RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 A8MUU9 505 aa4.82□□□□□ -1.64
SMAD3-215ENST00000560424 NDUFS5O43920 106 aa4.82□□□□□ -1.64
SMAD3-215ENST00000560424 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.81□□□□□ -1.64
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SMAD3-215ENST00000560424 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.8□□□□□ -1.64
SMAD3-215ENST00000560424 Q75L30 129 aa4.8□□□□□ -1.64
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SMAD3-215ENST00000560424 A8MUN3 132 aa4.56□□□□□ -1.68
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SMAD3-215ENST00000560424 Q5VV11 94 aa4.46□□□□□ -1.7
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SMAD3-215ENST00000560424 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.42□□□□□ -1.7
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SMAD3-215ENST00000560424 H0YAA0 97 aa4.26□□□□□ -1.73
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SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.24□□□□□ -1.73
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.24□□□□□ -1.73
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SMAD3-215ENST00000560424 K7ERS5 55 aa4.17□□□□□ -1.74
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SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.09□□□□□ -1.75
SMAD3-215ENST00000560424 M0QZ58 72 aa4.08□□□□□ -1.76
SMAD3-215ENST00000560424 CRIPTQ9P021 101 aa4.07□□□□□ -1.76
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.06□□□□□ -1.76
SMAD3-215ENST00000560424 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.05□□□□□ -1.76
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SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.04□□□□□ -1.76
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.01□□□□□ -1.77
SMAD3-215ENST00000560424 R4GN34 69 aa4.01□□□□□ -1.77
SMAD3-215ENST00000560424 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.98□□□□□ -1.77
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.93□□□□□ -1.78
SMAD3-215ENST00000560424 A0A0D9SG42 100 aa3.92□□□□□ -1.78
SMAD3-215ENST00000560424 PRAC1Q96KF2 57 aa3.91□□□□□ -1.78
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