RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584944.5

TRAF4-215, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF4, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-215ENST00000584944 A0A1B0GV90 55 aa7.61□□□□□ -1.19
TRAF4-215ENST00000584944 XP32Q5T750 250 aa7.61□□□□□ -1.19
TRAF4-215ENST00000584944 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.6□□□□□ -1.19
TRAF4-215ENST00000584944 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.6□□□□□ -1.19
TRAF4-215ENST00000584944 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
TRAF4-215ENST00000584944 LINC00313P59037 77 aa7.58□□□□□ -1.2
TRAF4-215ENST00000584944 UBL5Q9BZL1 73 aa7.58□□□□□ -1.2
TRAF4-215ENST00000584944 DSCR10P59022 87 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAF4-215ENST00000584944 A0A1B0GVX0 72 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAF4-215ENST00000584944 BPY2O14599 106 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAF4-215ENST00000584944 C8orf87E5RJ46 101 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAF4-215ENST00000584944 A8MWP4 228 aa7.53□□□□□ -1.2
TRAF4-215ENST00000584944 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.52□□□□□ -1.21
TRAF4-215ENST00000584944 Q6ZVQ6 151 aa7.52□□□□□ -1.21
TRAF4-215ENST00000584944 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TRAF4-215ENST00000584944 PCOTHQ58A44 107 aa7.49□□□□□ -1.21
TRAF4-215ENST00000584944 LINC00846Q9NV44 126 aa7.49□□□□□ -1.21
TRAF4-215ENST00000584944 ACYP1P07311 99 aa7.48□□□□□ -1.21
TRAF4-215ENST00000584944 Q75L30 129 aa7.48□□□□□ -1.21
TRAF4-215ENST00000584944 PRR15Q8IV56 129 aa7.47□□□□□ -1.21
TRAF4-215ENST00000584944 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.46□□□□□ -1.22
TRAF4-215ENST00000584944 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAF4-215ENST00000584944 J3QR89 54 aa7.44□□□□□ -1.22
TRAF4-215ENST00000584944 K7EQZ3 153 aa7.43□□□□□ -1.22
TRAF4-215ENST00000584944 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.43□□□□□ -1.22
TRAF4-215ENST00000584944 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.43□□□□□ -1.22
TRAF4-215ENST00000584944 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.42□□□□□ -1.22
TRAF4-215ENST00000584944 A8MUU9 505 aa7.42□□□□□ -1.22
TRAF4-215ENST00000584944 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.41□□□□□ -1.22
TRAF4-215ENST00000584944 Q8N9L7 120 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAF4-215ENST00000584944 hDV103S1A0JD37 113 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAF4-215ENST00000584944 NDUFS5O43920 106 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAF4-215ENST00000584944 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAF4-215ENST00000584944 CXCL6P80162 114 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAF4-215ENST00000584944 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAF4-215ENST00000584944 CASC2Q6XLA1 102 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF4-215ENST00000584944 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAF4-215ENST00000584944 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF4-215ENST00000584944 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAF4-215ENST00000584944 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAF4-215ENST00000584944 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAF4-215ENST00000584944 HCG22E2RYF7 251 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAF4-215ENST00000584944 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRAF4-215ENST00000584944 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TRAF4-215ENST00000584944 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRAF4-215ENST00000584944 LINC00643Q86TS7 51 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAF4-215ENST00000584944 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAF4-215ENST00000584944 K7ERU9 68 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAF4-215ENST00000584944 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAF4-215ENST00000584944 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAF4-215ENST00000584944 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAF4-215ENST00000584944 FAM236CP0DP71 79 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAF4-215ENST00000584944 SPINK7P58062 85 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAF4-215ENST00000584944 LCE2CQ5TA81 110 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAF4-215ENST00000584944 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAF4-215ENST00000584944 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAF4-215ENST00000584944 IGKV2-30P06310 120 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAF4-215ENST00000584944 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAF4-215ENST00000584944 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF4-215ENST00000584944 A0A087WVE0 104 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAF4-215ENST00000584944 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAF4-215ENST00000584944 SCGB1A1P11684 91 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF4-215ENST00000584944 Q5W150 140 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAF4-215ENST00000584944 MT1HP80294 61 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAF4-215ENST00000584944 M0R2T5 61 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAF4-215ENST00000584944 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.06□□□□□ -1.28
TRAF4-215ENST00000584944 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.06□□□□□ -1.28
TRAF4-215ENST00000584944 UQCRQO14949 82 aa7.06□□□□□ -1.28
TRAF4-215ENST00000584944 HRES1P13985 223 aa7.06□□□□□ -1.28
TRAF4-215ENST00000584944 IMUPQ9GZP8 106 aa7.05□□□□□ -1.28
TRAF4-215ENST00000584944 ATOX1O00244 68 aa7.03□□□□□ -1.28
TRAF4-215ENST00000584944 MT-ATP8P03928 68 aa7.02□□□□□ -1.29
TRAF4-215ENST00000584944 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TRAF4-215ENST00000584944 H0Y9P7 68 aa7□□□□□ -1.29
TRAF4-215ENST00000584944 MP68P56378 58 aa7□□□□□ -1.29
TRAF4-215ENST00000584944 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRAF4-215ENST00000584944 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAF4-215ENST00000584944 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRAF4-215ENST00000584944 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAF4-215ENST00000584944 C4orf26Q17RF5 130 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAF4-215ENST00000584944 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.94□□□□□ -1.3
TRAF4-215ENST00000584944 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.94□□□□□ -1.3
TRAF4-215ENST00000584944 C5orf47Q569G3 176 aa6.94□□□□□ -1.3
TRAF4-215ENST00000584944 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.94□□□□□ -1.3
TRAF4-215ENST00000584944 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.93□□□□□ -1.3
TRAF4-215ENST00000584944 OCR1Q9BZK8 76 aa6.93□□□□□ -1.3
TRAF4-215ENST00000584944 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.93□□□□□ -1.3
TRAF4-215ENST00000584944 LINC00208Q96KT6 92 aa6.92□□□□□ -1.3
TRAF4-215ENST00000584944 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAF4-215ENST00000584944 H3BPC8 53 aa6.87□□□□□ -1.31
TRAF4-215ENST00000584944 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAF4-215ENST00000584944 S4R3F8 94 aa6.77□□□□□ -1.33
TRAF4-215ENST00000584944 KLKP1Q107X0 134 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAF4-215ENST00000584944 SERP2Q8N6R1 65 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAF4-215ENST00000584944 A8MUN3 132 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAF4-215ENST00000584944 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAF4-215ENST00000584944 CSAG1Q6PB30 78 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAF4-215ENST00000584944 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAF4-215ENST00000584944 C20orf197Q8N268 126 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAF4-215ENST00000584944 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.1 ms