RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP18-201ENST00000215794 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.41□□□□□ -1.38
USP18-201ENST00000215794 MDN1Q9NU22 5596 aa6.4□□□□□ -1.38
USP18-201ENST00000215794 KRTAP5-9P26371 169 aa6.39□□□□□ -1.39
USP18-201ENST00000215794 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.38□□□□□ -1.39
USP18-201ENST00000215794 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.38□□□□□ -1.39
USP18-201ENST00000215794 MT1LQ93083 61 aa6.37□□□□□ -1.39
USP18-201ENST00000215794 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.3□□□□□ -1.4
USP18-201ENST00000215794 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.21□□□□□ -1.42
USP18-201ENST00000215794 SPRR2EP22531 72 aa6.2□□□□□ -1.42
USP18-201ENST00000215794 SPRR2BP35325 72 aa6.2□□□□□ -1.42
USP18-201ENST00000215794 SPRR2AP35326 72 aa6.2□□□□□ -1.42
USP18-201ENST00000215794 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.19□□□□□ -1.42
USP18-201ENST00000215794 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.15□□□□□ -1.42
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USP18-201ENST00000215794 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.08□□□□□ -1.44
USP18-201ENST00000215794 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.07□□□□□ -1.44
USP18-201ENST00000215794 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
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USP18-201ENST00000215794 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.97□□□□□ -1.45
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USP18-201ENST00000215794 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.9□□□□□ -1.47
USP18-201ENST00000215794 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.9□□□□□ -1.47
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USP18-201ENST00000215794 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.27□□□□□ -1.57
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USP18-201ENST00000215794 MT3P25713 68 aa4.8□□□□□ -1.64
USP18-201ENST00000215794 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.8□□□□□ -1.64
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USP18-201ENST00000215794 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.95□□□□□ -1.78
USP18-201ENST00000215794 LCE1FQ5T754 118 aa3.95□□□□□ -1.78
USP18-201ENST00000215794 LCE1CQ5T751 118 aa3.86□□□□□ -1.79
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USP18-201ENST00000215794 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.43□□□□□ -1.86
USP18-201ENST00000215794 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.21□□□□□ -1.9
USP18-201ENST00000215794 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.02□□□□□ -1.93
USP18-201ENST00000215794 PHGR1C9JFL3 82 aa2.98□□□□□ -1.93
USP18-201ENST00000215794 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.86□□□□□ -1.95
USP18-201ENST00000215794 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.87□□□□□ -2.11
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