RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529170.5

MKNK1-222, Transcript of MAP kinase interacting serine/threonine kinase 1, human

TSL 4

Gene MKNK1, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKNK1-222	ENST00000529170	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MKNK1-222	ENST00000529170		A0A0B4J2C4	111 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MKNK1-222	ENST00000529170	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MKNK1-222	ENST00000529170		M0R143	59 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MKNK1-222	ENST00000529170	BATF	Q16520	125 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MKNK1-222	ENST00000529170	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MKNK1-222	ENST00000529170	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MKNK1-222	ENST00000529170	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MKNK1-222	ENST00000529170	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MKNK1-222	ENST00000529170	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MKNK1-222	ENST00000529170		Q9BRP9	147 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MKNK1-222	ENST00000529170	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MKNK1-222	ENST00000529170	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MKNK1-222	ENST00000529170		K7ERJ3	54 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MKNK1-222	ENST00000529170	COX6C	P09669	75 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MKNK1-222	ENST00000529170	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MKNK1-222	ENST00000529170	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MKNK1-222	ENST00000529170	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MKNK1-222	ENST00000529170	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MKNK1-222	ENST00000529170	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170		H0YGX0	51 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170	MT1H	P80294	61 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170	DNAL4	O96015	105 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170	MOBP	Q13875	183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170		F8WEM9	126 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170	TRIAP1	O43715	76 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170	XP32	Q5T750	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170		Q6ZQY7	126 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170		Q8NBF4	154 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170	FABP2	P12104	132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MKNK1-222	ENST00000529170	SPINK1	P00995	79 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170		Q8N377	158 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170		A0A1B0GX51	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	SPRR1B	P22528	89 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170		H3BUT2	72 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170		A0A1B0GV72	72 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170		H3BQ85	93 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MKNK1-222	ENST00000529170	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170		H3BMG7	143 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170	LST1	O00453	97 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170	TRAC	P01848	142 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170	TCL1B	O95988	128 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170		Q6JHZ5	121 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170	USH2A	O75445	5202 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170		A0A1W2PPM0	123 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170		C9JAW5	83 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170	IGFL1	Q6UW32	110 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170	VPS25	Q9BRG1	176 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170		M0R2T5	61 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MKNK1-222	ENST00000529170	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.46	□□□□□ -1.7
MKNK1-222	ENST00000529170	CD164	Q04900	197 aa		4.46	□□□□□ -1.7
MKNK1-222	ENST00000529170	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.45	□□□□□ -1.7
MKNK1-222	ENST00000529170	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.44	□□□□□ -1.7
MKNK1-222	ENST00000529170	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.43	□□□□□ -1.7
MKNK1-222	ENST00000529170	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.43	□□□□□ -1.7
MKNK1-222	ENST00000529170	CCK	P06307	115 aa		4.43	□□□□□ -1.7
MKNK1-222	ENST00000529170	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.43	□□□□□ -1.7
MKNK1-222	ENST00000529170	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7

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