RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-241ENST00000602290 LCA10Q71F78 164 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-241ENST00000602290 KLK12Q9UKR0 248 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-241ENST00000602290 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
HCG18-241ENST00000602290 A8MUN3 132 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-241ENST00000602290 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
HCG18-241ENST00000602290 A0A087X002 238 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-241ENST00000602290 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-241ENST00000602290 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HCG18-241ENST00000602290 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-241ENST00000602290 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-241ENST00000602290 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.03□□□□□ -1.28
HCG18-241ENST00000602290 HCG22E2RYF7 251 aa7.03□□□□□ -1.28
HCG18-241ENST00000602290 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.03□□□□□ -1.28
HCG18-241ENST00000602290 SMIM29Q86T20 159 aa7.03□□□□□ -1.28
HCG18-241ENST00000602290 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.02□□□□□ -1.29
HCG18-241ENST00000602290 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-241ENST00000602290 MP68P56378 58 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-241ENST00000602290 LINC00208Q96KT6 92 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-241ENST00000602290 SSPOA2VEC9 5147 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-241ENST00000602290 Q8NDZ9 215 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-241ENST00000602290 C8orf87E5RJ46 101 aa6.97□□□□□ -1.29
HCG18-241ENST00000602290 Q8N9L7 120 aa6.97□□□□□ -1.29
HCG18-241ENST00000602290 SPRR4Q96PI1 79 aa6.97□□□□□ -1.29
HCG18-241ENST00000602290 C10orf25Q5T742 122 aa6.96□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 USH2AO75445 5202 aa6.96□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 PRR15LQ9BU68 103 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 A6NED7 52 aa6.93□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 SPAG11BQ08648 103 aa6.93□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.93□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 Q8NBF4 154 aa6.93□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.92□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.92□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 LCE2CQ5TA81 110 aa6.92□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 DSCR10P59022 87 aa6.91□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.91□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 TPRXLQ17RH7 258 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 PRR34Q9NV39 138 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-241ENST00000602290 A0A096LNI7 61 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-241ENST00000602290 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-241ENST00000602290 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-241ENST00000602290 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-241ENST00000602290 A0A1W2PNM2 257 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-241ENST00000602290 REG3AQ06141 175 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-241ENST00000602290 MOBPQ13875 183 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-241ENST00000602290 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-241ENST00000602290 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.87□□□□□ -1.31
HCG18-241ENST00000602290 A8MU10 97 aa6.87□□□□□ -1.31
HCG18-241ENST00000602290 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HCG18-241ENST00000602290 MT1HP80294 61 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-241ENST00000602290 Q8N377 158 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-241ENST00000602290 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HCG18-241ENST00000602290 H0Y9J4 135 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HCG18-241ENST00000602290 C1orf137Q5JT78 98 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-241ENST00000602290 CASC2Q6XLA1 102 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-241ENST00000602290 K7EQZ3 153 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-241ENST00000602290 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-241ENST00000602290 COA5Q86WW8 74 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-241ENST00000602290 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-241ENST00000602290 C15orf56Q8N910 161 aa6.82□□□□□ -1.32
HCG18-241ENST00000602290 H0Y9P7 68 aa6.81□□□□□ -1.32
HCG18-241ENST00000602290 LINC01554Q52M75 96 aa6.8□□□□□ -1.32
HCG18-241ENST00000602290 H3BS24 57 aa6.79□□□□□ -1.32
HCG18-241ENST00000602290 IGLV7-43P04211 117 aa6.78□□□□□ -1.32
HCG18-241ENST00000602290 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-241ENST00000602290 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-241ENST00000602290 SPRR1AP35321 89 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-241ENST00000602290 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-241ENST00000602290 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZRX8 168 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-241ENST00000602290 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
HCG18-241ENST00000602290 LINC00313P59037 77 aa6.73□□□□□ -1.33
HCG18-241ENST00000602290 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.73□□□□□ -1.33
HCG18-241ENST00000602290 A0A1W2PNN7 141 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-241ENST00000602290 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-241ENST00000602290 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.71□□□□□ -1.34
HCG18-241ENST00000602290 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-241ENST00000602290 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-241ENST00000602290 A8MWP4 228 aa6.68□□□□□ -1.34
HCG18-241ENST00000602290 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.68□□□□□ -1.34
HCG18-241ENST00000602290 SPINK7P58062 85 aa6.67□□□□□ -1.34
HCG18-241ENST00000602290 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.63□□□□□ -1.35
HCG18-241ENST00000602290 NEBP20929 6669 aa6.62□□□□□ -1.35
HCG18-241ENST00000602290 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.62□□□□□ -1.35
HCG18-241ENST00000602290 IGFL1Q6UW32 110 aa6.62□□□□□ -1.35
HCG18-241ENST00000602290 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.6□□□□□ -1.35
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