RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-227ENST00000551441 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
CS-227ENST00000551441 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-227ENST00000551441 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-227ENST00000551441 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-227ENST00000551441 S100A2P29034 98 aa7.63□□□□□ -1.19
CS-227ENST00000551441 COX8AP10176 69 aa7.62□□□□□ -1.19
CS-227ENST00000551441 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.62□□□□□ -1.19
CS-227ENST00000551441 A0A1B0GVX0 72 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-227ENST00000551441 CCKP06307 115 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-227ENST00000551441 A0A0B4J2C4 111 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-227ENST00000551441 TRACP01848 142 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-227ENST00000551441 NEBP20929 6669 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-227ENST00000551441 A0A1B0GX51 115 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-227ENST00000551441 C8orf87E5RJ46 101 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-227ENST00000551441 C14orf144Q96I85 54 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-227ENST00000551441 VPS25Q9BRG1 176 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-227ENST00000551441 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-227ENST00000551441 TRIAP1O43715 76 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-227ENST00000551441 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-227ENST00000551441 DNAL4O96015 105 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-227ENST00000551441 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-227ENST00000551441 DLEU1O43261 78 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-227ENST00000551441 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-227ENST00000551441 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-227ENST00000551441 CEND1Q8N111 149 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-227ENST00000551441 HIGD1BQ9P298 99 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-227ENST00000551441 FXYD2P54710 66 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-227ENST00000551441 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-227ENST00000551441 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-227ENST00000551441 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-227ENST00000551441 PSMB2P49721 201 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-227ENST00000551441 SPATA45Q537H7 98 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-227ENST00000551441 S100A6P06703 90 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-227ENST00000551441 K7ERJ3 54 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-227ENST00000551441 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-227ENST00000551441 H3BQ85 93 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-227ENST00000551441 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-227ENST00000551441 A6NN06 94 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-227ENST00000551441 UBE2V1Q13404 147 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-227ENST00000551441 J3KT08 172 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-227ENST00000551441 NDUFB1O75438 58 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-227ENST00000551441 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CS-227ENST00000551441 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-227ENST00000551441 DSCR8Q96T75 97 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-227ENST00000551441 Q6ZQT0 140 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-227ENST00000551441 Q6ZVQ6 151 aa7.36□□□□□ -1.23
CS-227ENST00000551441 VAMP8Q9BV40 100 aa7.36□□□□□ -1.23
CS-227ENST00000551441 COX6CP09669 75 aa7.35□□□□□ -1.23
CS-227ENST00000551441 MT1BP07438 61 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-227ENST00000551441 C9JAW5 83 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-227ENST00000551441 MDN1Q9NU22 5596 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-227ENST00000551441 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-227ENST00000551441 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-227ENST00000551441 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-227ENST00000551441 IGKV2-30P06310 120 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-227ENST00000551441 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-227ENST00000551441 S100A1P23297 94 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-227ENST00000551441 NDUFS5O43920 106 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-227ENST00000551441 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-227ENST00000551441 Q5VV11 94 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-227ENST00000551441 KMT2DO14686 5537 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-227ENST00000551441 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-227ENST00000551441 HSD52Q0P140 79 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-227ENST00000551441 C5orf47Q569G3 176 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-227ENST00000551441 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-227ENST00000551441 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-227ENST00000551441 PRR15Q8IV56 129 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-227ENST00000551441 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-227ENST00000551441 KRTAP5-9P26371 169 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-227ENST00000551441 KRTAP10-5P60370 271 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-227ENST00000551441 C4orf26Q17RF5 130 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-227ENST00000551441 Q5W150 140 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-227ENST00000551441 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-227ENST00000551441 hDV103S1A0JD37 113 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-227ENST00000551441 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-227ENST00000551441 H3BS24 57 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-227ENST00000551441 K7EQZ3 153 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-227ENST00000551441 NREPQ16612 68 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-227ENST00000551441 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-227ENST00000551441 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-227ENST00000551441 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-227ENST00000551441 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-227ENST00000551441 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-227ENST00000551441 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-227ENST00000551441 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-227ENST00000551441 A0A1B0GW54 56 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-227ENST00000551441 S4R3F8 94 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-227ENST00000551441 ATXN8Q156A1 80 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-227ENST00000551441 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-227ENST00000551441 IMUPQ9GZP8 106 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-227ENST00000551441 PYY3Q5JQD4 70 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-227ENST00000551441 CSAG1Q6PB30 78 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-227ENST00000551441 LCA10Q71F78 164 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-227ENST00000551441 HCG22E2RYF7 251 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-227ENST00000551441 PDE6GP18545 87 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-227ENST00000551441 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-227ENST00000551441 Q8N9L7 120 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-227ENST00000551441 SPRR2EP22531 72 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-227ENST00000551441 SPRR2BP35325 72 aa7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.9 ms