RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887		K7EP34	96 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SFI1-222	ENST00000478887	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
SFI1-222	ENST00000478887	SIGMAR1	Q99720	223 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SFI1-222	ENST00000478887	IGKV4-1	P06312	121 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SFI1-222	ENST00000478887	PRO0461	Q9UI25	63 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SFI1-222	ENST00000478887	PCOTH	Q58A44	107 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SFI1-222	ENST00000478887	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SFI1-222	ENST00000478887	MUC2	Q02817	5179 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SFI1-222	ENST00000478887		A0A0U1RQV1	116 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SFI1-222	ENST00000478887		Q75L30	129 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SFI1-222	ENST00000478887		J3KT08	172 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SFI1-222	ENST00000478887	DSCR10	P59022	87 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SFI1-222	ENST00000478887	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SFI1-222	ENST00000478887	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SFI1-222	ENST00000478887		A0A1B0GVX0	72 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SFI1-222	ENST00000478887		A8MUU9	505 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SFI1-222	ENST00000478887	LINC00313	P59037	77 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SFI1-222	ENST00000478887	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SFI1-222	ENST00000478887	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SFI1-222	ENST00000478887	C8orf87	E5RJ46	101 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SFI1-222	ENST00000478887	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SFI1-222	ENST00000478887	NREP	Q16612	68 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SFI1-222	ENST00000478887		A8MWP4	228 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SFI1-222	ENST00000478887		F8W1H4	67 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SFI1-222	ENST00000478887	NDUFB1	O75438	58 aa		5	□□□□□ -1.61
SFI1-222	ENST00000478887	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		5	□□□□□ -1.61
SFI1-222	ENST00000478887	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-222	ENST00000478887	ETDB	Q3ZM63	59 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-222	ENST00000478887		Q6ZVQ6	151 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-222	ENST00000478887	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-222	ENST00000478887	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1-222	ENST00000478887	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SFI1-222	ENST00000478887	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SFI1-222	ENST00000478887		K7EQZ3	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SFI1-222	ENST00000478887	BPY2	O14599	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SFI1-222	ENST00000478887		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SFI1-222	ENST00000478887	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SFI1-222	ENST00000478887	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-222	ENST00000478887	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-222	ENST00000478887		A0A1B0GV90	55 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1-222	ENST00000478887	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1-222	ENST00000478887	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SFI1-222	ENST00000478887		H3BS24	57 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1-222	ENST00000478887		Q8N9L7	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFI1-222	ENST00000478887	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFI1-222	ENST00000478887	MT1H	P80294	61 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFI1-222	ENST00000478887	ACYP1	P07311	99 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1-222	ENST00000478887	CXCL6	P80162	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1-222	ENST00000478887	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1-222	ENST00000478887	HRES1	P13985	223 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-222	ENST00000478887	CASC2	Q6XLA1	102 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-222	ENST00000478887	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-222	ENST00000478887	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SFI1-222	ENST00000478887	HCG22	E2RYF7	251 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SFI1-222	ENST00000478887	NDUFS5	O43920	106 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SFI1-222	ENST00000478887	SPINK7	P58062	85 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SFI1-222	ENST00000478887	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1-222	ENST00000478887	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SFI1-222	ENST00000478887		Q5W150	140 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SFI1-222	ENST00000478887	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SFI1-222	ENST00000478887	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SFI1-222	ENST00000478887	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SFI1-222	ENST00000478887	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-222	ENST00000478887		M0R2T5	61 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-222	ENST00000478887	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-222	ENST00000478887	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-222	ENST00000478887	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SFI1-222	ENST00000478887		J3QR89	54 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SFI1-222	ENST00000478887	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SFI1-222	ENST00000478887	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SFI1-222	ENST00000478887	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SFI1-222	ENST00000478887		A0A087WVE0	104 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFI1-222	ENST00000478887	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFI1-222	ENST00000478887	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-222	ENST00000478887	UQCRQ	O14949	82 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1-222	ENST00000478887	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1-222	ENST00000478887		K7ERU9	68 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1-222	ENST00000478887	C4orf26	Q17RF5	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1-222	ENST00000478887	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1-222	ENST00000478887	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SFI1-222	ENST00000478887		H0Y9P7	68 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SFI1-222	ENST00000478887	ATOX1	O00244	68 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SFI1-222	ENST00000478887	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SFI1-222	ENST00000478887	MT2A	P02795	61 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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