RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 PDE6DO43924 150 aa-3.37□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 DPM2O94777 84 aa-3.37□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 SNX1Q13596 522 aa-3.37□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-3.37□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC150Q8NCX0 1101 aa-3.37□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 CHP1Q99653 195 aa-3.37□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 TXLNGYQ9BZA5 131 aa-3.37□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 RERGLQ9H628 205 aa-3.37□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 ST20Q9HBF5 79 aa-3.37□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 HSPB11Q9Y547 144 aa-3.37□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-3.37□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 A0A0U1RQV5 110 aa-3.38□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 SNRPGP15A8MWD9 76 aa-3.38□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 PSPHP1O15172 72 aa-3.38□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 CYB5AP00167 134 aa-3.38□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 LINC00614P0C842 121 aa-3.38□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 ANXA3P12429 323 aa-3.38□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 H2BFSP57053 126 aa-3.38□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 MYL7Q01449 175 aa-3.38□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 AARDQ4LEZ3 155 aa-3.38□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP-3.38□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa-3.38□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-3.39□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC182A6NF36 153 aa-3.39□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 IGIPA6NJ69 53 aa-3.39□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 LINC00587B1AMM8 73 aa-3.39□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 UMAD1C9J7I0 102 aa-3.39□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 GAS8O95995 478 aa-3.39□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 C10orf107Q8IVU9 208 aa-3.39□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa-3.39□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa-3.39□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 A0A1B0GUT8 65 aa-3.4□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 E9PLD3 99 aa-3.4□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 SMKR1H3BMG3 65 aa-3.4□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 NAPAP54920 295 aa-3.4□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 NAA20P61599 178 aa-3.4□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 GNG3P63215 75 aa-3.4□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 PSPHP78330 225 aa-3.4□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP-3.4□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 RCN2Q14257 317 aa-3.4□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP-3.4□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 LSMEM1Q8N8F7 131 aa-3.4□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM35BQ8NCS4 154 aa-3.4□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 SDHAF3Q9NRP4 125 aa-3.4□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa-3.4□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP-3.4□□□□□ -2.95
SNORD54-201ENST00000459159 LINC00862A6NCI5 91 aa-3.41□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa-3.41□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP-3.41□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 CBX3Q13185 183 aa-3.41□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP-3.41□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 CEP19Q96LK0 163 aa-3.41□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 DPY30Q9C005 99 aa-3.41□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 SAR1AQ9NR31 198 aa-3.41□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-3.42□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 FABP5P3A8MUU1 101 aa-3.42□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 CASQ1P31415 396 aa-3.42□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 GSTA3Q16772 222 aa-3.42□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 SPATA24Q86W54 205 aa-3.42□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 BORCS7Q96B45 105 aa-3.42□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 MYH16Q9H6N6 1097 aa-3.42□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 ENY2Q9NPA8 101 aa-3.42□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-3.43□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 SRP19P09132 144 aaKnown RBP-3.43□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 MYL9P24844 172 aa-3.43□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 G0S2P27469 103 aa-3.43□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 GNG5P63218 68 aa-3.43□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 RGS1Q08116 209 aa-3.43□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 PPP1R7Q15435 360 aa-3.43□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 MIR17HGQ75NE6 70 aa-3.43□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 FUNDC1Q8IVP5 155 aa-3.43□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 C10orf53Q8N6V4 93 aa-3.43□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-3.44□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 FABP7O15540 132 aa-3.44□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 PAEPP09466 180 aa-3.44□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 SVIPQ8NHG7 77 aa-3.44□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 S100ZQ8WXG8 99 aa-3.44□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 FIS1Q9Y3D6 152 aa-3.44□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 SAR1BQ9Y6B6 198 aa-3.44□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa-3.45□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 CORTO00230 105 aa-3.45□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 TRIAP1O43715 76 aa-3.45□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 FTH1P02794 183 aa-3.45□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 COPZ1P61923 177 aa-3.45□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP-3.45□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 SMIM7Q9BQ49 75 aa-3.45□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 ERICH2A1L162 156 aa-3.46□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 CALUO43852 315 aaPredicted RBP-3.46□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 HIST1H2BKO60814 126 aa-3.46□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 HDGFP51858 240 aaKnown RBP-3.46□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 HIST1H2BCP62807 126 aa-3.46□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-3.46□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 PET117Q6UWS5 81 aa-3.46□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 HIST3H2BBQ8N257 126 aa-3.46□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 BLOC1S6Q9UL45 172 aa-3.46□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 TPRKBQ9Y3C4 175 aa-3.46□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 KCNE3Q9Y6H6 103 aa-3.46□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 SMCO3A2RU48 225 aa-3.47□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC179H3BU77 68 aa-3.47□□□□□ -2.96
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC175P0C221 793 aa-3.47□□□□□ -2.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms