RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261507.10

MSMO1-201, Transcript of methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSMO1, Length 2,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1-201ENST00000261507 A0A0A0MQY5 61 aa5.24□□□□□ -1.57
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.23□□□□□ -1.57
MSMO1-201ENST00000261507 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.21□□□□□ -1.58
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.08□□□□□ -1.6
MSMO1-201ENST00000261507 SPRR2EP22531 72 aa5.06□□□□□ -1.6
MSMO1-201ENST00000261507 SPRR2BP35325 72 aa5.06□□□□□ -1.6
MSMO1-201ENST00000261507 SPRR2AP35326 72 aa5.06□□□□□ -1.6
MSMO1-201ENST00000261507 MT1EP04732 61 aa5.04□□□□□ -1.6
MSMO1-201ENST00000261507 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.03□□□□□ -1.6
MSMO1-201ENST00000261507 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.02□□□□□ -1.61
MSMO1-201ENST00000261507 NEBP20929 6669 aa5□□□□□ -1.61
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.98□□□□□ -1.61
MSMO1-201ENST00000261507 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.96□□□□□ -1.62
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.94□□□□□ -1.62
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.93□□□□□ -1.62
MSMO1-201ENST00000261507 MDN1Q9NU22 5596 aa4.9□□□□□ -1.62
MSMO1-201ENST00000261507 MT1GP13640 62 aa4.9□□□□□ -1.63
MSMO1-201ENST00000261507 SPRR2DP22532 72 aa4.89□□□□□ -1.63
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.89□□□□□ -1.63
MSMO1-201ENST00000261507 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.88□□□□□ -1.63
MSMO1-201ENST00000261507 MT1LQ93083 61 aa4.88□□□□□ -1.63
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.82□□□□□ -1.64
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.82□□□□□ -1.64
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.82□□□□□ -1.64
MSMO1-201ENST00000261507 INE1O15225 51 aa4.77□□□□□ -1.65
MSMO1-201ENST00000261507 MT1MQ8N339 61 aa4.77□□□□□ -1.65
MSMO1-201ENST00000261507 LCE3BQ5TA77 95 aa4.72□□□□□ -1.65
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.72□□□□□ -1.65
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.69□□□□□ -1.66
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.69□□□□□ -1.66
MSMO1-201ENST00000261507 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.49□□□□□ -1.69
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.49□□□□□ -1.69
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.43□□□□□ -1.7
MSMO1-201ENST00000261507 LCE4AQ5TA78 99 aa4.4□□□□□ -1.71
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.4□□□□□ -1.71
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.34□□□□□ -1.72
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.32□□□□□ -1.72
MSMO1-201ENST00000261507 LCE1DQ5T752 114 aa4.29□□□□□ -1.72
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.25□□□□□ -1.73
MSMO1-201ENST00000261507 MT4P47944 62 aa4.2□□□□□ -1.74
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP12-4P60329 112 aa4.2□□□□□ -1.74
MSMO1-201ENST00000261507 MT1AP04731 61 aa4.19□□□□□ -1.74
MSMO1-201ENST00000261507 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.16□□□□□ -1.74
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.05□□□□□ -1.76
MSMO1-201ENST00000261507 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.04□□□□□ -1.76
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.96□□□□□ -1.78
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.87□□□□□ -1.79
MSMO1-201ENST00000261507 MT3P25713 68 aa3.84□□□□□ -1.79
MSMO1-201ENST00000261507 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.84□□□□□ -1.79
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.83□□□□□ -1.8
MSMO1-201ENST00000261507 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.8□□□□□ -1.8
MSMO1-201ENST00000261507 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.79□□□□□ -1.8
MSMO1-201ENST00000261507 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.77□□□□□ -1.81
MSMO1-201ENST00000261507 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.72□□□□□ -1.81
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.71□□□□□ -1.82
MSMO1-201ENST00000261507 PRM1P04553 51 aa3.58□□□□□ -1.84
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.56□□□□□ -1.84
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP5-8O75690 187 aa3.46□□□□□ -1.85
MSMO1-201ENST00000261507 LCE1EQ5T753 118 aa3.45□□□□□ -1.86
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.36□□□□□ -1.87
MSMO1-201ENST00000261507 MUC5ACP98088 5654 aa3.25□□□□□ -1.89
MSMO1-201ENST00000261507 LCE1CQ5T751 118 aa3.18□□□□□ -1.9
MSMO1-201ENST00000261507 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.18□□□□□ -1.9
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
MSMO1-201ENST00000261507 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
MSMO1-201ENST00000261507 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.84□□□□□ -1.96
MSMO1-201ENST00000261507 LCE1FQ5T754 118 aa2.72□□□□□ -1.97
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.69□□□□□ -1.98
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.57□□□□□ -2
MSMO1-201ENST00000261507 PHGR1C9JFL3 82 aa2.42□□□□□ -2.02
MSMO1-201ENST00000261507 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.33□□□□□ -2.04
MSMO1-201ENST00000261507 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.23□□□□□ -2.05
MSMO1-201ENST00000261507 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 664.1 ms