RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 LCE2CQ5TA81 110 aa10.92□□□□□ -0.66
NELFE-208ENST00000481121 MTURNQ8N3F0 131 aa10.92□□□□□ -0.66
NELFE-208ENST00000481121 J3KT08 172 aa10.91□□□□□ -0.66
NELFE-208ENST00000481121 A0A1B0GVX0 72 aa10.89□□□□□ -0.67
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa10.89□□□□□ -0.67
NELFE-208ENST00000481121 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa10.89□□□□□ -0.67
NELFE-208ENST00000481121 SPCS1Q9Y6A9 102 aa10.88□□□□□ -0.67
NELFE-208ENST00000481121 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa10.87□□□□□ -0.67
NELFE-208ENST00000481121 C8orf87E5RJ46 101 aa10.86□□□□□ -0.67
NELFE-208ENST00000481121 COX6B2Q6YFQ2 88 aa10.84□□□□□ -0.67
NELFE-208ENST00000481121 NDUFB1O75438 58 aa10.82□□□□□ -0.68
NELFE-208ENST00000481121 MT1HP80294 61 aa10.8□□□□□ -0.68
NELFE-208ENST00000481121 A8MWP4 228 aa10.78□□□□□ -0.68
NELFE-208ENST00000481121 NREPQ16612 68 aa10.78□□□□□ -0.68
NELFE-208ENST00000481121 PCP4L1A6NKN8 68 aa10.74□□□□□ -0.69
NELFE-208ENST00000481121 K7EP34 96 aa10.73□□□□□ -0.69
NELFE-208ENST00000481121 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa10.72□□□□□ -0.69
NELFE-208ENST00000481121 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
NELFE-208ENST00000481121 C8orf17Q9NRJ1 99 aa10.71□□□□□ -0.69
NELFE-208ENST00000481121 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa10.68□□□□□ -0.7
NELFE-208ENST00000481121 PRR15Q8IV56 129 aa10.67□□□□□ -0.7
NELFE-208ENST00000481121 PRO0461Q9UI25 63 aa10.67□□□□□ -0.7
NELFE-208ENST00000481121 M0R2T5 61 aa10.66□□□□□ -0.7
NELFE-208ENST00000481121 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
NELFE-208ENST00000481121 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
NELFE-208ENST00000481121 Q6ZVQ6 151 aa10.63□□□□□ -0.71
NELFE-208ENST00000481121 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa10.63□□□□□ -0.71
NELFE-208ENST00000481121 K7EQZ3 153 aa10.61□□□□□ -0.71
NELFE-208ENST00000481121 BPY2O14599 106 aa10.61□□□□□ -0.71
NELFE-208ENST00000481121 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa10.59□□□□□ -0.71
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
NELFE-208ENST00000481121 TMEM254Q8TBM7 123 aa10.56□□□□□ -0.72
NELFE-208ENST00000481121 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
NELFE-208ENST00000481121 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa10.54□□□□□ -0.72
NELFE-208ENST00000481121 FAM236CP0DP71 79 aa10.54□□□□□ -0.72
NELFE-208ENST00000481121 HRES1P13985 223 aa10.54□□□□□ -0.72
NELFE-208ENST00000481121 LORP23490 312 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
NELFE-208ENST00000481121 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa10.53□□□□□ -0.72
NELFE-208ENST00000481121 hDV103S1A0JD37 113 aa10.53□□□□□ -0.72
NELFE-208ENST00000481121 F8W1H4 67 aa10.52□□□□□ -0.73
NELFE-208ENST00000481121 MPLKIPQ8TAP9 179 aa10.51□□□□□ -0.73
NELFE-208ENST00000481121 UBL5Q9BZL1 73 aa10.51□□□□□ -0.73
NELFE-208ENST00000481121 LINC00846Q9NV44 126 aa10.51□□□□□ -0.73
NELFE-208ENST00000481121 SPINK7P58062 85 aa10.49□□□□□ -0.73
NELFE-208ENST00000481121 Q8N9L7 120 aa10.49□□□□□ -0.73
NELFE-208ENST00000481121 NDUFS5O43920 106 aa10.48□□□□□ -0.73
NELFE-208ENST00000481121 ETDBQ3ZM63 59 aa10.46□□□□□ -0.74
NELFE-208ENST00000481121 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
