RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

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Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 Q8N9L7 120 aa3.34□□□□□ -1.87
HOXD8-202ENST00000429017 MT2AP02795 61 aa3.33□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 DSCR10P59022 87 aa3.33□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.33□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.33□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 A8MWP4 228 aa3.32□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 K7EQZ3 153 aa3.32□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.32□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 HCG22E2RYF7 251 aa3.31□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 MT1FP04733 61 aa3.3□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 KLKP1Q107X0 134 aa3.3□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 PRR15Q8IV56 129 aa3.3□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 OCR1Q9BZK8 76 aa3.3□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 NDUFC1O43677 76 aa3.3□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM258P61165 79 aa3.3□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 C20orf197Q8N268 126 aa3.3□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 Q96NJ1 140 aa3.3□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 CASC2Q6XLA1 102 aa3.29□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.29□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.29□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 A8MUU9 505 aa3.28□□□□□ -1.88
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HOXD8-202ENST00000429017 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.28□□□□□ -1.88
HOXD8-202ENST00000429017 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.26□□□□□ -1.89
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1B0GVX0 72 aa3.26□□□□□ -1.89
HOXD8-202ENST00000429017 hDV103S1A0JD37 113 aa3.26□□□□□ -1.89
HOXD8-202ENST00000429017 H7BZZ5 65 aa3.26□□□□□ -1.89
HOXD8-202ENST00000429017 C5orf47Q569G3 176 aa3.26□□□□□ -1.89
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HOXD8-202ENST00000429017 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.25□□□□□ -1.89
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HOXD8-202ENST00000429017 C8orf87E5RJ46 101 aa3.24□□□□□ -1.89
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP10-10P60014 251 aa3.24□□□□□ -1.89
HOXD8-202ENST00000429017 SNURFQ9Y675 71 aa3.24□□□□□ -1.89
HOXD8-202ENST00000429017 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.23□□□□□ -1.89
HOXD8-202ENST00000429017 NDUFS5O43920 106 aa3.23□□□□□ -1.89
HOXD8-202ENST00000429017 HRES1P13985 223 aa3.23□□□□□ -1.89
HOXD8-202ENST00000429017 H3BPC8 53 aa3.22□□□□□ -1.89
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HOXD8-202ENST00000429017 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
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HOXD8-202ENST00000429017 FAM236CP0DP71 79 aa3.22□□□□□ -1.89
HOXD8-202ENST00000429017 H0Y9P7 68 aa3.21□□□□□ -1.9
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HOXD8-202ENST00000429017 Q5W150 140 aa3.11□□□□□ -1.91
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HOXD8-202ENST00000429017 NEBP20929 6669 aa3.09□□□□□ -1.91
HOXD8-202ENST00000429017 C4orf26Q17RF5 130 aa3.08□□□□□ -1.92
HOXD8-202ENST00000429017 Q1T7F1 81 aa3.07□□□□□ -1.92
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HOXD8-202ENST00000429017 ACYP2P14621 99 aa3.05□□□□□ -1.92
HOXD8-202ENST00000429017 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.05□□□□□ -1.92
HOXD8-202ENST00000429017 V9GYY9 64 aa3.05□□□□□ -1.92
HOXD8-202ENST00000429017 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.04□□□□□ -1.92
HOXD8-202ENST00000429017 COA5Q86WW8 74 aa3.03□□□□□ -1.92
HOXD8-202ENST00000429017 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.01□□□□□ -1.93
HOXD8-202ENST00000429017 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.01□□□□□ -1.93
HOXD8-202ENST00000429017 DMAC1Q96GE9 116 aa3.01□□□□□ -1.93
HOXD8-202ENST00000429017 A8MUN3 132 aa3□□□□□ -1.93
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HOXD8-202ENST00000429017 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.97□□□□□ -1.93
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HOXD8-202ENST00000429017 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.97□□□□□ -1.93
HOXD8-202ENST00000429017 PRO0628Q9UI54 55 aa2.97□□□□□ -1.93
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HOXD8-202ENST00000429017 Q5VV11 94 aa2.95□□□□□ -1.94
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.94□□□□□ -1.94
HOXD8-202ENST00000429017 PRR15LQ9BU68 103 aa2.93□□□□□ -1.94
HOXD8-202ENST00000429017 BRK1Q8WUW1 75 aa2.93□□□□□ -1.94
HOXD8-202ENST00000429017 KMT2DO14686 5537 aa2.93□□□□□ -1.94
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP5-8O75690 187 aa2.92□□□□□ -1.94
HOXD8-202ENST00000429017 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.92□□□□□ -1.94
HOXD8-202ENST00000429017 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.92□□□□□ -1.94
HOXD8-202ENST00000429017 MDN1Q9NU22 5596 aa2.91□□□□□ -1.94
HOXD8-202ENST00000429017 SEC61GP60059 68 aa2.91□□□□□ -1.94
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1B0GU69 56 aa2.9□□□□□ -1.95
HOXD8-202ENST00000429017 A6NED7 52 aa2.87□□□□□ -1.95
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