RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490667.1

SHC1-211, Transcript of SHC adaptor protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SHC1, Length 727 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1-211ENST00000490667 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.76□□□□□ -1.33
SHC1-211ENST00000490667 A0A1B0GVX0 72 aa6.76□□□□□ -1.33
SHC1-211ENST00000490667 J3KT08 172 aa6.76□□□□□ -1.33
SHC1-211ENST00000490667 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SHC1-211ENST00000490667 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.75□□□□□ -1.33
SHC1-211ENST00000490667 C8orf87E5RJ46 101 aa6.75□□□□□ -1.33
SHC1-211ENST00000490667 A0A1B0GW54 56 aa6.74□□□□□ -1.33
SHC1-211ENST00000490667 PDE6GP18545 87 aa6.74□□□□□ -1.33
SHC1-211ENST00000490667 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.73□□□□□ -1.33
SHC1-211ENST00000490667 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.72□□□□□ -1.33
SHC1-211ENST00000490667 C9orf118A6NHY6 69 aa6.71□□□□□ -1.34
SHC1-211ENST00000490667 NDUFB1O75438 58 aa6.71□□□□□ -1.34
SHC1-211ENST00000490667 TAX1BP3O14907 124 aa6.69□□□□□ -1.34
SHC1-211ENST00000490667 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SHC1-211ENST00000490667 A0A1W2PPM0 123 aa6.68□□□□□ -1.34
SHC1-211ENST00000490667 A8MWP4 228 aa6.67□□□□□ -1.34
SHC1-211ENST00000490667 NREPQ16612 68 aa6.66□□□□□ -1.34
SHC1-211ENST00000490667 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.65□□□□□ -1.34
SHC1-211ENST00000490667 H3BT86 120 aa6.65□□□□□ -1.34
SHC1-211ENST00000490667 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.65□□□□□ -1.34
SHC1-211ENST00000490667 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.64□□□□□ -1.35
SHC1-211ENST00000490667 FAM236CP0DP71 79 aa6.64□□□□□ -1.35
SHC1-211ENST00000490667 HRES1P13985 223 aa6.64□□□□□ -1.35
SHC1-211ENST00000490667 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SHC1-211ENST00000490667 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHC1-211ENST00000490667 MTURNQ8N3F0 131 aa6.63□□□□□ -1.35
SHC1-211ENST00000490667 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.63□□□□□ -1.35
SHC1-211ENST00000490667 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.63□□□□□ -1.35
SHC1-211ENST00000490667 PRR15Q8IV56 129 aa6.61□□□□□ -1.35
SHC1-211ENST00000490667 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.61□□□□□ -1.35
SHC1-211ENST00000490667 Q6ZVQ6 151 aa6.6□□□□□ -1.35
SHC1-211ENST00000490667 SPINK7P58062 85 aa6.59□□□□□ -1.35
SHC1-211ENST00000490667 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.59□□□□□ -1.35
SHC1-211ENST00000490667 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.55□□□□□ -1.36
SHC1-211ENST00000490667 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.55□□□□□ -1.36
SHC1-211ENST00000490667 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.54□□□□□ -1.36
SHC1-211ENST00000490667 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.54□□□□□ -1.36
SHC1-211ENST00000490667 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SHC1-211ENST00000490667 K7EQZ3 153 aa6.53□□□□□ -1.36
SHC1-211ENST00000490667 BPY2O14599 106 aa6.53□□□□□ -1.36
SHC1-211ENST00000490667 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SHC1-211ENST00000490667 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.53□□□□□ -1.36
SHC1-211ENST00000490667 hDV103S1A0JD37 113 aa6.51□□□□□ -1.37
SHC1-211ENST00000490667 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.5□□□□□ -1.37
SHC1-211ENST00000490667 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.5□□□□□ -1.37
SHC1-211ENST00000490667 K7EP34 96 aa6.48□□□□□ -1.37
SHC1-211ENST00000490667 NDUFS5O43920 106 aa6.48□□□□□ -1.37
SHC1-211ENST00000490667 PRO0461Q9UI25 63 aa6.48□□□□□ -1.37
