RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGKV4-1P06312 121 aa6.98□□□□□ -1.29
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.97□□□□□ -1.29
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PRO0461Q9UI25 63 aa6.96□□□□□ -1.3
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.95□□□□□ -1.3
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.94□□□□□ -1.3
SRP54-AS1-202ENST00000555015 J3KT08 172 aa6.93□□□□□ -1.3
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PCOTHQ58A44 107 aa6.92□□□□□ -1.3
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A0U1RQV1 116 aa6.91□□□□□ -1.3
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DSCR10P59022 87 aa6.91□□□□□ -1.3
SRP54-AS1-202ENST00000555015 Q75L30 129 aa6.91□□□□□ -1.3
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LINC00313P59037 77 aa6.9□□□□□ -1.3
SRP54-AS1-202ENST00000555015 F8W1H4 67 aa6.89□□□□□ -1.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.89□□□□□ -1.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.88□□□□□ -1.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A1B0GVX0 72 aa6.88□□□□□ -1.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NREPQ16612 68 aa6.88□□□□□ -1.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.88□□□□□ -1.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.88□□□□□ -1.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C8orf87E5RJ46 101 aa6.87□□□□□ -1.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A8MUU9 505 aa6.86□□□□□ -1.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NDUFB1O75438 58 aa6.86□□□□□ -1.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.85□□□□□ -1.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.85□□□□□ -1.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A8MWP4 228 aa6.85□□□□□ -1.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.85□□□□□ -1.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.84□□□□□ -1.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.81□□□□□ -1.32
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ETDBQ3ZM63 59 aa6.81□□□□□ -1.32
SRP54-AS1-202ENST00000555015 Q6ZVQ6 151 aa6.8□□□□□ -1.32
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PRR15Q8IV56 129 aa6.79□□□□□ -1.32
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BPY2O14599 106 aa6.78□□□□□ -1.32
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.78□□□□□ -1.32
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UBL5Q9BZL1 73 aa6.77□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LINC00846Q9NV44 126 aa6.77□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-202ENST00000555015 K7EQZ3 153 aa6.75□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.74□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.73□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A1B0GV90 55 aa6.73□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-202ENST00000555015 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.71□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.7□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-202ENST00000555015 hDV103S1A0JD37 113 aa6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ACYP1P07311 99 aa6.68□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-202ENST00000555015 Q8N9L7 120 aa6.68□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.67□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CXCL6P80162 114 aa6.66□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LCE3BQ5TA77 95 aa6.66□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.64□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CASC2Q6XLA1 102 aa6.63□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.63□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-202ENST00000555015 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.63□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HCG22E2RYF7 251 aa6.61□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NDUFS5O43920 106 aa6.61□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MT1HP80294 61 aa6.58□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.58□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HRES1P13985 223 aa6.57□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SPINK7P58062 85 aa6.56□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.54□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-202ENST00000555015 J3QR89 54 aa6.53□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-202ENST00000555015 Q5W150 140 aa6.51□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LINC00643Q86TS7 51 aa6.51□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.5□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM236CP0DP71 79 aa6.5□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.49□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.49□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-202ENST00000555015 M0R2T5 61 aa6.48□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.48□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.47□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGKV2-30P06310 120 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-202ENST00000555015 H3BS24 57 aa6.45□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A087WVE0 104 aa6.4□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-202ENST00000555015 K7ERU9 68 aa6.38□□□□□ -1.39
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.36□□□□□ -1.39
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UQCRQO14949 82 aa6.34□□□□□ -1.39
SRP54-AS1-202ENST00000555015 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.32□□□□□ -1.4
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.31□□□□□ -1.4
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C4orf26Q17RF5 130 aa6.31□□□□□ -1.4
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATOX1O00244 68 aa6.3□□□□□ -1.4
SRP54-AS1-202ENST00000555015 H0Y9P7 68 aa6.29□□□□□ -1.4
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.29□□□□□ -1.4
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OCR1Q9BZK8 76 aa6.28□□□□□ -1.4
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IMUPQ9GZP8 106 aa6.28□□□□□ -1.4
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.26□□□□□ -1.41
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MT-ATP8P03928 68 aa6.25□□□□□ -1.41
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LCE1DQ5T752 114 aa6.25□□□□□ -1.41
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SCGB1A1P11684 91 aa6.23□□□□□ -1.41
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.23□□□□□ -1.41
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MP68P56378 58 aa6.22□□□□□ -1.41
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