RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.92□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 A0A1B0GVX0 72 aa2.91□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 C3orf84H3BNL1 204 aa2.91□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 K7EQZ3 153 aa2.91□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 NDUFS5O43920 106 aa2.91□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa2.91□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 ZANQ9Y493 2812 aa2.9□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 A6NN06 94 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 A8MUN3 132 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 C16orf90A8MZG2 172 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 SPART-AS1P0CW21 52 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 SPRR1BP22528 89 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 CNBPP62633 177 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 LINC01556Q5JQF7 62 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 PP632Q6XCG6 107 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 FN1P02751 2386 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 MP68P56378 58 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 LINC00208Q96KT6 92 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 ACANP16112 2415 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 LINC00483Q53H64 154 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 LCA10Q71F78 164 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 LINC00472Q9H8W2 130 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 NOTCH1P46531 2555 aa2.87□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa2.87□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 LRCOL1A6NCL2 159 aa2.87□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 PSPHP1O15172 72 aa2.87□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 IGFL1Q6UW32 110 aa2.87□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 DNAH3Q8TD57 4116 aa2.87□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 ALMS1Q8TCU4 4167 aa2.87□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 A8MWP4 228 aa2.86□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 WFDC10BQ8IUB3 73 aa2.86□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 HIVEP2P31629 2446 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 H0Y9P7 68 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 DEFB135Q30KP9 77 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 RYR3Q15413 4870 aa2.85□□□□□ -1.95
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TRDN-204ENST00000542443 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa2.84□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa2.84□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 Q5W150 140 aa2.84□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.84□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 COA5Q86WW8 74 aa2.84□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa2.84□□□□□ -1.95
TRDN-204ENST00000542443 PCLOQ9Y6V0 5065 aa2.84□□□□□ -1.95
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TRDN-204ENST00000542443 CASC2Q6XLA1 102 aa2.83□□□□□ -1.96
TRDN-204ENST00000542443 DEFB105AQ8NG35 78 aa2.83□□□□□ -1.96
TRDN-204ENST00000542443 A0A087WSZ3 146 aa2.82□□□□□ -1.96
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TRDN-204ENST00000542443 CMYA5Q8N3K9 4069 aa2.81□□□□□ -1.96
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TRDN-204ENST00000542443 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa2.8□□□□□ -1.96
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TRDN-204ENST00000542443 A6NED7 52 aa2.79□□□□□ -1.96
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TRDN-204ENST00000542443 HRES1P13985 223 aa2.78□□□□□ -1.96
TRDN-204ENST00000542443 HTN3P15516 51 aa2.78□□□□□ -1.96
TRDN-204ENST00000542443 TENM1Q9UKZ4 2725 aa2.77□□□□□ -1.97
TRDN-204ENST00000542443 SMR3AQ99954 134 aa2.77□□□□□ -1.97
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TRDN-204ENST00000542443 A0A096LNI7 61 aa2.74□□□□□ -1.97
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TRDN-204ENST00000542443 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.74□□□□□ -1.97
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TRDN-204ENST00000542443 LYSTQ99698 3801 aa2.74□□□□□ -1.97
TRDN-204ENST00000542443 DNAH17Q9UFH2 4485 aa2.73□□□□□ -1.97
TRDN-204ENST00000542443 RYR1P21817 5038 aa2.73□□□□□ -1.97
TRDN-204ENST00000542443 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa2.73□□□□□ -1.97
TRDN-204ENST00000542443 DMAC1Q96GE9 116 aa2.73□□□□□ -1.97
TRDN-204ENST00000542443 VWFP04275 2813 aa2.73□□□□□ -1.97
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