RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 TNXBP22105 4242 aa6.45□□□□□ -1.38
CCSAP-201ENST00000284617 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.37□□□□□ -1.39
CCSAP-201ENST00000284617 PRM1P04553 51 aa6.36□□□□□ -1.39
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.31□□□□□ -1.4
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.31□□□□□ -1.4
CCSAP-201ENST00000284617 MT4P47944 62 aa6.2□□□□□ -1.42
CCSAP-201ENST00000284617 MT1AP04731 61 aa6.19□□□□□ -1.42
CCSAP-201ENST00000284617 RNF213Q63HN8 5207 aa6.18□□□□□ -1.42
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.17□□□□□ -1.42
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.17□□□□□ -1.42
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.17□□□□□ -1.42
CCSAP-201ENST00000284617 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.17□□□□□ -1.42
CCSAP-201ENST00000284617 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CCSAP-201ENST00000284617 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.12□□□□□ -1.43
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.1□□□□□ -1.43
CCSAP-201ENST00000284617 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.07□□□□□ -1.44
CCSAP-201ENST00000284617 LCE1BQ5T7P3 118 aa6.07□□□□□ -1.44
CCSAP-201ENST00000284617 LCE1DQ5T752 114 aa6.06□□□□□ -1.44
CCSAP-201ENST00000284617 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.94□□□□□ -1.46
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.94□□□□□ -1.46
CCSAP-201ENST00000284617 MUC2Q02817 5179 aa5.87□□□□□ -1.47
CCSAP-201ENST00000284617 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.85□□□□□ -1.47
CCSAP-201ENST00000284617 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.83□□□□□ -1.48
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.81□□□□□ -1.48
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.74□□□□□ -1.49
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.72□□□□□ -1.49
CCSAP-201ENST00000284617 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.7□□□□□ -1.5
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.66□□□□□ -1.5
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.64□□□□□ -1.51
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.61□□□□□ -1.51
CCSAP-201ENST00000284617 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.54□□□□□ -1.52
CCSAP-201ENST00000284617 LCE4AQ5TA78 99 aa5.5□□□□□ -1.53
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.47□□□□□ -1.53
CCSAP-201ENST00000284617 USH2AO75445 5202 aa5.32□□□□□ -1.56
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
CCSAP-201ENST00000284617 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.29□□□□□ -1.56
CCSAP-201ENST00000284617 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CCSAP-201ENST00000284617 LCE1CQ5T751 118 aa5.09□□□□□ -1.59
CCSAP-201ENST00000284617 LCE1EQ5T753 118 aa5.09□□□□□ -1.59
CCSAP-201ENST00000284617 LCE1FQ5T754 118 aa5.09□□□□□ -1.59
CCSAP-201ENST00000284617 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP5-9P26371 169 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSAP-201ENST00000284617 KMT2DO14686 5537 aa4.83□□□□□ -1.64
CCSAP-201ENST00000284617 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.81□□□□□ -1.64
CCSAP-201ENST00000284617 SSPOA2VEC9 5147 aa4.72□□□□□ -1.65
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.71□□□□□ -1.66
CCSAP-201ENST00000284617 NEBP20929 6669 aa4.67□□□□□ -1.66
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.65□□□□□ -1.67
CCSAP-201ENST00000284617 MDN1Q9NU22 5596 aa4.65□□□□□ -1.67
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.61□□□□□ -1.67
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.61□□□□□ -1.67
CCSAP-201ENST00000284617 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.59□□□□□ -1.68
CCSAP-201ENST00000284617 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.5□□□□□ -1.69
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.72
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.26□□□□□ -1.73
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.19□□□□□ -1.74
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.09□□□□□ -1.76
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.09□□□□□ -1.76
CCSAP-201ENST00000284617 MUC5ACP98088 5654 aa3.86□□□□□ -1.79
CCSAP-201ENST00000284617 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.76□□□□□ -1.81
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.73□□□□□ -1.81
CCSAP-201ENST00000284617 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.65□□□□□ -1.83
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.5□□□□□ -1.85
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP5-8O75690 187 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-201ENST00000284617 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.1□□□□□ -1.91
CCSAP-201ENST00000284617 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-201ENST00000284617 PHGR1C9JFL3 82 aa3□□□□□ -1.93
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.93□□□□□ -1.94
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.76□□□□□ -1.97
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-201ENST00000284617 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.2 ms