RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299575.4

ATMIN-201, Transcript of ATM interactor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATMIN, Length 4,884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.32□□□□□ -1.24
ATMIN-201ENST00000299575 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ATMIN-201ENST00000299575 LCE3DQ9BYE3 92 aa7.26□□□□□ -1.25
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.24□□□□□ -1.25
ATMIN-201ENST00000299575 MT1MQ8N339 61 aa7.21□□□□□ -1.26
ATMIN-201ENST00000299575 LCE3EQ5T5B0 92 aa7.14□□□□□ -1.27
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.11□□□□□ -1.27
ATMIN-201ENST00000299575 MUC2Q02817 5179 aa7.1□□□□□ -1.27
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.03□□□□□ -1.28
ATMIN-201ENST00000299575 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.02□□□□□ -1.29
ATMIN-201ENST00000299575 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
ATMIN-201ENST00000299575 MT3P25713 68 aa6.81□□□□□ -1.32
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.78□□□□□ -1.32
ATMIN-201ENST00000299575 MT4P47944 62 aa6.72□□□□□ -1.33
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.67□□□□□ -1.34
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.67□□□□□ -1.34
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.67□□□□□ -1.34
ATMIN-201ENST00000299575 MT1AP04731 61 aa6.65□□□□□ -1.34
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.58□□□□□ -1.36
ATMIN-201ENST00000299575 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.54□□□□□ -1.36
ATMIN-201ENST00000299575 PRM1P04553 51 aa6.53□□□□□ -1.36
ATMIN-201ENST00000299575 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.47□□□□□ -1.37
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.42□□□□□ -1.38
ATMIN-201ENST00000299575 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.42□□□□□ -1.38
ATMIN-201ENST00000299575 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.42□□□□□ -1.38
ATMIN-201ENST00000299575 USH2AO75445 5202 aa6.41□□□□□ -1.38
ATMIN-201ENST00000299575 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.35□□□□□ -1.39
ATMIN-201ENST00000299575 LCE1DQ5T752 114 aa6.32□□□□□ -1.4
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.32□□□□□ -1.4
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
ATMIN-201ENST00000299575 LCE1BQ5T7P3 118 aa6.29□□□□□ -1.4
ATMIN-201ENST00000299575 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.23□□□□□ -1.41
ATMIN-201ENST00000299575 KMT2DO14686 5537 aa6.15□□□□□ -1.42
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.12□□□□□ -1.43
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.12□□□□□ -1.43
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.92□□□□□ -1.46
ATMIN-201ENST00000299575 LCE4AQ5TA78 99 aa5.92□□□□□ -1.46
ATMIN-201ENST00000299575 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ATMIN-201ENST00000299575 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.84□□□□□ -1.47
ATMIN-201ENST00000299575 SSPOA2VEC9 5147 aa5.82□□□□□ -1.48
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP5-9P26371 169 aa5.66□□□□□ -1.5
ATMIN-201ENST00000299575 MDN1Q9NU22 5596 aa5.6□□□□□ -1.51
ATMIN-201ENST00000299575 NEBP20929 6669 aa5.55□□□□□ -1.52
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.28□□□□□ -1.56
ATMIN-201ENST00000299575 LCE1CQ5T751 118 aa5.19□□□□□ -1.58
ATMIN-201ENST00000299575 LCE1EQ5T753 118 aa5.19□□□□□ -1.58
ATMIN-201ENST00000299575 LCE1FQ5T754 118 aa5.19□□□□□ -1.58
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.18□□□□□ -1.58
ATMIN-201ENST00000299575 MUC19Q7Z5P9 8384 aa5.17□□□□□ -1.58
ATMIN-201ENST00000299575 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.02□□□□□ -1.61
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.02□□□□□ -1.61
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.85□□□□□ -1.63
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.78□□□□□ -1.64
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ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.49□□□□□ -1.69
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.48□□□□□ -1.69
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.48□□□□□ -1.69
ATMIN-201ENST00000299575 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.39□□□□□ -1.71
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.29□□□□□ -1.72
ATMIN-201ENST00000299575 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.23□□□□□ -1.73
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.04□□□□□ -1.76
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP5-8O75690 187 aa3.94□□□□□ -1.78
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.9□□□□□ -1.79
ATMIN-201ENST00000299575 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
ATMIN-201ENST00000299575 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.53□□□□□ -1.84
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.49□□□□□ -1.85
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.4□□□□□ -1.86
ATMIN-201ENST00000299575 PHGR1C9JFL3 82 aa3.29□□□□□ -1.88
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.96□□□□□ -1.94
ATMIN-201ENST00000299575 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.91□□□□□ -1.94
ATMIN-201ENST00000299575 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.03□□□□□ -2.08
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