RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
NICN1-201ENST00000273598 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.08□□□□□ -1.6
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.07□□□□□ -1.6
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5□□□□□ -1.61
NICN1-201ENST00000273598 MUC12Q9UKN1 5478 aa5□□□□□ -1.61
NICN1-201ENST00000273598 MT1GP13640 62 aa4.97□□□□□ -1.61
NICN1-201ENST00000273598 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.94□□□□□ -1.62
NICN1-201ENST00000273598 MT1MQ8N339 61 aa4.92□□□□□ -1.62
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.91□□□□□ -1.62
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.89□□□□□ -1.63
NICN1-201ENST00000273598 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.88□□□□□ -1.63
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP5-9P26371 169 aa4.85□□□□□ -1.63
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.84□□□□□ -1.63
NICN1-201ENST00000273598 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.77□□□□□ -1.65
NICN1-201ENST00000273598 A0A0A0MQY5 61 aa4.76□□□□□ -1.65
NICN1-201ENST00000273598 SPRR2EP22531 72 aa4.76□□□□□ -1.65
NICN1-201ENST00000273598 SPRR2BP35325 72 aa4.76□□□□□ -1.65
NICN1-201ENST00000273598 SPRR2AP35326 72 aa4.76□□□□□ -1.65
NICN1-201ENST00000273598 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
NICN1-201ENST00000273598 MDN1Q9NU22 5596 aa4.72□□□□□ -1.65
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.59□□□□□ -1.67
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.59□□□□□ -1.67
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.59□□□□□ -1.67
NICN1-201ENST00000273598 SPRR2DP22532 72 aa4.57□□□□□ -1.68
NICN1-201ENST00000273598 NEBP20929 6669 aa4.55□□□□□ -1.68
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.37□□□□□ -1.71
NICN1-201ENST00000273598 LCE3BQ5TA77 95 aa4.37□□□□□ -1.71
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
NICN1-201ENST00000273598 INE1O15225 51 aa4.36□□□□□ -1.71
NICN1-201ENST00000273598 MT1AP04731 61 aa4.36□□□□□ -1.71
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.31□□□□□ -1.72
NICN1-201ENST00000273598 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.18□□□□□ -1.74
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.18□□□□□ -1.74
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.17□□□□□ -1.74
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.13□□□□□ -1.75
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.1□□□□□ -1.75
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP12-4P60329 112 aa4.09□□□□□ -1.75
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.08□□□□□ -1.76
NICN1-201ENST00000273598 LCE1DQ5T752 114 aa4.03□□□□□ -1.76
NICN1-201ENST00000273598 MT4P47944 62 aa4.01□□□□□ -1.77
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.01□□□□□ -1.77
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4□□□□□ -1.77
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.99□□□□□ -1.77
NICN1-201ENST00000273598 LCE4AQ5TA78 99 aa3.98□□□□□ -1.77
NICN1-201ENST00000273598 MT3P25713 68 aa3.97□□□□□ -1.77
NICN1-201ENST00000273598 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.97□□□□□ -1.77
NICN1-201ENST00000273598 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.87□□□□□ -1.79
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.86□□□□□ -1.79
NICN1-201ENST00000273598 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.82□□□□□ -1.8
NICN1-201ENST00000273598 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.75□□□□□ -1.81
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.73□□□□□ -1.81
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.72□□□□□ -1.81
NICN1-201ENST00000273598 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.67□□□□□ -1.82
NICN1-201ENST00000273598 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
NICN1-201ENST00000273598 PRM1P04553 51 aa3.48□□□□□ -1.85
NICN1-201ENST00000273598 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.47□□□□□ -1.85
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.41□□□□□ -1.86
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.39□□□□□ -1.87
NICN1-201ENST00000273598 LCE1EQ5T753 118 aa3.35□□□□□ -1.87
NICN1-201ENST00000273598 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
NICN1-201ENST00000273598 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.28□□□□□ -1.88
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.23□□□□□ -1.89
NICN1-201ENST00000273598 MUC5ACP98088 5654 aa3.17□□□□□ -1.9
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP5-8O75690 187 aa3.16□□□□□ -1.9
NICN1-201ENST00000273598 LCE1CQ5T751 118 aa3.14□□□□□ -1.91
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.83□□□□□ -1.96
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.74□□□□□ -1.97
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.6□□□□□ -1.99
NICN1-201ENST00000273598 LCE1FQ5T754 118 aa2.4□□□□□ -2.03
NICN1-201ENST00000273598 PHGR1C9JFL3 82 aa2.37□□□□□ -2.03
NICN1-201ENST00000273598 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.27□□□□□ -2.05
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.1□□□□□ -2.07
NICN1-201ENST00000273598 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.52□□□□□ -2.17
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