RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558376.5

RABGGTA-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,883 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-204ENST00000558376 SPRR1AP35321 89 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTA-204ENST00000558376 B5MCH6 92 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 PRYO14603 147 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 DNAL4O96015 105 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 Q9BRP9 147 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 PRLHP81277 87 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 ERC2-IT1O76042 136 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 Q6Q795 121 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 Q6ZQY7 126 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 Q6ZRX8 168 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 A0A1B0GX51 115 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 ACYP1P07311 99 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-204ENST00000558376 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-204ENST00000558376 MUC2Q02817 5179 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-204ENST00000558376 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-204ENST00000558376 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-204ENST00000558376 C1orf137Q5JT78 98 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-204ENST00000558376 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-204ENST00000558376 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTA-204ENST00000558376 UBE2AP49459 152 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTA-204ENST00000558376 BCE1O60756 84 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTA-204ENST00000558376 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGGTA-204ENST00000558376 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTA-204ENST00000558376 IGLV7-43P04211 117 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTA-204ENST00000558376 Q8N377 158 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTA-204ENST00000558376 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTA-204ENST00000558376 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTA-204ENST00000558376 IMUPQ9GZP8 106 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTA-204ENST00000558376 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTA-204ENST00000558376 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTA-204ENST00000558376 H0Y9J4 135 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTA-204ENST00000558376 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTA-204ENST00000558376 PRR4Q16378 134 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTA-204ENST00000558376 LINC00643Q86TS7 51 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTA-204ENST00000558376 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTA-204ENST00000558376 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTA-204ENST00000558376 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTA-204ENST00000558376 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF861PO60384 105 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTA-204ENST00000558376 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTA-204ENST00000558376 CCDC179H3BU77 68 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTA-204ENST00000558376 SMIM29Q86T20 159 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTA-204ENST00000558376 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTA-204ENST00000558376 A0A0G2JQZ4 141 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTA-204ENST00000558376 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTA-204ENST00000558376 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTA-204ENST00000558376 A0A0U1RQV1 116 aa6.58□□□□□ -1.36
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RABGGTA-204ENST00000558376 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTA-204ENST00000558376 GHRHP01286 108 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTA-204ENST00000558376 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTA-204ENST00000558376 H3BQ85 93 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTA-204ENST00000558376 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTA-204ENST00000558376 DSCR8Q96T75 97 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTA-204ENST00000558376 MUC17Q685J3 4493 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTA-204ENST00000558376 Q6ZQT0 140 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTA-204ENST00000558376 SPRR4Q96PI1 79 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTA-204ENST00000558376 CCKP06307 115 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTA-204ENST00000558376 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTA-204ENST00000558376 SPRR1BP22528 89 aa6.53□□□□□ -1.36
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RABGGTA-204ENST00000558376 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTA-204ENST00000558376 Q6JHZ5 121 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTA-204ENST00000558376 LINC00846Q9NV44 126 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTA-204ENST00000558376 F8WEM9 126 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTA-204ENST00000558376 ATOX1O00244 68 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTA-204ENST00000558376 UQCRQO14949 82 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTA-204ENST00000558376 A0A087X002 238 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTA-204ENST00000558376 A0A1W2PNM2 257 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTA-204ENST00000558376 LINC00483Q53H64 154 aa6.49□□□□□ -1.37
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RABGGTA-204ENST00000558376 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGGTA-204ENST00000558376 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTA-204ENST00000558376 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RABGGTA-204ENST00000558376 PDE6GP18545 87 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTA-204ENST00000558376 COX7CP15954 63 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTA-204ENST00000558376 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTA-204ENST00000558376 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTA-204ENST00000558376 MOBPQ13875 183 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTA-204ENST00000558376 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTA-204ENST00000558376 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTA-204ENST00000558376 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTA-204ENST00000558376 CRYGAP11844 174 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTA-204ENST00000558376 UBL5Q9BZL1 73 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTA-204ENST00000558376 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTA-204ENST00000558376 Q8NBF4 154 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTA-204ENST00000558376 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.42□□□□□ -1.38
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