RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591994.1

RPRD1A-210, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, humanhuman

TSL 2

Gene RPRD1A, Length 2,484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1A-210ENST00000591994 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-0.24□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 ARMS2P0C7Q2 107 aa-0.24□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 PKIAP61925 76 aa-0.24□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 ALKAL2Q6UX46 152 aa-0.24□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 DPY30Q9C005 99 aa-0.24□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 H3BSH0 61 aa-0.25□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-0.25□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-0.25□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 VPS13AQ96RL7 3174 aa-0.25□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa-0.25□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 CCL22O00626 93 aa-0.25□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 DEFB4AO15263 64 aa-0.25□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 S100A10P60903 97 aa-0.25□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 LINC01556Q5JQF7 62 aa-0.25□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 SMIM5Q71RC9 77 aa-0.25□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 LEAP2Q969E1 77 aa-0.25□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 H3BUA1 57 aa-0.26□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 I3L3M4 83 aa-0.26□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-0.26□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 M0R1W7 72 aa-0.26□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 GNGT1P63211 74 aa-0.26□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 DEFB133Q30KQ1 61 aa-0.26□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-0.26□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 ETDBQ3ZM63 59 aa-0.27□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-0.27□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 WFDC13Q8IUB5 93 aa-0.27□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 H3BUX3 64 aa-0.27□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-0.27□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-0.28□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-0.28□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 UQCRHLA0A096LP55 91 aa-0.28□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 LINC01546A6NGU7 62 aa-0.28□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 M0R143 59 aa-0.28□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 DEFB135Q30KP9 77 aa-0.28□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 IQCF6A8MYZ5 107 aa-0.28□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 F8WEM9 126 aa-0.28□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 S100A8P05109 93 aa-0.28□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.28□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 PSENENQ9NZ42 101 aa-0.28□□□□□ -2.45
RPRD1A-210ENST00000591994 MUC3AQ02505 3323 aa-0.29□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-0.29□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 CDH23Q9H251 3354 aa-0.29□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 GYPAP02724 150 aa-0.29□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 C3orf79P0CE67 100 aa-0.29□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-0.29□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 KAAG1Q9UBP8 84 aa-0.29□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 D6R8Y8 96 aa-0.3□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 IGLC2P0DOY2 106 aa-0.3□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 IGLC3P0DOY3 106 aa-0.3□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 DEFB114Q30KQ6 69 aa-0.3□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 MUSTN1Q8IVN3 82 aa-0.3□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 SNHG12Q9BXW3 62 aa-0.3□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 UTRNP46939 3433 aa-0.3□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 A0A087WWC5 75 aa-0.3□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 NMSQ5H8A3 153 aa-0.3□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 LEPROTL1O95214 131 aa-0.31□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 FAUP35544 74 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 HIGD1BQ9P298 99 aa-0.31□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-0.31□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 DMDP11532 3685 aa-0.32□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 A0A096LPF7 62 aa-0.32□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 TNP1P09430 55 aa-0.32□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 COX7BP24311 80 aa-0.32□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 SMIM11AP58511 58 aa-0.32□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 XIRP2A4UGR9 3374 aa-0.33□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 ASPMQ8IZT6 3477 aa-0.33□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 C20orf78Q9BR46 151 aa-0.33□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 A0A1B0GUT8 65 aa-0.33□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 A8MTW9 85 aa-0.33□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 PLGLAQ15195 96 aa-0.33□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 PEA15Q15121 130 aa-0.34□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 S4R3F8 94 aa-0.34□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 PYY3Q5JQD4 70 aa-0.35□□□□□ -2.46
RPRD1A-210ENST00000591994 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-0.35□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 HTN3P15516 51 aa-0.35□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 A0A096LNI7 61 aa-0.36□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 M0QZ58 72 aa-0.36□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 HEPN1Q6WQI6 88 aa-0.36□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 RABAC1Q9UI14 185 aa-0.36□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 CYB5AP00167 134 aa-0.36□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 WFDC10BQ8IUB3 73 aa-0.36□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-0.37□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-0.37□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 H0YGG7 62 aa-0.37□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 IFI6P09912 130 aa-0.37□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 PRCDQ00LT1 54 aa-0.37□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-0.37□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 V9GYS6 101 aa-0.37□□□□□ -2.47
RPRD1A-210ENST00000591994 PRLHP81277 87 aa-0.38□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms