RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293973.1

NTN3-201, Transcript of netrin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NTN3, Length 1,986 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN3-201ENST00000293973 MUC12Q9UKN1 5478 aa9.26□□□□□ -0.93
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP12-3P60328 96 aa9.26□□□□□ -0.93
NTN3-201ENST00000293973 MT1EP04732 61 aa9.21□□□□□ -0.93
NTN3-201ENST00000293973 MDN1Q9NU22 5596 aa9.15□□□□□ -0.94
NTN3-201ENST00000293973 SPRR2EP22531 72 aa8.98□□□□□ -0.97
NTN3-201ENST00000293973 SPRR2BP35325 72 aa8.98□□□□□ -0.97
NTN3-201ENST00000293973 SPRR2AP35326 72 aa8.98□□□□□ -0.97
NTN3-201ENST00000293973 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.98□□□□□ -0.97
NTN3-201ENST00000293973 MT1LQ93083 61 aa8.96□□□□□ -0.98
NTN3-201ENST00000293973 NEBP20929 6669 aa8.94□□□□□ -0.98
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa8.94□□□□□ -0.98
NTN3-201ENST00000293973 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.84□□□□□ -0.99
NTN3-201ENST00000293973 MT1GP13640 62 aa8.82□□□□□ -1
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.7□□□□□ -1.02
NTN3-201ENST00000293973 MT1MQ8N339 61 aa8.7□□□□□ -1.02
NTN3-201ENST00000293973 SPRR2DP22532 72 aa8.67□□□□□ -1.02
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.62□□□□□ -1.03
NTN3-201ENST00000293973 LCE3CQ5T5A8 94 aa8.61□□□□□ -1.03
NTN3-201ENST00000293973 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa8.57□□□□□ -1.04
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.5□□□□□ -1.05
NTN3-201ENST00000293973 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa8.41□□□□□ -1.06
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa8.39□□□□□ -1.07
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa8.39□□□□□ -1.07
NTN3-201ENST00000293973 LCE3BQ5TA77 95 aa8.37□□□□□ -1.07
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa8.17□□□□□ -1.1
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa8.17□□□□□ -1.1
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa8.13□□□□□ -1.11
NTN3-201ENST00000293973 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.11□□□□□ -1.11
NTN3-201ENST00000293973 INE1O15225 51 aa8.04□□□□□ -1.12
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.15
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.73□□□□□ -1.17
NTN3-201ENST00000293973 LCE4AQ5TA78 99 aa7.68□□□□□ -1.18
NTN3-201ENST00000293973 MT1AP04731 61 aa7.62□□□□□ -1.19
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.62□□□□□ -1.19
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NTN3-201ENST00000293973 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.55□□□□□ -1.2
NTN3-201ENST00000293973 LCE1DQ5T752 114 aa7.5□□□□□ -1.21
NTN3-201ENST00000293973 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP12-4P60329 112 aa7.44□□□□□ -1.22
NTN3-201ENST00000293973 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.44□□□□□ -1.22
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.42□□□□□ -1.22
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.28□□□□□ -1.24
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.24□□□□□ -1.25
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa7.04□□□□□ -1.28
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.99□□□□□ -1.29
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.94□□□□□ -1.3
NTN3-201ENST00000293973 MT3P25713 68 aa6.93□□□□□ -1.3
NTN3-201ENST00000293973 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.82□□□□□ -1.32
NTN3-201ENST00000293973 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.61□□□□□ -1.35
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.55□□□□□ -1.36
NTN3-201ENST00000293973 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.5□□□□□ -1.37
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.41□□□□□ -1.38
NTN3-201ENST00000293973 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.4□□□□□ -1.38
NTN3-201ENST00000293973 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.17□□□□□ -1.42
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP5-8O75690 187 aa6.17□□□□□ -1.42
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.15□□□□□ -1.42
NTN3-201ENST00000293973 LCE1EQ5T753 118 aa6.12□□□□□ -1.43
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa6.06□□□□□ -1.44
NTN3-201ENST00000293973 MUC5ACP98088 5654 aa5.88□□□□□ -1.47
NTN3-201ENST00000293973 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.74□□□□□ -1.49
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.73□□□□□ -1.49
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.7□□□□□ -1.5
NTN3-201ENST00000293973 LCE1CQ5T751 118 aa5.69□□□□□ -1.5
NTN3-201ENST00000293973 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
NTN3-201ENST00000293973 PRM1P04553 51 aa5.48□□□□□ -1.53
NTN3-201ENST00000293973 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.07□□□□□ -1.6
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.95□□□□□ -1.62
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.88□□□□□ -1.63
NTN3-201ENST00000293973 LCE1FQ5T754 118 aa4.68□□□□□ -1.66
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.43□□□□□ -1.7
NTN3-201ENST00000293973 PHGR1C9JFL3 82 aa4.36□□□□□ -1.71
NTN3-201ENST00000293973 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.94□□□□□ -1.78
NTN3-201ENST00000293973 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.49□□□□□ -1.85
NTN3-201ENST00000293973 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.76□□□□□ -1.97
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