RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRS-208ENST00000590509 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRS-208ENST00000590509 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRS-208ENST00000590509 COX8AP10176 69 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRS-208ENST00000590509 KRTAP5-9P26371 169 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRS-208ENST00000590509 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRS-208ENST00000590509 A6NN06 94 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRS-208ENST00000590509 MT1BP07438 61 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRS-208ENST00000590509 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRS-208ENST00000590509 KMT2DO14686 5537 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRS-208ENST00000590509 C9orf118A6NHY6 69 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRS-208ENST00000590509 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRS-208ENST00000590509 MDN1Q9NU22 5596 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRS-208ENST00000590509 A0A1B0GV72 72 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRS-208ENST00000590509 K7EP34 96 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRS-208ENST00000590509 SCGB1A1P11684 91 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRS-208ENST00000590509 HSD52Q0P140 79 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRS-208ENST00000590509 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRS-208ENST00000590509 A0A1B0GVX0 72 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRS-208ENST00000590509 A0A1W2PPM0 123 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRS-208ENST00000590509 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRS-208ENST00000590509 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRS-208ENST00000590509 C8orf87E5RJ46 101 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRS-208ENST00000590509 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRS-208ENST00000590509 HIGD1BQ9P298 99 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRS-208ENST00000590509 SVIPQ8NHG7 77 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRS-208ENST00000590509 RAB37Q96AX2 223 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRS-208ENST00000590509 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRS-208ENST00000590509 H0YGX0 51 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRS-208ENST00000590509 KRTAP10-5P60370 271 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRS-208ENST00000590509 HIST1H4GQ99525 98 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRS-208ENST00000590509 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRS-208ENST00000590509 CCKP06307 115 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRS-208ENST00000590509 J3QR89 54 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRS-208ENST00000590509 GHRHP01286 108 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRS-208ENST00000590509 TRACP01848 142 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRS-208ENST00000590509 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRS-208ENST00000590509 F8W1H4 67 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRS-208ENST00000590509 FXYD2P54710 66 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRS-208ENST00000590509 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRS-208ENST00000590509 Q5VV11 94 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRS-208ENST00000590509 A0A0B4J2C4 111 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRS-208ENST00000590509 A0A1B0GX51 115 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRS-208ENST00000590509 CEND1Q8N111 149 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRS-208ENST00000590509 TRIAP1O43715 76 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRS-208ENST00000590509 PRO0461Q9UI25 63 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRS-208ENST00000590509 K7ERJ3 54 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRS-208ENST00000590509 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRS-208ENST00000590509 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRS-208ENST00000590509 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRS-208ENST00000590509 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRS-208ENST00000590509 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRS-208ENST00000590509 ETDBQ3ZM63 59 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRS-208ENST00000590509 SPRR2EP22531 72 aa7.07□□□□□ -1.28
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PTPRS-208ENST00000590509 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRS-208ENST00000590509 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRS-208ENST00000590509 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRS-208ENST00000590509 A6NJY4 79 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRS-208ENST00000590509 J3KT08 172 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRS-208ENST00000590509 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRS-208ENST00000590509 C5orf47Q569G3 176 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRS-208ENST00000590509 Q6ZVQ6 151 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRS-208ENST00000590509 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRS-208ENST00000590509 DNAL4O96015 105 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRS-208ENST00000590509 Q6ZQT0 140 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRS-208ENST00000590509 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRS-208ENST00000590509 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRS-208ENST00000590509 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
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PTPRS-208ENST00000590509 IGKV2-30P06310 120 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRS-208ENST00000590509 DSCR8Q96T75 97 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRS-208ENST00000590509 Q5W150 140 aa6.97□□□□□ -1.29
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PTPRS-208ENST00000590509 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRS-208ENST00000590509 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
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PTPRS-208ENST00000590509 PRR15Q8IV56 129 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRS-208ENST00000590509 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRS-208ENST00000590509 C9JAW5 83 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRS-208ENST00000590509 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRS-208ENST00000590509 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRS-208ENST00000590509 IMUPQ9GZP8 106 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRS-208ENST00000590509 NDUFS5O43920 106 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRS-208ENST00000590509 KLKP1Q107X0 134 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRS-208ENST00000590509 ATXN8Q156A1 80 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRS-208ENST00000590509 LCA10Q71F78 164 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRS-208ENST00000590509 H3BT86 120 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRS-208ENST00000590509 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.83□□□□□ -1.32
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