RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A1B0GU69 56 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-214ENST00000497648 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-214ENST00000497648 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-214ENST00000497648 Q6ZQY7 126 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-214ENST00000497648 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV2D-28P01615 120 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-214ENST00000497648 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-214ENST00000497648 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-214ENST00000497648 Q8N377 158 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-214ENST00000497648 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-214ENST00000497648 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC00575Q6W349 94 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A087WTM6 91 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-214ENST00000497648 DEFB1P60022 68 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-214ENST00000497648 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-214ENST00000497648 LYSTQ99698 3801 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-214ENST00000497648 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-214ENST00000497648 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-214ENST00000497648 DEFB131AP59861 70 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-214ENST00000497648 Q8IZM0 81 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-214ENST00000497648 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-214ENST00000497648 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-214ENST00000497648 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-214ENST00000497648 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-214ENST00000497648 RYR3Q15413 4870 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-214ENST00000497648 RYR2Q92736 4967 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-214ENST00000497648 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-214ENST00000497648 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-214ENST00000497648 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-214ENST00000497648 DEFB135Q30KP9 77 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A0J9YWU9 116 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-214ENST00000497648 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-214ENST00000497648 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A1W2PNN7 141 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-214ENST00000497648 M0R2N4 97 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-214ENST00000497648 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-214ENST00000497648 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV2-30P06310 120 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC00315P59091 139 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-214ENST00000497648 Q8N9L7 120 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-214ENST00000497648 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-214ENST00000497648 KMT2AQ03164 3969 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-214ENST00000497648 Q96NJ1 140 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-214ENST00000497648 A8MTW9 85 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-214ENST00000497648 DEFB4AO15263 64 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-214ENST00000497648 HRES1P13985 223 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-214ENST00000497648 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-214ENST00000497648 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-214ENST00000497648 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-214ENST00000497648 SPINK13Q1W4C9 94 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-214ENST00000497648 DNAH2Q9P225 4427 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-214ENST00000497648 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-214ENST00000497648 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A0G2JQZ4 141 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM168BA1KXE4 195 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-214ENST00000497648 M0QY20 66 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-214ENST00000497648 ACYP2P14621 99 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-214ENST00000497648 PRR9Q5T870 116 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-214ENST00000497648 LY6G6CO95867 125 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-214ENST00000497648 HTN1P15515 57 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-214ENST00000497648 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-214ENST00000497648 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-214ENST00000497648 DSCR10P59022 87 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-214ENST00000497648 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A1B0GUV1 79 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-214ENST00000497648 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-214ENST00000497648 K7EQZ3 153 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-214ENST00000497648 IGLV6-57P01721 117 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-214ENST00000497648 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-214ENST00000497648 PKHD1P08F94 4074 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-214ENST00000497648 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-214ENST00000497648 SPART-AS1P0CW21 52 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-214ENST00000497648 DEFB130BP0DP73 79 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-214ENST00000497648 DEFB130AP0DP74 79 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-214ENST00000497648 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-214ENST00000497648 HTN3P15516 51 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-214ENST00000497648 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-214ENST00000497648 PKD1P98161 4303 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-214ENST00000497648 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-214ENST00000497648 APLNQ9ULZ1 77 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-214ENST00000497648 R4GN34 69 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-214ENST00000497648 COX6A2Q02221 97 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-214ENST00000497648 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-214ENST00000497648 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-214ENST00000497648 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-214ENST00000497648 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-214ENST00000497648 BIRC6Q9NR09 4857 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A096LPF7 62 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-214ENST00000497648 INE1O15225 51 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms