RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 NDUFS5O43920 106 aa3.68□□□□□ -1.82
RBBP4-211ENST00000477563 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.67□□□□□ -1.82
RBBP4-211ENST00000477563 ACYP1P07311 99 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-211ENST00000477563 ETDBQ3ZM63 59 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-211ENST00000477563 Q8N9L7 120 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-211ENST00000477563 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.66□□□□□ -1.82
RBBP4-211ENST00000477563 MDN1Q9NU22 5596 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-211ENST00000477563 PCP4L1A6NKN8 68 aa3.65□□□□□ -1.83
RBBP4-211ENST00000477563 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.64□□□□□ -1.83
RBBP4-211ENST00000477563 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa3.64□□□□□ -1.83
RBBP4-211ENST00000477563 Q5W150 140 aa3.64□□□□□ -1.83
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.6□□□□□ -1.83
RBBP4-211ENST00000477563 KMT2DO14686 5537 aa3.58□□□□□ -1.84
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.57□□□□□ -1.84
RBBP4-211ENST00000477563 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.56□□□□□ -1.84
RBBP4-211ENST00000477563 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP5-9P26371 169 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-211ENST00000477563 C4orf26Q17RF5 130 aa3.55□□□□□ -1.84
RBBP4-211ENST00000477563 ATOX1O00244 68 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-211ENST00000477563 LINC00643Q86TS7 51 aa3.54□□□□□ -1.84
RBBP4-211ENST00000477563 UQCRQO14949 82 aa3.53□□□□□ -1.84
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RBBP4-211ENST00000477563 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.52□□□□□ -1.85
RBBP4-211ENST00000477563 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.52□□□□□ -1.85
RBBP4-211ENST00000477563 A6NN06 94 aa3.51□□□□□ -1.85
RBBP4-211ENST00000477563 J3QR89 54 aa3.51□□□□□ -1.85
RBBP4-211ENST00000477563 S4R3F8 94 aa3.51□□□□□ -1.85
RBBP4-211ENST00000477563 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RBBP4-211ENST00000477563 MT1BP07438 61 aa3.49□□□□□ -1.85
RBBP4-211ENST00000477563 CSAG1Q6PB30 78 aa3.49□□□□□ -1.85
RBBP4-211ENST00000477563 A0A1B0GV90 55 aa3.48□□□□□ -1.85
RBBP4-211ENST00000477563 A8MUN3 132 aa3.47□□□□□ -1.85
RBBP4-211ENST00000477563 H0Y9P7 68 aa3.47□□□□□ -1.85
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.47□□□□□ -1.85
RBBP4-211ENST00000477563 MT3P25713 68 aa3.47□□□□□ -1.85
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP10-5P60370 271 aa3.47□□□□□ -1.85
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.47□□□□□ -1.85
RBBP4-211ENST00000477563 LCA10Q71F78 164 aa3.47□□□□□ -1.85
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.47□□□□□ -1.85
RBBP4-211ENST00000477563 A0A087WVE0 104 aa3.45□□□□□ -1.86
RBBP4-211ENST00000477563 H3BPC8 53 aa3.45□□□□□ -1.86
RBBP4-211ENST00000477563 C5orf47Q569G3 176 aa3.45□□□□□ -1.86
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.45□□□□□ -1.86
RBBP4-211ENST00000477563 OCR1Q9BZK8 76 aa3.45□□□□□ -1.86
RBBP4-211ENST00000477563 MP68P56378 58 aa3.44□□□□□ -1.86
RBBP4-211ENST00000477563 Q5VV11 94 aa3.44□□□□□ -1.86
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RBBP4-211ENST00000477563 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.44□□□□□ -1.86
RBBP4-211ENST00000477563 H0YAA0 97 aa3.43□□□□□ -1.86
