RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF861PO60384 105 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 GHRHP01286 108 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 LST1O00453 97 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 TCL1BO95988 128 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 MUC17Q685J3 4493 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 TRACP01848 142 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 Q9BRP9 147 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 H3BQ85 93 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 Q6ZQY7 126 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 K7EP34 96 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-209ENST00000590049 H3BMG7 143 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-209ENST00000590049 ERC2-IT1O76042 136 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-209ENST00000590049 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-209ENST00000590049 C9JAW5 83 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-209ENST00000590049 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-209ENST00000590049 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-209ENST00000590049 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1B0GV90 55 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-209ENST00000590049 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-209ENST00000590049 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-209ENST00000590049 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-209ENST00000590049 SPRR4Q96PI1 79 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-209ENST00000590049 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-209ENST00000590049 USH2AO75445 5202 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-209ENST00000590049 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-209ENST00000590049 F8WEM9 126 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-209ENST00000590049 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-209ENST00000590049 H3BT86 120 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-209ENST00000590049 UBE2V1Q13404 147 aa6.82□□□□□ -1.32
CAPNS1-209ENST00000590049 MTURNQ8N3F0 131 aa6.82□□□□□ -1.32
CAPNS1-209ENST00000590049 F8W1H4 67 aa6.81□□□□□ -1.32
CAPNS1-209ENST00000590049 SPRR1BP22528 89 aa6.81□□□□□ -1.32
CAPNS1-209ENST00000590049 Q8N377 158 aa6.81□□□□□ -1.32
CAPNS1-209ENST00000590049 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.81□□□□□ -1.32
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC00483Q53H64 154 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-209ENST00000590049 CRYGAP11844 174 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-209ENST00000590049 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-209ENST00000590049 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-209ENST00000590049 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-209ENST00000590049 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-209ENST00000590049 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1B0GV72 72 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 CDIP1Q9H305 208 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 SMIM29Q86T20 159 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 Q8NBF4 154 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 DSCR8Q96T75 97 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 PRO0461Q9UI25 63 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 MOBPQ13875 183 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 Q6JHZ5 121 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 TEN1Q86WV5 123 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 NEBP20929 6669 aa6.71□□□□□ -1.33
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A087X002 238 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-209ENST00000590049 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-209ENST00000590049 PDE6GP18545 87 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-209ENST00000590049 MT1HP80294 61 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-209ENST00000590049 ETDBQ3ZM63 59 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-209ENST00000590049 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-209ENST00000590049 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-209ENST00000590049 LCE2CQ5TA81 110 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-209ENST00000590049 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-209ENST00000590049 VPS25Q9BRG1 176 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-209ENST00000590049 IGFL1Q6UW32 110 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-209ENST00000590049 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-209ENST00000590049 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-209ENST00000590049 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-209ENST00000590049 CCKP06307 115 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-209ENST00000590049 TPRXLQ17RH7 258 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-209ENST00000590049 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-209ENST00000590049 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-209ENST00000590049 CD164Q04900 197 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-209ENST00000590049 Q6ZQT0 140 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A0G2JQZ4 141 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-209ENST00000590049 J3QR89 54 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-209ENST00000590049 Q6Q795 121 aa6.61□□□□□ -1.35
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