NELFE-208ENST00000481121 WFDC13Q8IUB5 93 aa10.44□□□□□ -0.74
NELFE-208ENST00000481121 CASC2Q6XLA1 102 aa10.42□□□□□ -0.74
NELFE-208ENST00000481121 HCG22E2RYF7 251 aa10.33□□□□□ -0.76
NELFE-208ENST00000481121 CXCL6P80162 114 aa10.29□□□□□ -0.76
NELFE-208ENST00000481121 Q5W150 140 aa10.28□□□□□ -0.76
NELFE-208ENST00000481121 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa10.27□□□□□ -0.77
NELFE-208ENST00000481121 IGKV2-30P06310 120 aa10.27□□□□□ -0.77
NELFE-208ENST00000481121 C7orf65Q6ZTY9 151 aa10.26□□□□□ -0.77
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa10.24□□□□□ -0.77
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa10.23□□□□□ -0.77
NELFE-208ENST00000481121 ACYP1P07311 99 aa10.22□□□□□ -0.77
NELFE-208ENST00000481121 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa10.19□□□□□ -0.78
NELFE-208ENST00000481121 FSIP2Q5CZC0 6907 aa10.17□□□□□ -0.78
NELFE-208ENST00000481121 A0A1B0GV90 55 aa10.15□□□□□ -0.78
NELFE-208ENST00000481121 MT2AP02795 61 aa10.12□□□□□ -0.79
NELFE-208ENST00000481121 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa10.12□□□□□ -0.79
NELFE-208ENST00000481121 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa10.12□□□□□ -0.79
NELFE-208ENST00000481121 CRCT1Q9UGL9 99 aa10.11□□□□□ -0.79
NELFE-208ENST00000481121 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa10.1□□□□□ -0.79
NELFE-208ENST00000481121 C4orf26Q17RF5 130 aa10.05□□□□□ -0.8
NELFE-208ENST00000481121 MT1FP04733 61 aa10.04□□□□□ -0.8
NELFE-208ENST00000481121 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP10-10P60014 251 aa10.01□□□□□ -0.81
NELFE-208ENST00000481121 LINC00643Q86TS7 51 aa9.98□□□□□ -0.81
NELFE-208ENST00000481121 TRAV22A0A0B4J277 110 aa9.95□□□□□ -0.82
NELFE-208ENST00000481121 A0A087WVE0 104 aa9.91□□□□□ -0.82
NELFE-208ENST00000481121 C1orf64Q8NEQ6 169 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-208ENST00000481121 J3QR89 54 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-208ENST00000481121 USH2AO75445 5202 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-208ENST00000481121 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-208ENST00000481121 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-208ENST00000481121 UQCRQO14949 82 aa9.86□□□□□ -0.83
NELFE-208ENST00000481121 S4R3F8 94 aa9.82□□□□□ -0.84
NELFE-208ENST00000481121 H0Y9P7 68 aa9.82□□□□□ -0.84
NELFE-208ENST00000481121 ATOX1O00244 68 aa9.81□□□□□ -0.84
NELFE-208ENST00000481121 LCE2BO14633 110 aa9.81□□□□□ -0.84
NELFE-208ENST00000481121 C5orf47Q569G3 176 aa9.78□□□□□ -0.84
NELFE-208ENST00000481121 LCA10Q71F78 164 aa9.74□□□□□ -0.85
NELFE-208ENST00000481121 SSPOA2VEC9 5147 aa9.73□□□□□ -0.85
NELFE-208ENST00000481121 CSAG1Q6PB30 78 aa9.7□□□□□ -0.86
NELFE-208ENST00000481121 OCR1Q9BZK8 76 aa9.7□□□□□ -0.86
NELFE-208ENST00000481121 LINC00208Q96KT6 92 aa9.66□□□□□ -0.86
NELFE-208ENST00000481121 MP68P56378 58 aa9.66□□□□□ -0.86
NELFE-208ENST00000481121 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.63□□□□□ -0.87
NELFE-208ENST00000481121 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.63□□□□□ -0.87
NELFE-208ENST00000481121 SCGB1A1P11684 91 aa9.59□□□□□ -0.87
NELFE-208ENST00000481121 K7ERU9 68 aa9.58□□□□□ -0.88
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.58□□□□□ -0.88
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms