RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CTDSP2-208ENST00000552294 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.06□□□□□ -1.92
CTDSP2-208ENST00000552294 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.06□□□□□ -1.92
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CTDSP2-208ENST00000552294 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
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CTDSP2-208ENST00000552294 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.04□□□□□ -1.92
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CTDSP2-208ENST00000552294 S100A2P29034 98 aa3.02□□□□□ -1.93
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CTDSP2-208ENST00000552294 C5orf47Q569G3 176 aa2.94□□□□□ -1.94
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CTDSP2-208ENST00000552294 K7ERJ3 54 aa2.86□□□□□ -1.95
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CTDSP2-208ENST00000552294 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
CTDSP2-208ENST00000552294 J3KT08 172 aa2.8□□□□□ -1.96
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.8□□□□□ -1.96
CTDSP2-208ENST00000552294 HSD52Q0P140 79 aa2.8□□□□□ -1.96
CTDSP2-208ENST00000552294 UBE2V1Q13404 147 aa2.8□□□□□ -1.96
CTDSP2-208ENST00000552294 K7EQZ3 153 aa2.79□□□□□ -1.96
CTDSP2-208ENST00000552294 SNCGO76070 127 aa2.79□□□□□ -1.96
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