RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428098.5

DDX39B-208, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 817 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-208ENST00000428098 J3QQQ9 107 aa5.55□□□□□ -1.52
DDX39B-208ENST00000428098 APOC3P02656 99 aa5.55□□□□□ -1.52
DDX39B-208ENST00000428098 SVBPQ8N300 66 aa5.54□□□□□ -1.52
DDX39B-208ENST00000428098 IFI27L1Q96BM0 104 aa5.54□□□□□ -1.52
DDX39B-208ENST00000428098 SEC11CQ9BY50 192 aa5.54□□□□□ -1.52
DDX39B-208ENST00000428098 LST1O00453 97 aa5.52□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 SNAPINO95295 136 aa5.52□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 DSCR10P59022 87 aa5.52□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.52□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 SPANXCQ9NY87 97 aa5.52□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 A0A0J9YXY3 114 aa5.51□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 MT1BP07438 61 aa5.51□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.51□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.5□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 SPRR2EP22531 72 aa5.5□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 SPRR2BP35325 72 aa5.5□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 SPRR2AP35326 72 aa5.5□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 LINC00518Q8N0U6 118 aa5.5□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 NMUP48645 174 aa5.49□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 CLEC2BQ92478 149 aa5.49□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 KRTAP10-5P60370 271 aa5.48□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 LITAFQ99732 161 aa5.48□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 A0A1B0GWB2 263 aa5.47□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 F8WEM9 126 aa5.47□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 Q6JHZ5 121 aa5.47□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 MTURNQ8N3F0 131 aa5.47□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
DDX39B-208ENST00000428098 COX19Q49B96 90 aa5.46□□□□□ -1.54
DDX39B-208ENST00000428098 H3BS24 57 aa5.45□□□□□ -1.54
DDX39B-208ENST00000428098 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.45□□□□□ -1.54
DDX39B-208ENST00000428098 H0Y8G0 127 aa5.44□□□□□ -1.54
DDX39B-208ENST00000428098 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.44□□□□□ -1.54
DDX39B-208ENST00000428098 S100PP25815 95 aa5.43□□□□□ -1.54
DDX39B-208ENST00000428098 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.42□□□□□ -1.54
DDX39B-208ENST00000428098 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.42□□□□□ -1.54
DDX39B-208ENST00000428098 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.41□□□□□ -1.54
DDX39B-208ENST00000428098 COLCA2A8K830 154 aa5.39□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 SERF1AO75920 110 aa5.39□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 LINC00313P59037 77 aa5.39□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 HERVK_113P61574 105 aa5.39□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.39□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.38□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 A4D1N5 150 aa5.38□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 PLNP26678 52 aa5.38□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 SPINK7P58062 85 aa5.38□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.38□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF815PA8K554 130 aa5.37□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 H3BUT2 72 aa5.36□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 TIMM17BO60830 172 aa5.36□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 DPM2O94777 84 aa5.36□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 Q5VV11 94 aa5.36□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 YPEL4Q96NS1 127 aa5.36□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.36□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 A0A1W2PNM2 257 aa5.35□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 A6NDN8 102 aa5.35□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.35□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 Q6ZQY7 126 aa5.35□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa5.34□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 E9PLD3 99 aa5.34□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 IGKCP01834 107 aa5.34□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.34□□□□□ -1.55
DDX39B-208ENST00000428098 S100A6P06703 90 aa5.33□□□□□ -1.56
DDX39B-208ENST00000428098 LINC00575Q6W349 94 aa5.33□□□□□ -1.56
DDX39B-208ENST00000428098 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.33□□□□□ -1.56
DDX39B-208ENST00000428098 A0A087WSZ3 146 aa5.31□□□□□ -1.56
DDX39B-208ENST00000428098 SPRR2DP22532 72 aa5.31□□□□□ -1.56
DDX39B-208ENST00000428098 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.31□□□□□ -1.56
DDX39B-208ENST00000428098 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.31□□□□□ -1.56
DDX39B-208ENST00000428098 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.3□□□□□ -1.56
DDX39B-208ENST00000428098 SIGMAR1Q99720 223 aa5.3□□□□□ -1.56
DDX39B-208ENST00000428098 HSBP1O75506 76 aa5.29□□□□□ -1.56
DDX39B-208ENST00000428098 LEPROTL1O95214 131 aa5.29□□□□□ -1.56
DDX39B-208ENST00000428098 TRGC2P03986 189 aa5.29□□□□□ -1.56
DDX39B-208ENST00000428098 hADV29S1A0JD25 119 aa5.28□□□□□ -1.56
DDX39B-208ENST00000428098 LCE4AQ5TA78 99 aa5.28□□□□□ -1.56
DDX39B-208ENST00000428098 TEN1Q86WV5 123 aa5.28□□□□□ -1.56
DDX39B-208ENST00000428098 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.27□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.27□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 HIST1H2BKO60814 126 aa5.26□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 HIST1H2BJP06899 126 aa5.26□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 FABP4P15090 132 aa5.26□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 HIST1H2BOP23527 126 aa5.26□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 HIST1H2BBP33778 126 aa5.26□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 HIST1H2BDP58876 126 aa5.26□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 LINC00310P59036 64 aa5.26□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 HIST1H2BCP62807 126 aa5.26□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.26□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.26□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.26□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.26□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.26□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 IGKV4-1P06312 121 aa5.25□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 S100A2P29034 98 aa5.24□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 VAMP3Q15836 100 aa5.23□□□□□ -1.57
DDX39B-208ENST00000428098 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms