RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552958.5

AC004801.5-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC004801.5, Length 550 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004801.5-201ENST00000552958 IGKV4-1P06312 121 aa4.93□□□□□ -1.62
AC004801.5-201ENST00000552958 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
AC004801.5-201ENST00000552958 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
AC004801.5-201ENST00000552958 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
AC004801.5-201ENST00000552958 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.92□□□□□ -1.62
AC004801.5-201ENST00000552958 M0R2T5 61 aa4.91□□□□□ -1.62
AC004801.5-201ENST00000552958 SIGMAR1Q99720 223 aa4.91□□□□□ -1.62
AC004801.5-201ENST00000552958 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.9□□□□□ -1.63
AC004801.5-201ENST00000552958 PRO0461Q9UI25 63 aa4.9□□□□□ -1.63
AC004801.5-201ENST00000552958 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.89□□□□□ -1.63
AC004801.5-201ENST00000552958 J3KT08 172 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004801.5-201ENST00000552958 LINC00313P59037 77 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004801.5-201ENST00000552958 Q75L30 129 aa4.88□□□□□ -1.63
AC004801.5-201ENST00000552958 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
AC004801.5-201ENST00000552958 DSCR10P59022 87 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004801.5-201ENST00000552958 NREPQ16612 68 aa4.87□□□□□ -1.63
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.86□□□□□ -1.63
AC004801.5-201ENST00000552958 F8W1H4 67 aa4.86□□□□□ -1.63
AC004801.5-201ENST00000552958 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004801.5-201ENST00000552958 A0A1B0GVX0 72 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004801.5-201ENST00000552958 A8MUU9 505 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004801.5-201ENST00000552958 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004801.5-201ENST00000552958 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004801.5-201ENST00000552958 C8orf87E5RJ46 101 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004801.5-201ENST00000552958 NDUFB1O75438 58 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004801.5-201ENST00000552958 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.83□□□□□ -1.64
AC004801.5-201ENST00000552958 A8MWP4 228 aa4.82□□□□□ -1.64
AC004801.5-201ENST00000552958 ETDBQ3ZM63 59 aa4.81□□□□□ -1.64
AC004801.5-201ENST00000552958 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.8□□□□□ -1.64
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
AC004801.5-201ENST00000552958 Q6ZVQ6 151 aa4.79□□□□□ -1.64
AC004801.5-201ENST00000552958 PRR15Q8IV56 129 aa4.79□□□□□ -1.64
AC004801.5-201ENST00000552958 BPY2O14599 106 aa4.78□□□□□ -1.64
AC004801.5-201ENST00000552958 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.78□□□□□ -1.64
AC004801.5-201ENST00000552958 LINC00846Q9NV44 126 aa4.78□□□□□ -1.64
AC004801.5-201ENST00000552958 UBL5Q9BZL1 73 aa4.76□□□□□ -1.65
AC004801.5-201ENST00000552958 A0A1B0GV90 55 aa4.75□□□□□ -1.65
AC004801.5-201ENST00000552958 K7EQZ3 153 aa4.75□□□□□ -1.65
AC004801.5-201ENST00000552958 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
AC004801.5-201ENST00000552958 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.73□□□□□ -1.65
AC004801.5-201ENST00000552958 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.73□□□□□ -1.65
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.73□□□□□ -1.65
AC004801.5-201ENST00000552958 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
AC004801.5-201ENST00000552958 hDV103S1A0JD37 113 aa4.71□□□□□ -1.66
AC004801.5-201ENST00000552958 Q8N9L7 120 aa4.71□□□□□ -1.66
AC004801.5-201ENST00000552958 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
AC004801.5-201ENST00000552958 ACYP1P07311 99 aa4.7□□□□□ -1.66
AC004801.5-201ENST00000552958 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4.68□□□□□ -1.66
AC004801.5-201ENST00000552958 CXCL6P80162 114 aa4.68□□□□□ -1.66
AC004801.5-201ENST00000552958 USH2AO75445 5202 aa4.67□□□□□ -1.66
AC004801.5-201ENST00000552958 CASC2Q6XLA1 102 aa4.67□□□□□ -1.66
AC004801.5-201ENST00000552958 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.67□□□□□ -1.66
AC004801.5-201ENST00000552958 SSPOA2VEC9 5147 aa4.66□□□□□ -1.66
AC004801.5-201ENST00000552958 NDUFS5O43920 106 aa4.66□□□□□ -1.66
AC004801.5-201ENST00000552958 MT2AP02795 61 aa4.66□□□□□ -1.66
AC004801.5-201ENST00000552958 HCG22E2RYF7 251 aa4.65□□□□□ -1.67
AC004801.5-201ENST00000552958 SPINK7P58062 85 aa4.65□□□□□ -1.67
AC004801.5-201ENST00000552958 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.64□□□□□ -1.67
AC004801.5-201ENST00000552958 FAM236CP0DP71 79 aa4.64□□□□□ -1.67
AC004801.5-201ENST00000552958 HRES1P13985 223 aa4.64□□□□□ -1.67
AC004801.5-201ENST00000552958 MT1FP04733 61 aa4.63□□□□□ -1.67
AC004801.5-201ENST00000552958 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
AC004801.5-201ENST00000552958 LCE2BO14633 110 aa4.62□□□□□ -1.67
AC004801.5-201ENST00000552958 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.62□□□□□ -1.67
AC004801.5-201ENST00000552958 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.62□□□□□ -1.67
AC004801.5-201ENST00000552958 Q5W150 140 aa4.61□□□□□ -1.67
AC004801.5-201ENST00000552958 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.6□□□□□ -1.67
AC004801.5-201ENST00000552958 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
AC004801.5-201ENST00000552958 J3QR89 54 aa4.59□□□□□ -1.67
AC004801.5-201ENST00000552958 LINC00643Q86TS7 51 aa4.59□□□□□ -1.67
AC004801.5-201ENST00000552958 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP10-10P60014 251 aa4.58□□□□□ -1.68
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.58□□□□□ -1.68
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.58□□□□□ -1.68
AC004801.5-201ENST00000552958 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.57□□□□□ -1.68
AC004801.5-201ENST00000552958 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
AC004801.5-201ENST00000552958 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.55□□□□□ -1.68
AC004801.5-201ENST00000552958 IGKV2-30P06310 120 aa4.55□□□□□ -1.68
AC004801.5-201ENST00000552958 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.55□□□□□ -1.68
AC004801.5-201ENST00000552958 A0A087WVE0 104 aa4.51□□□□□ -1.69
AC004801.5-201ENST00000552958 K7ERU9 68 aa4.48□□□□□ -1.69
AC004801.5-201ENST00000552958 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.47□□□□□ -1.69
AC004801.5-201ENST00000552958 UQCRQO14949 82 aa4.47□□□□□ -1.69
AC004801.5-201ENST00000552958 C4orf26Q17RF5 130 aa4.46□□□□□ -1.7
AC004801.5-201ENST00000552958 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.46□□□□□ -1.7
AC004801.5-201ENST00000552958 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.45□□□□□ -1.7
AC004801.5-201ENST00000552958 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.43□□□□□ -1.7
AC004801.5-201ENST00000552958 H0Y9P7 68 aa4.43□□□□□ -1.7
AC004801.5-201ENST00000552958 ATOX1O00244 68 aa4.43□□□□□ -1.7
AC004801.5-201ENST00000552958 OCR1Q9BZK8 76 aa4.43□□□□□ -1.7
AC004801.5-201ENST00000552958 IMUPQ9GZP8 106 aa4.43□□□□□ -1.7
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.42□□□□□ -1.7
AC004801.5-201ENST00000552958 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.41□□□□□ -1.7
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.41□□□□□ -1.7
AC004801.5-201ENST00000552958 MT-ATP8P03928 68 aa4.4□□□□□ -1.71
AC004801.5-201ENST00000552958 SCGB1A1P11684 91 aa4.39□□□□□ -1.71
AC004801.5-201ENST00000552958 C5orf47Q569G3 176 aa4.39□□□□□ -1.71
AC004801.5-201ENST00000552958 NEBP20929 6669 aa4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.3 ms