RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.98□□□□□ -1.45
HOXA13-201ENST00000222753 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.97□□□□□ -1.45
HOXA13-201ENST00000222753 RNF213Q63HN8 5207 aa5.93□□□□□ -1.46
HOXA13-201ENST00000222753 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.78□□□□□ -1.48
HOXA13-201ENST00000222753 MT1MQ8N339 61 aa5.76□□□□□ -1.49
HOXA13-201ENST00000222753 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.73□□□□□ -1.49
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.73□□□□□ -1.49
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.73□□□□□ -1.49
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.73□□□□□ -1.49
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXA13-201ENST00000222753 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.67□□□□□ -1.5
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HOXA13-201ENST00000222753 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.61□□□□□ -1.51
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HOXA13-201ENST00000222753 MT4P47944 62 aa5.49□□□□□ -1.53
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.46□□□□□ -1.53
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HOXA13-201ENST00000222753 MT1AP04731 61 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.38□□□□□ -1.55
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HOXA13-201ENST00000222753 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
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HOXA13-201ENST00000222753 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.28□□□□□ -1.56
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HOXA13-201ENST00000222753 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.06□□□□□ -1.6
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HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.94□□□□□ -1.62
HOXA13-201ENST00000222753 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.9□□□□□ -1.63
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HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.88□□□□□ -1.63
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
HOXA13-201ENST00000222753 SSPOA2VEC9 5147 aa4.7□□□□□ -1.66
HOXA13-201ENST00000222753 LCE1CQ5T751 118 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXA13-201ENST00000222753 LCE1EQ5T753 118 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXA13-201ENST00000222753 LCE1FQ5T754 118 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXA13-201ENST00000222753 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
HOXA13-201ENST00000222753 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.57□□□□□ -1.68
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP5-9P26371 169 aa4.43□□□□□ -1.7
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.41□□□□□ -1.7
HOXA13-201ENST00000222753 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.36□□□□□ -1.71
HOXA13-201ENST00000222753 MDN1Q9NU22 5596 aa4.29□□□□□ -1.72
HOXA13-201ENST00000222753 NEBP20929 6669 aa4.26□□□□□ -1.73
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.14□□□□□ -1.75
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.1□□□□□ -1.75
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HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.78□□□□□ -1.8
HOXA13-201ENST00000222753 MUC5ACP98088 5654 aa3.68□□□□□ -1.82
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.67□□□□□ -1.82
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.54□□□□□ -1.84
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.54□□□□□ -1.84
HOXA13-201ENST00000222753 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.51□□□□□ -1.85
HOXA13-201ENST00000222753 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.51□□□□□ -1.85
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.33□□□□□ -1.88
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.24□□□□□ -1.89
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.11□□□□□ -1.91
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP5-8O75690 187 aa3.07□□□□□ -1.92
HOXA13-201ENST00000222753 PHGR1C9JFL3 82 aa2.89□□□□□ -1.95
HOXA13-201ENST00000222753 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
HOXA13-201ENST00000222753 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.76□□□□□ -1.97
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.74□□□□□ -1.97
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.71□□□□□ -1.98
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.68□□□□□ -1.98
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.21□□□□□ -2.06
HOXA13-201ENST00000222753 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.61□□□□□ -2.15
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