RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261893.8

LACTB-201, Transcript of lactamase beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LACTB, Length 1,972 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.82□□□□□ -1
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa8.77□□□□□ -1.01
LACTB-201ENST00000261893 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa8.63□□□□□ -1.03
LACTB-201ENST00000261893 MT1GP13640 62 aa8.61□□□□□ -1.03
LACTB-201ENST00000261893 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.56□□□□□ -1.04
LACTB-201ENST00000261893 MT1MQ8N339 61 aa8.53□□□□□ -1.04
LACTB-201ENST00000261893 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.5□□□□□ -1.05
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP5-9P26371 169 aa8.5□□□□□ -1.05
LACTB-201ENST00000261893 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.41□□□□□ -1.06
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.41□□□□□ -1.06
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.39□□□□□ -1.07
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa8.37□□□□□ -1.07
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa8.37□□□□□ -1.07
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa8.37□□□□□ -1.07
LACTB-201ENST00000261893 INE1O15225 51 aa8.28□□□□□ -1.08
LACTB-201ENST00000261893 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.25□□□□□ -1.09
LACTB-201ENST00000261893 MDN1Q9NU22 5596 aa8.24□□□□□ -1.09
LACTB-201ENST00000261893 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.22□□□□□ -1.09
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.19□□□□□ -1.1
LACTB-201ENST00000261893 SPRR2EP22531 72 aa8.13□□□□□ -1.11
LACTB-201ENST00000261893 SPRR2BP35325 72 aa8.13□□□□□ -1.11
LACTB-201ENST00000261893 SPRR2AP35326 72 aa8.13□□□□□ -1.11
LACTB-201ENST00000261893 SPRR2DP22532 72 aa7.83□□□□□ -1.16
LACTB-201ENST00000261893 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
LACTB-201ENST00000261893 NEBP20929 6669 aa7.77□□□□□ -1.17
LACTB-201ENST00000261893 MT1AP04731 61 aa7.64□□□□□ -1.19
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.59□□□□□ -1.2
LACTB-201ENST00000261893 LCE3BQ5TA77 95 aa7.55□□□□□ -1.2
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.23□□□□□ -1.25
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP12-4P60329 112 aa7.22□□□□□ -1.25
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.22□□□□□ -1.25
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.19□□□□□ -1.26
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.19□□□□□ -1.26
LACTB-201ENST00000261893 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.08□□□□□ -1.28
LACTB-201ENST00000261893 LCE3DQ9BYE3 92 aa7.03□□□□□ -1.28
LACTB-201ENST00000261893 LCE4AQ5TA78 99 aa6.93□□□□□ -1.3
LACTB-201ENST00000261893 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.91□□□□□ -1.3
LACTB-201ENST00000261893 MT3P25713 68 aa6.9□□□□□ -1.3
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.89□□□□□ -1.31
LACTB-201ENST00000261893 MT4P47944 62 aa6.84□□□□□ -1.32
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.81□□□□□ -1.32
LACTB-201ENST00000261893 LCE1DQ5T752 114 aa6.74□□□□□ -1.33
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.62□□□□□ -1.35
LACTB-201ENST00000261893 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.62□□□□□ -1.35
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.47□□□□□ -1.37
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.4□□□□□ -1.38
LACTB-201ENST00000261893 PRM1P04553 51 aa6.29□□□□□ -1.4
LACTB-201ENST00000261893 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.21□□□□□ -1.42
LACTB-201ENST00000261893 LCE1EQ5T753 118 aa5.85□□□□□ -1.47
LACTB-201ENST00000261893 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.84□□□□□ -1.47
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.78□□□□□ -1.48
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.64□□□□□ -1.51
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP5-8O75690 187 aa5.57□□□□□ -1.52
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.57□□□□□ -1.52
LACTB-201ENST00000261893 MUC5ACP98088 5654 aa5.57□□□□□ -1.52
LACTB-201ENST00000261893 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.51□□□□□ -1.53
LACTB-201ENST00000261893 LCE1CQ5T751 118 aa5.47□□□□□ -1.53
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.44□□□□□ -1.54
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.35□□□□□ -1.55
LACTB-201ENST00000261893 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.3□□□□□ -1.56
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5□□□□□ -1.61
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.95□□□□□ -1.62
LACTB-201ENST00000261893 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.76□□□□□ -1.65
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.49□□□□□ -1.69
LACTB-201ENST00000261893 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.37□□□□□ -1.71
LACTB-201ENST00000261893 LCE1FQ5T754 118 aa4.22□□□□□ -1.73
LACTB-201ENST00000261893 PHGR1C9JFL3 82 aa4.09□□□□□ -1.76
LACTB-201ENST00000261893 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.95□□□□□ -1.78
LACTB-201ENST00000261893 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.7□□□□□ -1.82
LACTB-201ENST00000261893 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms