RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa1.15□□□□□ -2.23
CS-232ENST00000552331 ZNF292O60281 2723 aa1.15□□□□□ -2.23
CS-232ENST00000552331 KNL1Q8NG31 2342 aa1.15□□□□□ -2.23
CS-232ENST00000552331 F8P00451 2351 aa1.14□□□□□ -2.23
CS-232ENST00000552331 NDUFA1O15239 70 aa1.14□□□□□ -2.23
CS-232ENST00000552331 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
CS-232ENST00000552331 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa1.13□□□□□ -2.23
CS-232ENST00000552331 ABCA12Q86UK0 2595 aa1.12□□□□□ -2.23
CS-232ENST00000552331 WT1-ASQ06250 92 aa1.12□□□□□ -2.23
CS-232ENST00000552331 TPRP12270 2363 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
CS-232ENST00000552331 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa1.11□□□□□ -2.23
CS-232ENST00000552331 H3BUA1 57 aa1.11□□□□□ -2.23
CS-232ENST00000552331 MUC6Q6W4X9 2439 aa1.1□□□□□ -2.23
CS-232ENST00000552331 IGF2RP11717 2491 aa1.1□□□□□ -2.23
CS-232ENST00000552331 DEFB109BQ30KR1 87 aa1.1□□□□□ -2.23
CS-232ENST00000552331 WFDC10BQ8IUB3 73 aa1.1□□□□□ -2.23
CS-232ENST00000552331 ABCA2Q9BZC7 2435 aa1.09□□□□□ -2.23
CS-232ENST00000552331 KAAG1Q9UBP8 84 aa1.07□□□□□ -2.24
CS-232ENST00000552331 CSPG4Q6UVK1 2322 aa1.06□□□□□ -2.24
CS-232ENST00000552331 PCNX1Q96RV3 2341 aa1.06□□□□□ -2.24
CS-232ENST00000552331 AKAP6Q13023 2319 aa1.05□□□□□ -2.24
CS-232ENST00000552331 DEFB131AP59861 70 aa1.04□□□□□ -2.24
CS-232ENST00000552331 PRLHP81277 87 aa1.04□□□□□ -2.24
CS-232ENST00000552331 DEFB106AQ8N104 65 aa1.04□□□□□ -2.24
CS-232ENST00000552331 S4R3F8 94 aa1.04□□□□□ -2.24
CS-232ENST00000552331 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa1.03□□□□□ -2.24
CS-232ENST00000552331 REV3LO60673 3130 aa1.03□□□□□ -2.24
CS-232ENST00000552331 SPTA1P02549 2419 aa1.03□□□□□ -2.25
CS-232ENST00000552331 BDP1A6H8Y1 2624 aa1.02□□□□□ -2.25
CS-232ENST00000552331 CHD9Q3L8U1 2897 aa1.02□□□□□ -2.25
CS-232ENST00000552331 SPINK6Q6UWN8 80 aa1.02□□□□□ -2.25
CS-232ENST00000552331 PIEZO1Q92508 2521 aa1.02□□□□□ -2.25
CS-232ENST00000552331 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa1.02□□□□□ -2.25
CS-232ENST00000552331 CRCT1Q9UGL9 99 aa1.02□□□□□ -2.25
CS-232ENST00000552331 CELSR2Q9HCU4 2923 aa1.02□□□□□ -2.25
CS-232ENST00000552331 DSPP15924 2871 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
CS-232ENST00000552331 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
CS-232ENST00000552331 TRANK1O15050 2925 aa1□□□□□ -2.25
CS-232ENST00000552331 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa0.99□□□□□ -2.25
CS-232ENST00000552331 ATRQ13535 2644 aa0.99□□□□□ -2.25
CS-232ENST00000552331 CEP290O15078 2479 aa0.98□□□□□ -2.25
CS-232ENST00000552331 H0YGG7 62 aa0.98□□□□□ -2.25
CS-232ENST00000552331 CSMD3Q7Z407 3707 aa0.98□□□□□ -2.25
CS-232ENST00000552331 UNC79Q9P2D8 2635 aa0.97□□□□□ -2.25
CS-232ENST00000552331 CHD6Q8TD26 2715 aa0.95□□□□□ -2.26
CS-232ENST00000552331 SPINK1P00995 79 aa0.95□□□□□ -2.26
CS-232ENST00000552331 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
CS-232ENST00000552331 DEFB135Q30KP9 77 aa0.95□□□□□ -2.26
CS-232ENST00000552331 ANK2Q01484 3957 aa0.94□□□□□ -2.26
CS-232ENST00000552331 VWFP04275 2813 aa0.93□□□□□ -2.26
CS-232ENST00000552331 TENM4Q6N022 2769 aa0.93□□□□□ -2.26
CS-232ENST00000552331 NCOR1O75376 2440 aa0.93□□□□□ -2.26
CS-232ENST00000552331 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
CS-232ENST00000552331 HECTD1Q9ULT8 2610 aa0.93□□□□□ -2.26
CS-232ENST00000552331 PKD1L2Q7Z442 2459 aa0.92□□□□□ -2.26
CS-232ENST00000552331 M0R2T5 61 aa0.92□□□□□ -2.26
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CS-232ENST00000552331 A8MTW9 85 aa0.89□□□□□ -2.27
CS-232ENST00000552331 U3KQA8 63 aa0.89□□□□□ -2.27
CS-232ENST00000552331 GPR98Q8WXG9 6306 aa0.89□□□□□ -2.27
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CS-232ENST00000552331 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
CS-232ENST00000552331 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa0.88□□□□□ -2.27
CS-232ENST00000552331 AKAP13Q12802 2813 aa0.88□□□□□ -2.27
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CS-232ENST00000552331 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
CS-232ENST00000552331 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa0.87□□□□□ -2.27
CS-232ENST00000552331 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
CS-232ENST00000552331 BSNQ9UPA5 3926 aa0.87□□□□□ -2.27
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CS-232ENST00000552331 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
CS-232ENST00000552331 PTPN13Q12923 2485 aa0.86□□□□□ -2.27
CS-232ENST00000552331 NBASA2RRP1 2371 aa0.85□□□□□ -2.27
CS-232ENST00000552331 FAT2Q9NYQ8 4349 aa0.85□□□□□ -2.27
CS-232ENST00000552331 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa0.85□□□□□ -2.27
CS-232ENST00000552331 CLPSL2Q6UWE3 100 aa0.85□□□□□ -2.27
CS-232ENST00000552331 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.85□□□□□ -2.27
CS-232ENST00000552331 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa0.85□□□□□ -2.27
CS-232ENST00000552331 APCP25054 2843 aa0.85□□□□□ -2.27
CS-232ENST00000552331 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa0.85□□□□□ -2.27
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CS-232ENST00000552331 OTOGQ6ZRI0 2925 aa0.82□□□□□ -2.28
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CS-232ENST00000552331 TOMM7Q9P0U1 55 aa0.81□□□□□ -2.28
CS-232ENST00000552331 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.81□□□□□ -2.28
CS-232ENST00000552331 TNXBP22105 4242 aa0.8□□□□□ -2.28
CS-232ENST00000552331 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
CS-232ENST00000552331 NOTCH1P46531 2555 aa0.79□□□□□ -2.28
CS-232ENST00000552331 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP0.78□□□□□ -2.28
CS-232ENST00000552331 PRM1P04553 51 aa0.78□□□□□ -2.28
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