RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475184.5

ITGB1-211, Transcript of integrin subunit beta 1, humanhuman

TSL 4

Gene ITGB1, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1-211ENST00000475184 DNAL4O96015 105 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB1-211ENST00000475184 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB1-211ENST00000475184 MDN1Q9NU22 5596 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB1-211ENST00000475184 H3BQ85 93 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGB1-211ENST00000475184 DLEU1O43261 78 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGB1-211ENST00000475184 TRIAP1O43715 76 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGB1-211ENST00000475184 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGB1-211ENST00000475184 KMT2DO14686 5537 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGB1-211ENST00000475184 J3KT08 172 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB1-211ENST00000475184 KRTAP5-9P26371 169 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB1-211ENST00000475184 VPS25Q9BRG1 176 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB1-211ENST00000475184 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB1-211ENST00000475184 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGB1-211ENST00000475184 S100A2P29034 98 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGB1-211ENST00000475184 DSCR8Q96T75 97 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGB1-211ENST00000475184 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB1-211ENST00000475184 MT1BP07438 61 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB1-211ENST00000475184 HIGD1BQ9P298 99 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB1-211ENST00000475184 NDUFB1O75438 58 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGB1-211ENST00000475184 C14orf144Q96I85 54 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB1-211ENST00000475184 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB1-211ENST00000475184 UBE2V1Q13404 147 aa7.22□□□□□ -1.25
ITGB1-211ENST00000475184 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.21□□□□□ -1.26
ITGB1-211ENST00000475184 Q5VV11 94 aa7.21□□□□□ -1.26
ITGB1-211ENST00000475184 CEND1Q8N111 149 aa7.21□□□□□ -1.26
ITGB1-211ENST00000475184 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-211ENST00000475184 KRTAP10-5P60370 271 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGB1-211ENST00000475184 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-211ENST00000475184 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-211ENST00000475184 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-211ENST00000475184 Q6ZVQ6 151 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-211ENST00000475184 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB1-211ENST00000475184 PSMB2P49721 201 aa7.17□□□□□ -1.26
ITGB1-211ENST00000475184 FXYD2P54710 66 aa7.17□□□□□ -1.26
ITGB1-211ENST00000475184 Q6ZQT0 140 aa7.17□□□□□ -1.26
ITGB1-211ENST00000475184 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.16□□□□□ -1.26
ITGB1-211ENST00000475184 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.16□□□□□ -1.26
ITGB1-211ENST00000475184 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-211ENST00000475184 COX6CP09669 75 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-211ENST00000475184 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-211ENST00000475184 C9JAW5 83 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB1-211ENST00000475184 SPATA45Q537H7 98 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB1-211ENST00000475184 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB1-211ENST00000475184 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.09□□□□□ -1.27
ITGB1-211ENST00000475184 K7ERJ3 54 aa7.09□□□□□ -1.27
ITGB1-211ENST00000475184 IGKV2-30P06310 120 aa7.09□□□□□ -1.27
ITGB1-211ENST00000475184 S100A6P06703 90 aa7.09□□□□□ -1.27
ITGB1-211ENST00000475184 C5orf47Q569G3 176 aa7.08□□□□□ -1.28
ITGB1-211ENST00000475184 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
ITGB1-211ENST00000475184 PRR15Q8IV56 129 aa7.07□□□□□ -1.28
ITGB1-211ENST00000475184 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.07□□□□□ -1.28
ITGB1-211ENST00000475184 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.06□□□□□ -1.28
ITGB1-211ENST00000475184 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.05□□□□□ -1.28
ITGB1-211ENST00000475184 VAMP8Q9BV40 100 aa7.05□□□□□ -1.28
ITGB1-211ENST00000475184 NDUFS5O43920 106 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGB1-211ENST00000475184 A0A1B0GW54 56 aa7.01□□□□□ -1.29
ITGB1-211ENST00000475184 C4orf26Q17RF5 130 aa7.01□□□□□ -1.29
ITGB1-211ENST00000475184 BAALC-AS2P0C853 105 aa7□□□□□ -1.29
ITGB1-211ENST00000475184 hDV103S1A0JD37 113 aa6.99□□□□□ -1.29
ITGB1-211ENST00000475184 SPRR2EP22531 72 aa6.98□□□□□ -1.29
ITGB1-211ENST00000475184 S100A1P23297 94 aa6.98□□□□□ -1.29
ITGB1-211ENST00000475184 SPRR2BP35325 72 aa6.98□□□□□ -1.29
ITGB1-211ENST00000475184 SPRR2AP35326 72 aa6.98□□□□□ -1.29
ITGB1-211ENST00000475184 HSD52Q0P140 79 aa6.98□□□□□ -1.29
ITGB1-211ENST00000475184 Q5W150 140 aa6.98□□□□□ -1.29
ITGB1-211ENST00000475184 IMUPQ9GZP8 106 aa6.98□□□□□ -1.29
ITGB1-211ENST00000475184 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.97□□□□□ -1.29
ITGB1-211ENST00000475184 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.96□□□□□ -1.3
ITGB1-211ENST00000475184 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.96□□□□□ -1.3
ITGB1-211ENST00000475184 CSAG1Q6PB30 78 aa6.95□□□□□ -1.3
ITGB1-211ENST00000475184 S4R3F8 94 aa6.95□□□□□ -1.3
ITGB1-211ENST00000475184 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGB1-211ENST00000475184 KLKP1Q107X0 134 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGB1-211ENST00000475184 NREPQ16612 68 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGB1-211ENST00000475184 K7EQZ3 153 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGB1-211ENST00000475184 PDE6GP18545 87 aa6.91□□□□□ -1.3
ITGB1-211ENST00000475184 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.91□□□□□ -1.3
ITGB1-211ENST00000475184 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.91□□□□□ -1.3
ITGB1-211ENST00000475184 LCA10Q71F78 164 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGB1-211ENST00000475184 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGB1-211ENST00000475184 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGB1-211ENST00000475184 ATXN8Q156A1 80 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGB1-211ENST00000475184 HCG22E2RYF7 251 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGB1-211ENST00000475184 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGB1-211ENST00000475184 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGB1-211ENST00000475184 CRIPTQ9P021 101 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGB1-211ENST00000475184 CXCL6P80162 114 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGB1-211ENST00000475184 CASC2Q6XLA1 102 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGB1-211ENST00000475184 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGB1-211ENST00000475184 BPY2O14599 106 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGB1-211ENST00000475184 SPRR2DP22532 72 aa6.75□□□□□ -1.33
ITGB1-211ENST00000475184 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGB1-211ENST00000475184 Q8N9L7 120 aa6.73□□□□□ -1.33
ITGB1-211ENST00000475184 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.73□□□□□ -1.33
ITGB1-211ENST00000475184 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
ITGB1-211ENST00000475184 PYY3Q5JQD4 70 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGB1-211ENST00000475184 MT1XP80297 61 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGB1-211ENST00000475184 KRTAP12-2P59991 146 aa6.61□□□□□ -1.35
ITGB1-211ENST00000475184 LCE3BQ5TA77 95 aa6.61□□□□□ -1.35
ITGB1-211ENST00000475184 A0A087WVE0 104 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.2 ms