RBBP4-211ENST00000477563 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa3.42□□□□□ -1.86
RBBP4-211ENST00000477563 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.42□□□□□ -1.86
RBBP4-211ENST00000477563 IMUPQ9GZP8 106 aa3.42□□□□□ -1.86
RBBP4-211ENST00000477563 CRIPTQ9P021 101 aa3.42□□□□□ -1.86
RBBP4-211ENST00000477563 KLKP1Q107X0 134 aa3.4□□□□□ -1.87
RBBP4-211ENST00000477563 LINC00208Q96KT6 92 aa3.4□□□□□ -1.87
RBBP4-211ENST00000477563 NDUFC1O43677 76 aa3.39□□□□□ -1.87
RBBP4-211ENST00000477563 K7ERU9 68 aa3.38□□□□□ -1.87
RBBP4-211ENST00000477563 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.37□□□□□ -1.87
RBBP4-211ENST00000477563 SCGB1A1P11684 91 aa3.36□□□□□ -1.87
RBBP4-211ENST00000477563 LCE1EQ5T753 118 aa3.36□□□□□ -1.87
RBBP4-211ENST00000477563 DMAC1Q96GE9 116 aa3.35□□□□□ -1.87
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.35□□□□□ -1.87
RBBP4-211ENST00000477563 SPRR2EP22531 72 aa3.33□□□□□ -1.88
RBBP4-211ENST00000477563 SPRR2BP35325 72 aa3.33□□□□□ -1.88
RBBP4-211ENST00000477563 SPRR2AP35326 72 aa3.33□□□□□ -1.88
RBBP4-211ENST00000477563 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.31□□□□□ -1.88
RBBP4-211ENST00000477563 C20orf197Q8N268 126 aa3.31□□□□□ -1.88
RBBP4-211ENST00000477563 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.31□□□□□ -1.88
RBBP4-211ENST00000477563 MT-ATP8P03928 68 aa3.29□□□□□ -1.88
RBBP4-211ENST00000477563 PRAC1Q96KF2 57 aa3.28□□□□□ -1.88
RBBP4-211ENST00000477563 NDUFAF8A1L188 74 aa3.27□□□□□ -1.89
RBBP4-211ENST00000477563 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.27□□□□□ -1.89
RBBP4-211ENST00000477563 ACYP2P14621 99 aa3.26□□□□□ -1.89
RBBP4-211ENST00000477563 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.25□□□□□ -1.89
RBBP4-211ENST00000477563 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.24□□□□□ -1.89
RBBP4-211ENST00000477563 R4GN34 69 aa3.23□□□□□ -1.89
RBBP4-211ENST00000477563 SPRR2DP22532 72 aa3.22□□□□□ -1.89
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.22□□□□□ -1.89
RBBP4-211ENST00000477563 SERP2Q8N6R1 65 aa3.22□□□□□ -1.89
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP12-2P59991 146 aa3.21□□□□□ -1.9
RBBP4-211ENST00000477563 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.21□□□□□ -1.9
RBBP4-211ENST00000477563 P0C880 135 aa3.2□□□□□ -1.9
RBBP4-211ENST00000477563 MT1XP80297 61 aa3.2□□□□□ -1.9
RBBP4-211ENST00000477563 PLAC4Q8WY50 150 aa3.18□□□□□ -1.9
RBBP4-211ENST00000477563 M0QZ58 72 aa3.17□□□□□ -1.9
RBBP4-211ENST00000477563 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.16□□□□□ -1.9
RBBP4-211ENST00000477563 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.16□□□□□ -1.9
RBBP4-211ENST00000477563 SNURFQ9Y675 71 aa3.16□□□□□ -1.9
RBBP4-211ENST00000477563 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RBBP4-211ENST00000477563 COX7CP15954 63 aa3.12□□□□□ -1.91
RBBP4-211ENST00000477563 H7BZZ5 65 aa3.07□□□□□ -1.92
RBBP4-211ENST00000477563 LINC01554Q52M75 96 aa3.07□□□□□ -1.92
RBBP4-211ENST00000477563 COA5Q86WW8 74 aa3.07□□□□□ -1.92
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP10-12P60413 245 aa3.06□□□□□ -1.92
RBBP4-211ENST00000477563 SEC61GP60059 68 aa3.04□□□□□ -1.92
RBBP4-211ENST00000477563 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.02□□□□□ -1.93
RBBP4-211ENST00000477563 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.01□□□□□ -1.93
RBBP4-211ENST00000477563 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3□□□□□ -1.93
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 162.7 ms