SHC1-211ENST00000490667 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.47□□□□□ -1.37
SHC1-211ENST00000490667 MT2AP02795 61 aa6.46□□□□□ -1.38
SHC1-211ENST00000490667 Q8N9L7 120 aa6.45□□□□□ -1.38
SHC1-211ENST00000490667 CASC2Q6XLA1 102 aa6.43□□□□□ -1.38
SHC1-211ENST00000490667 LINC00846Q9NV44 126 aa6.43□□□□□ -1.38
SHC1-211ENST00000490667 UBL5Q9BZL1 73 aa6.42□□□□□ -1.38
SHC1-211ENST00000490667 Q5W150 140 aa6.41□□□□□ -1.38
SHC1-211ENST00000490667 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.41□□□□□ -1.38
SHC1-211ENST00000490667 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.4□□□□□ -1.38
SHC1-211ENST00000490667 MT1FP04733 61 aa6.4□□□□□ -1.38
SHC1-211ENST00000490667 KRTAP10-10P60014 251 aa6.4□□□□□ -1.38
SHC1-211ENST00000490667 HCG22E2RYF7 251 aa6.39□□□□□ -1.39
SHC1-211ENST00000490667 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.38□□□□□ -1.39
SHC1-211ENST00000490667 IGKV2-30P06310 120 aa6.38□□□□□ -1.39
SHC1-211ENST00000490667 F8W1H4 67 aa6.37□□□□□ -1.39
SHC1-211ENST00000490667 CXCL6P80162 114 aa6.35□□□□□ -1.39
SHC1-211ENST00000490667 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.35□□□□□ -1.39
SHC1-211ENST00000490667 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.35□□□□□ -1.39
SHC1-211ENST00000490667 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.35□□□□□ -1.39
SHC1-211ENST00000490667 ETDBQ3ZM63 59 aa6.34□□□□□ -1.39
SHC1-211ENST00000490667 USH2AO75445 5202 aa6.32□□□□□ -1.4
SHC1-211ENST00000490667 LCE2BO14633 110 aa6.3□□□□□ -1.4
SHC1-211ENST00000490667 C4orf26Q17RF5 130 aa6.28□□□□□ -1.4
SHC1-211ENST00000490667 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.24□□□□□ -1.41
SHC1-211ENST00000490667 SSPOA2VEC9 5147 aa6.23□□□□□ -1.41
SHC1-211ENST00000490667 ACYP1P07311 99 aa6.2□□□□□ -1.42
SHC1-211ENST00000490667 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.19□□□□□ -1.42
SHC1-211ENST00000490667 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.19□□□□□ -1.42
SHC1-211ENST00000490667 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.17□□□□□ -1.42
SHC1-211ENST00000490667 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.14□□□□□ -1.43
SHC1-211ENST00000490667 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
SHC1-211ENST00000490667 C5orf47Q569G3 176 aa6.13□□□□□ -1.43
SHC1-211ENST00000490667 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.12□□□□□ -1.43
SHC1-211ENST00000490667 S4R3F8 94 aa6.12□□□□□ -1.43
SHC1-211ENST00000490667 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SHC1-211ENST00000490667 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.11□□□□□ -1.43
SHC1-211ENST00000490667 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
SHC1-211ENST00000490667 CSAG1Q6PB30 78 aa6.09□□□□□ -1.43
SHC1-211ENST00000490667 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.08□□□□□ -1.44
SHC1-211ENST00000490667 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.08□□□□□ -1.44
SHC1-211ENST00000490667 LCA10Q71F78 164 aa6.08□□□□□ -1.44
SHC1-211ENST00000490667 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.07□□□□□ -1.44
SHC1-211ENST00000490667 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.05□□□□□ -1.44
SHC1-211ENST00000490667 UQCRQO14949 82 aa6.05□□□□□ -1.44
SHC1-211ENST00000490667 LINC00643Q86TS7 51 aa6.05□□□□□ -1.44
SHC1-211ENST00000490667 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.04□□□□□ -1.44
SHC1-211ENST00000490667 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.04□□□□□ -1.44
SHC1-211ENST00000490667 A0A1B0GV90 55 aa6.04□□□□□ -1.44
SHC1-211ENST00000490667 A0A087WVE0 104 aa6.02□□□□□ -1.45
SHC1-211ENST00000490667 H0Y9P7 68 aa6.01□□□□□ -1.45
SHC1-211ENST00000490667 ATOX1O00244 68 aa6□□□□□ -1.45
SHC1-211ENST00000490667 LINC00208Q96KT6 92 aa5.93□□□□□ -1.46
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