ENST00000299633 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.73□□□□□ -2.13
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.71□□□□□ -2.14
HDGFL3-201ENST00000299633 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.64□□□□□ -2.15
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP5-8O75690 187 aa1.61□□□□□ -2.15
HDGFL3-201ENST00000299633 PHGR1C9JFL3 82 aa1.58□□□□□ -2.16
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.54□□□□□ -2.16
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.54□□□□□ -2.16
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.45□□□□□ -2.18
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.43□□□□□ -2.18
HDGFL3-201ENST00000299633 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.15□□□□□ -2.23
HDGFL3-201ENST00000299633 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.1□□□□□ -2.23
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 168 ms