RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285243.6

ANKRD40-201, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD40, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-201ENST00000285243 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ANKRD40-201ENST00000285243 KMT2DO14686 5537 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD40-201ENST00000285243 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40-201ENST00000285243 MT1LQ93083 61 aa6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40-201ENST00000285243 MT1EP04732 61 aa6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.36□□□□□ -1.39
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.32□□□□□ -1.4
ANKRD40-201ENST00000285243 SPRR2DP22532 72 aa6.3□□□□□ -1.4
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP12-4P60329 112 aa6.29□□□□□ -1.4
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.29□□□□□ -1.4
ANKRD40-201ENST00000285243 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.24□□□□□ -1.41
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD40-201ENST00000285243 MT1MQ8N339 61 aa6.13□□□□□ -1.43
ANKRD40-201ENST00000285243 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.09□□□□□ -1.43
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.09□□□□□ -1.43
ANKRD40-201ENST00000285243 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD40-201ENST00000285243 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.95□□□□□ -1.46
ANKRD40-201ENST00000285243 SSPOA2VEC9 5147 aa5.89□□□□□ -1.47
ANKRD40-201ENST00000285243 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
ANKRD40-201ENST00000285243 MT4P47944 62 aa5.84□□□□□ -1.47
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD40-201ENST00000285243 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.71□□□□□ -1.5
ANKRD40-201ENST00000285243 MDN1Q9NU22 5596 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD40-201ENST00000285243 MT3P25713 68 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-201ENST00000285243 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD40-201ENST00000285243 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD40-201ENST00000285243 PRM1P04553 51 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-201ENST00000285243 MT1AP04731 61 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
ANKRD40-201ENST00000285243 LCE1DQ5T752 114 aa5.41□□□□□ -1.54
ANKRD40-201ENST00000285243 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.39□□□□□ -1.55
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.3□□□□□ -1.56
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.29□□□□□ -1.56
ANKRD40-201ENST00000285243 MUC19Q7Z5P9 8384 aa5.23□□□□□ -1.57
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.09□□□□□ -1.59
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.07□□□□□ -1.6
ANKRD40-201ENST00000285243 NEBP20929 6669 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.92□□□□□ -1.62
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP5-9P26371 169 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD40-201ENST00000285243 LCE4AQ5TA78 99 aa4.79□□□□□ -1.64
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ANKRD40-201ENST00000285243 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD40-201ENST00000285243 MUC5ACP98088 5654 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD40-201ENST00000285243 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD40-201ENST00000285243 LCE1EQ5T753 118 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD40-201ENST00000285243 LCE1CQ5T751 118 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD40-201ENST00000285243 LCE1FQ5T754 118 aa4.32□□□□□ -1.72
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.18□□□□□ -1.74
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.06□□□□□ -1.76
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.97□□□□□ -1.77
ANKRD40-201ENST00000285243 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.93□□□□□ -1.78
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.59□□□□□ -1.83
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP5-8O75690 187 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD40-201ENST00000285243 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD40-201ENST00000285243 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.18□□□□□ -1.9
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.93□□□□□ -1.94
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.82□□□□□ -1.96
ANKRD40-201ENST00000285243 PHGR1C9JFL3 82 aa2.73□□□□□ -1.97
ANKRD40-201ENST00000285243 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.57□□□□□ -2
ANKRD40-201ENST00000285243 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.82□□□□□ -2.12
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