RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.68□□□□□ -1.02
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0B4J2C4 111 aa8.66□□□□□ -1.02
HOXD12-201ENST00000404162 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.64□□□□□ -1.03
HOXD12-201ENST00000404162 VPS25Q9BRG1 176 aa8.63□□□□□ -1.03
HOXD12-201ENST00000404162 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.63□□□□□ -1.03
HOXD12-201ENST00000404162 J3KT08 172 aa8.61□□□□□ -1.03
HOXD12-201ENST00000404162 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.61□□□□□ -1.03
HOXD12-201ENST00000404162 DSCR8Q96T75 97 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXD12-201ENST00000404162 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.59□□□□□ -1.03
HOXD12-201ENST00000404162 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.59□□□□□ -1.03
HOXD12-201ENST00000404162 TRIAP1O43715 76 aa8.59□□□□□ -1.03
HOXD12-201ENST00000404162 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.59□□□□□ -1.03
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HOXD12-201ENST00000404162 COX8AP10176 69 aa8.58□□□□□ -1.04
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFB1O75438 58 aa8.57□□□□□ -1.04
HOXD12-201ENST00000404162 H3BQ85 93 aa8.56□□□□□ -1.04
HOXD12-201ENST00000404162 SPRR2EP22531 72 aa8.56□□□□□ -1.04
HOXD12-201ENST00000404162 SPRR2BP35325 72 aa8.56□□□□□ -1.04
HOXD12-201ENST00000404162 SPRR2AP35326 72 aa8.56□□□□□ -1.04
HOXD12-201ENST00000404162 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.56□□□□□ -1.04
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa8.54□□□□□ -1.04
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa8.54□□□□□ -1.04
HOXD12-201ENST00000404162 DLEU1O43261 78 aa8.53□□□□□ -1.04
HOXD12-201ENST00000404162 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.53□□□□□ -1.04
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HOXD12-201ENST00000404162 C5orf47Q569G3 176 aa8.51□□□□□ -1.05
HOXD12-201ENST00000404162 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.51□□□□□ -1.05
HOXD12-201ENST00000404162 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.5□□□□□ -1.05
HOXD12-201ENST00000404162 Q6ZQT0 140 aa8.48□□□□□ -1.05
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HOXD12-201ENST00000404162 HIGD1BQ9P298 99 aa8.48□□□□□ -1.05
HOXD12-201ENST00000404162 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
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HOXD12-201ENST00000404162 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.45□□□□□ -1.06
HOXD12-201ENST00000404162 CEND1Q8N111 149 aa8.45□□□□□ -1.06
HOXD12-201ENST00000404162 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD12-201ENST00000404162 IGKV2-30P06310 120 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD12-201ENST00000404162 IMUPQ9GZP8 106 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXD12-201ENST00000404162 FXYD2P54710 66 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXD12-201ENST00000404162 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
HOXD12-201ENST00000404162 PSMB2P49721 201 aa8.41□□□□□ -1.06
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.4□□□□□ -1.06
HOXD12-201ENST00000404162 A6NJY4 79 aa8.4□□□□□ -1.06
HOXD12-201ENST00000404162 C4orf26Q17RF5 130 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXD12-201ENST00000404162 C9JAW5 83 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXD12-201ENST00000404162 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXD12-201ENST00000404162 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXD12-201ENST00000404162 PRR15Q8IV56 129 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXD12-201ENST00000404162 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.36□□□□□ -1.07
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFS5O43920 106 aa8.35□□□□□ -1.07
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HOXD12-201ENST00000404162 CSAG1Q6PB30 78 aa8.31□□□□□ -1.08
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HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.28□□□□□ -1.08
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HOXD12-201ENST00000404162 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXD12-201ENST00000404162 LCA10Q71F78 164 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.23□□□□□ -1.09
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GW54 56 aa8.22□□□□□ -1.09
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HOXD12-201ENST00000404162 S100A6P06703 90 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXD12-201ENST00000404162 K7EQZ3 153 aa8.2□□□□□ -1.1
HOXD12-201ENST00000404162 NREPQ16612 68 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXD12-201ENST00000404162 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.17□□□□□ -1.1
HOXD12-201ENST00000404162 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.17□□□□□ -1.1
HOXD12-201ENST00000404162 VAMP8Q9BV40 100 aa8.17□□□□□ -1.1
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HOXD12-201ENST00000404162 CRIPTQ9P021 101 aa8.13□□□□□ -1.11
HOXD12-201ENST00000404162 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.12□□□□□ -1.11
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HOXD12-201ENST00000404162 MT1XP80297 61 aa8.09□□□□□ -1.11
HOXD12-201ENST00000404162 PDE6GP18545 87 aa8.08□□□□□ -1.12
HOXD12-201ENST00000404162 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.08□□□□□ -1.12
HOXD12-201ENST00000404162 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.07□□□□□ -1.12
HOXD12-201ENST00000404162 S100A1P23297 94 aa8.06□□□□□ -1.12
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.02□□□□□ -1.13
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.02□□□□□ -1.13
HOXD12-201ENST00000404162 CASC2Q6XLA1 102 aa8.01□□□□□ -1.13
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP12-2P59991 146 aa8□□□□□ -1.13
HOXD12-201ENST00000404162 CXCL6P80162 114 aa8□□□□□ -1.13
HOXD12-201ENST00000404162 ATXN8Q156A1 80 aa7.98□□□□□ -1.13
HOXD12-201ENST00000404162 Q8N9L7 120 aa7.97□□□□□ -1.13
HOXD12-201ENST00000404162 BPY2O14599 106 aa7.96□□□□□ -1.14
HOXD12-201ENST00000404162 A0A087WVE0 104 aa7.92□□□□□ -1.14
HOXD12-201ENST00000404162 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
HOXD12-201ENST00000404162 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
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