RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MUC1-222	ENST00000610468	C5orf47	Q569G3	176 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MUC1-222	ENST00000610468		H3BPC8	53 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MUC1-222	ENST00000610468	NDUFS5	O43920	106 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MUC1-222	ENST00000610468	MP68	P56378	58 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MUC1-222	ENST00000610468	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MUC1-222	ENST00000610468	C20orf197	Q8N268	126 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM258	P61165	79 aa		6.51	□□□□□ -1.37
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MUC1-222	ENST00000610468	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV2-30	P06310	120 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MUC1-222	ENST00000610468	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		6.43	□□□□□ -1.38
MUC1-222	ENST00000610468	NEB	P20929	6669 aa		6.43	□□□□□ -1.38
MUC1-222	ENST00000610468		H7BZZ5	65 aa		6.42	□□□□□ -1.38
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		6.42	□□□□□ -1.38
MUC1-222	ENST00000610468		H0Y9P7	68 aa		6.41	□□□□□ -1.38
MUC1-222	ENST00000610468	SNURF	Q9Y675	71 aa		6.39	□□□□□ -1.39
MUC1-222	ENST00000610468	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		6.38	□□□□□ -1.39
MUC1-222	ENST00000610468	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		6.37	□□□□□ -1.39
MUC1-222	ENST00000610468	C4orf26	Q17RF5	130 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00208	Q96KT6	92 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MUC1-222	ENST00000610468	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MUC1-222	ENST00000610468	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MUC1-222	ENST00000610468	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MUC1-222	ENST00000610468	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
MUC1-222	ENST00000610468	MT1B	P07438	61 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MUC1-222	ENST00000610468		A6NN06	94 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MUC1-222	ENST00000610468	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MUC1-222	ENST00000610468	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MUC1-222	ENST00000610468	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MUC1-222	ENST00000610468		Q5VV11	94 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP10-5	P60370	271 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MUC1-222	ENST00000610468		S4R3F8	94 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MUC1-222	ENST00000610468	CSAG1	Q6PB30	78 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP5-9	P26371	169 aa		6.19	□□□□□ -1.42
MUC1-222	ENST00000610468	LCA10	Q71F78	164 aa		6.18	□□□□□ -1.42
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		6.17	□□□□□ -1.42
MUC1-222	ENST00000610468	KMT2D	O14686	5537 aa		6.17	□□□□□ -1.42
MUC1-222	ENST00000610468	MDN1	Q9NU22	5596 aa		6.15	□□□□□ -1.43
MUC1-222	ENST00000610468		A8MUN3	132 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MUC1-222	ENST00000610468	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MUC1-222	ENST00000610468	DMAC1	Q96GE9	116 aa		6.11	□□□□□ -1.43
MUC1-222	ENST00000610468	ACYP2	P14621	99 aa		6.09	□□□□□ -1.43
MUC1-222	ENST00000610468	CRIPT	Q9P021	101 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MUC1-222	ENST00000610468		V9GYY9	64 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MUC1-222	ENST00000610468	COA5	Q86WW8	74 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MUC1-222	ENST00000610468	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MUC1-222	ENST00000610468		Q1T7F1	81 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MUC1-222	ENST00000610468	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MUC1-222	ENST00000610468		H0YAA0	97 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MUC1-222	ENST00000610468	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MUC1-222	ENST00000610468	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		5.89	□□□□□ -1.47
MUC1-222	ENST00000610468	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MUC1-222	ENST00000610468	SPRR2E	P22531	72 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MUC1-222	ENST00000610468	SPRR2B	P35325	72 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MUC1-222	ENST00000610468	SPRR2A	P35326	72 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MUC1-222	ENST00000610468	MT1X	P80297	61 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MUC1-222	ENST00000610468	PRR15L	Q9BU68	103 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MUC1-222	ENST00000610468	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MUC1-222	ENST00000610468	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MUC1-222	ENST00000610468		P0C880	135 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MUC1-222	ENST00000610468	SEC61G	P60059	68 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MUC1-222	ENST00000610468	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP12-2	P59991	146 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1B0GU69	56 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MUC1-222	ENST00000610468	PSPHP1	O15172	72 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MUC1-222	ENST00000610468	PLAC4	Q8WY50	150 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MUC1-222	ENST00000610468		R4GN34	69 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MUC1-222	ENST00000610468		A6NED7	52 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MUC1-222	ENST00000610468	SPRR2D	P22532	72 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MUC1-222	ENST00000610468		H3BS24	57 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MUC1-222	ENST00000610468	UQCR11	O14957	56 aa		5.64	□□□□□ -1.51
MUC1-222	ENST00000610468	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.63	□□□□□ -1.51
MUC1-222	ENST00000610468		M0QZ58	72 aa		5.62	□□□□□ -1.51
MUC1-222	ENST00000610468	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.62	□□□□□ -1.51
MUC1-222	ENST00000610468	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.61	□□□□□ -1.51
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP10-12	P60413	245 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1B0GU33	70 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MUC1-222	ENST00000610468	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MUC1-222	ENST00000610468	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MUC1-222	ENST00000610468	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MUC1-222	ENST00000610468	LINC01554	Q52M75	96 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MUC1-222	ENST00000610468	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		5.43	□□□□□ -1.54
MUC1-222	ENST00000610468		K7ERS5	55 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MUC1-222	ENST00000610468	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.35	□□□□□ -1.55
MUC1-222	ENST00000610468	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
MUC1-222	ENST00000610468		A8MU10	97 aa		5.33	□□□□□ -1.56

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