RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556077.5

TTC8-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 8, humanhuman

TSL 5

Gene TTC8, Length 1,020 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC8-211ENST00000556077 VAMP8Q9BV40 100 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC8-211ENST00000556077 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC8-211ENST00000556077 DLEU1O43261 78 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC8-211ENST00000556077 COX8AP10176 69 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC8-211ENST00000556077 Q6ZVH6 145 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC8-211ENST00000556077 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 C6orf99Q4VX62 202 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 SPATA45Q537H7 98 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.08□□□□□ -1.28
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TTC8-211ENST00000556077 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.07□□□□□ -1.28
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TTC8-211ENST00000556077 IFITM1P13164 125 aa7.05□□□□□ -1.28
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TTC8-211ENST00000556077 Q6JHZ5 121 aa6.98□□□□□ -1.29
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TTC8-211ENST00000556077 HIST1H4GQ99525 98 aa6.96□□□□□ -1.3
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TTC8-211ENST00000556077 Q96NJ1 140 aa6.92□□□□□ -1.3
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TTC8-211ENST00000556077 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 A6NJY4 79 aa6.89□□□□□ -1.31
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TTC8-211ENST00000556077 A0A0B4J2C4 111 aa6.88□□□□□ -1.31
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TTC8-211ENST00000556077 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC8-211ENST00000556077 LCE2BO14633 110 aa6.82□□□□□ -1.32
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TTC8-211ENST00000556077 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.82□□□□□ -1.32
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TTC8-211ENST00000556077 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.81□□□□□ -1.32
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TTC8-211ENST00000556077 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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