RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-229ENST00000551936 CCKP06307 115 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-229ENST00000551936 UBE2V1Q13404 147 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-229ENST00000551936 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-229ENST00000551936 C9JAW5 83 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-229ENST00000551936 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-229ENST00000551936 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-229ENST00000551936 HRES1P13985 223 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-229ENST00000551936 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-229ENST00000551936 K7EP34 96 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-229ENST00000551936 USH2AO75445 5202 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-229ENST00000551936 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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CS-229ENST00000551936 H3BT86 120 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-229ENST00000551936 FAM236CP0DP71 79 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-229ENST00000551936 VPS25Q9BRG1 176 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-229ENST00000551936 SSPOA2VEC9 5147 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-229ENST00000551936 A0A1B0GVX0 72 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-229ENST00000551936 C8orf87E5RJ46 101 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-229ENST00000551936 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.22□□□□□ -1.25
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CS-229ENST00000551936 DSCR8Q96T75 97 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-229ENST00000551936 MT2AP02795 61 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-229ENST00000551936 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-229ENST00000551936 J3KT08 172 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-229ENST00000551936 Q6ZQT0 140 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-229ENST00000551936 PRO0461Q9UI25 63 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-229ENST00000551936 MT1FP04733 61 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-229ENST00000551936 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-229ENST00000551936 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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CS-229ENST00000551936 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-229ENST00000551936 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-229ENST00000551936 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-229ENST00000551936 LCE2BO14633 110 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-229ENST00000551936 PDE6GP18545 87 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-229ENST00000551936 SPINK7P58062 85 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-229ENST00000551936 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-229ENST00000551936 A0A1B0GV90 55 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-229ENST00000551936 F8W1H4 67 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-229ENST00000551936 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CS-229ENST00000551936 NDUFB1O75438 58 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-229ENST00000551936 KRTAP10-10P60014 251 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-229ENST00000551936 A0A1B0GW54 56 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-229ENST00000551936 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-229ENST00000551936 A8MWP4 228 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-229ENST00000551936 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-229ENST00000551936 ETDBQ3ZM63 59 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-229ENST00000551936 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-229ENST00000551936 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-229ENST00000551936 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-229ENST00000551936 Q6ZVQ6 151 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-229ENST00000551936 PRR15Q8IV56 129 aa7□□□□□ -1.29
CS-229ENST00000551936 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-229ENST00000551936 NREPQ16612 68 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-229ENST00000551936 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-229ENST00000551936 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-229ENST00000551936 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
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CS-229ENST00000551936 K7EQZ3 153 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-229ENST00000551936 LINC00846Q9NV44 126 aa6.9□□□□□ -1.3
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CS-229ENST00000551936 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-229ENST00000551936 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-229ENST00000551936 BPY2O14599 106 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-229ENST00000551936 NDUFS5O43920 106 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-229ENST00000551936 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-229ENST00000551936 ACYP1P07311 99 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-229ENST00000551936 Q5W150 140 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-229ENST00000551936 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-229ENST00000551936 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-229ENST00000551936 J3QR89 54 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-229ENST00000551936 IGKV2-30P06310 120 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-229ENST00000551936 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-229ENST00000551936 Q8N9L7 120 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-229ENST00000551936 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CS-229ENST00000551936 HCG22E2RYF7 251 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-229ENST00000551936 CXCL6P80162 114 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-229ENST00000551936 CASC2Q6XLA1 102 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-229ENST00000551936 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-229ENST00000551936 C4orf26Q17RF5 130 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-229ENST00000551936 LINC00643Q86TS7 51 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-229ENST00000551936 K7ERU9 68 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-229ENST00000551936 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-229ENST00000551936 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CS-229ENST00000551936 C5orf47Q569G3 176 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-229ENST00000551936 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-229ENST00000551936 A0A087WVE0 104 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-229ENST00000551936 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-229ENST00000551936 S4R3F8 94 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-229ENST00000551936 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-229ENST00000551936 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-229ENST00000551936 LCA10Q71F78 164 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-229ENST00000551936 CSAG1Q6PB30 78 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-229ENST00000551936 MT1BP07438 61 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-229ENST00000551936 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-229ENST00000551936 MT-ATP8P03928 68 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-229ENST00000551936 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-229ENST00000551936 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.51□□□□□ -1.37
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