RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa0.58□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 SPEGQ15772 3267 aa0.58□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 NDUFA1O15239 70 aa0.58□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 PRLHP81277 87 aa0.58□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 DEFB135Q30KP9 77 aa0.58□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 WFDC10BQ8IUB3 73 aa0.58□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 U3KQA8 63 aa0.58□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa0.58□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 C5orf42Q9H799 3197 aa0.58□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 FAT4Q6V0I7 4981 aa0.58□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 CEP290O15078 2479 aa0.57□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa0.57□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 PHGR1C9JFL3 82 aa0.57□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 M0R2T5 61 aa0.57□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 KAAG1Q9UBP8 84 aa0.57□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 CHD8Q9HCK8 2581 aa0.57□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 RYR3Q15413 4870 aa0.57□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa0.57□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 DUOX1Q9NRD9 1551 aa0.57□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 CFAP54Q96N23 3096 aa0.56□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 DCHS1Q96JQ0 3298 aa0.56□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 CACNA1AO00555 2505 aa0.56□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa0.56□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 AKAP9Q99996 3911 aa0.56□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 WDFY4Q6ZS81 3184 aa0.56□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 LOC400499M0QZD8 3231 aa0.55□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 CD52P31358 61 aa0.55□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 DEFB131AP59861 70 aa0.55□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 LYSTQ99698 3801 aa0.55□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 UNC79Q9P2D8 2635 aa0.55□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 PCLOQ9Y6V0 5065 aa0.55□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 PTPN13Q12923 2485 aa0.55□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 CREBBPQ92793 2442 aa0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 BIRC6Q9NR09 4857 aa0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 OTOGQ6ZRI0 2925 aa0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 DEFB124Q8NES8 71 aa0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 FREM2Q5SZK8 3169 aa0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 NBASA2RRP1 2371 aa0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
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RABGGTB-205ENST00000462042 CHD7Q9P2D1 2997 aa0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 NCOR2Q9Y618 2525 aa0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 SACSQ9NZJ4 4579 aa0.54□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIOO75962 3097 aa0.53□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 FRYQ5TBA9 3013 aa0.53□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 DNAH12Q6ZR08 3092 aa0.53□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 PKD1L2Q7Z442 2459 aa0.53□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 VPS13CQ709C8 3753 aa0.53□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 Q9Y3F1 56 aa0.53□□□□□ -2.32
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RABGGTB-205ENST00000462042 KMT2AQ03164 3969 aa0.53□□□□□ -2.33
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RABGGTB-205ENST00000462042 ITPR1Q14643 2758 aa0.52□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 FRYLO94915 3013 aa0.52□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 TNXBP22105 4242 aa0.52□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa0.52□□□□□ -2.33
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RABGGTB-205ENST00000462042 VPS13AQ96RL7 3174 aa0.52□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 RYR2Q92736 4967 aa0.52□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 EPG5Q9HCE0 2579 aa0.51□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 DMXL1Q9Y485 3027 aa0.51□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 CSMD2Q7Z408 3487 aa0.51□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 HYDINQ4G0P3 5121 aa0.51□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa0.51□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 NF1P21359 2839 aa0.51□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP0.51□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 WNK1Q9H4A3 2382 aa0.51□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
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RABGGTB-205ENST00000462042 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
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RABGGTB-205ENST00000462042 DNAH5Q8TE73 4624 aa0.5□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 KALRNO60229 2985 aa0.5□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 AKAP13Q12802 2813 aa0.5□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 MAST4O15021 2626 aa0.5□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
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RABGGTB-205ENST00000462042 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa0.5□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 NBEAQ8NFP9 2946 aa0.5□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 MUC5ACP98088 5654 aa0.5□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa0.5□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 DNAH9Q9NYC9 4486 aa0.5□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RABGGTB-205ENST00000462042 CEP295Q9C0D2 2601 aa0.5□□□□□ -2.33
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